More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1508 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2213  arginyl-tRNA synthetase  58.6 
 
 		 555 aa  674    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0288  arginyl-tRNA synthetase  57.83 
 
 		 559 aa  638    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.124809 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1508  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 558 aa  1152    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.818041  normal  0.873479 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2837  arginyl-tRNA synthetase  59.75 
 
 		 555 aa  677    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0222286 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0271  arginyl-tRNA synthetase  60.47 
 
 		 558 aa  689    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1008  arginyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 		 569 aa  532  1e-150  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0216  arginyl-tRNA synthetase  50.75 
 
 		 558 aa  512  1e-144  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1739  arginyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 		 567 aa  498  1e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0568  arginyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 566 aa  410  1e-113  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.078202  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1102  arginyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 		 574 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1633  arginyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 566 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0268  arginyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 566 aa  396  1e-109  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.107833  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1291  arginyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 591 aa  385  1e-106  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.456077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3171  arginyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 595 aa  384  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0350  arginyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 		 569 aa  379  1e-104  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2012  arginyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 583 aa  366  1e-100  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.750372  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1420  arginyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 		 600 aa  352  1e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.435817  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0562  arginyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 550 aa  344  2e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0169  arginyl-tRNA synthetase  36.03 
 
 		 602 aa  336  7.999999999999999e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0564  arginyl-tRNA synthetase  31.57 
 
 		 635 aa  256  8e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  31.83 
 
 		 566 aa  247  4.9999999999999997e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0438  arginyl-tRNA synthetase  33.27 
 
 		 601 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2451  arginyl-tRNA synthetase  31.66 
 
 		 612 aa  234  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1036  arginyl-tRNA synthetase  29.72 
 
 		 628 aa  233  9e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475054 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0329  arginyl-tRNA synthetase  30.19 
 
 		 613 aa  225  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1017  arginyl-tRNA synthetase  31.35 
 
 		 630 aa  224  4.9999999999999996e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.341311 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1715  arginyl-tRNA synthetase  30.6 
 
 		 619 aa  223  7e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  30.81 
 
 		 589 aa  222  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  30.93 
 
 		 589 aa  221  3.9999999999999997e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1577  arginyl-tRNA synthetase  31.11 
 
 		 635 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502048  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  30.11 
 
 		 562 aa  219  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  29.93 
 
 		 562 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  29.93 
 
 		 562 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  30.11 
 
 		 562 aa  217  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  29.74 
 
 		 562 aa  217  5e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  30.11 
 
 		 562 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 		 586 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1659  arginyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 		 543 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.826444  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  28.47 
 
 		 563 aa  213  9e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  29.01 
 
 		 562 aa  211  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  29.57 
 
 		 562 aa  209  8e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  29.2 
 
 		 562 aa  209  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  29.38 
 
 		 562 aa  208  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2169  arginyl-tRNA synthetase  28.31 
 
 		 585 aa  207  3e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0109  arginyl-tRNA synthetase  29.75 
 
 		 562 aa  207  4e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0124  arginyl-tRNA synthetase  29.75 
 
 		 562 aa  207  5e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  28.28 
 
 		 564 aa  207  5e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0586  arginyl-tRNA synthetase  29.88 
 
 		 632 aa  207  5e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000562405 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  30.65 
 
 		 565 aa  206  6e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1846  arginyl-tRNA synthetase  28.74 
 
 		 625 aa  205  2e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  30.47 
 
 		 565 aa  204  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1756  arginyl-tRNA synthetase  30.11 
 
 		 630 aa  204  3e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0324309  hitchhiker  0.00414873 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  28.67 
 
 		 586 aa  203  7e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0466  arginyl-tRNA synthetase  28.42 
 
 		 564 aa  202  9e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.795792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  29.35 
 
 		 574 aa  202  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  29.48 
 
 		 553 aa  202  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0686  arginyl-tRNA synthetase  27.57 
 
 		 628 aa  201  3e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  30.7 
 
 		 584 aa  201  3.9999999999999996e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1486  arginyl-tRNA synthetase  28.6 
 
 		 550 aa  200  6e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0186  arginyl-tRNA synthetase  28.82 
 
 		 597 aa  200  7e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2678  arginyl-tRNA synthetase  28.97 
 
 		 592 aa  199  7.999999999999999e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0077  arginyl-tRNA synthetase  29.17 
 
 		 586 aa  199  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0441  arginyl-tRNA synthetase  28.32 
 
 		 629 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2109  arginyl-tRNA synthetase  29.17 
 
 		 592 aa  198  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.513959  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  30.13 
 
 		 565 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0267  arginyl-tRNA synthetase  30.4 
 
 		 597 aa  196  8.000000000000001e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  29.72 
 
 		 590 aa  195  2e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  32.45 
 
 		 559 aa  195  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0410  arginyl-tRNA synthetase  28.67 
 
 		 594 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0430  arginyl-tRNA synthetase  28.67 
 
 		 594 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  25.41 
 
 		 571 aa  194  5e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02918  arginyl-tRNA synthetase  28.93 
 
 		 562 aa  194  5e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  27 
 
 		 566 aa  193  7e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  28.32 
 
 		 551 aa  192  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1997  arginyl-tRNA synthetase  29.14 
 
 		 594 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0084  arginyl-tRNA synthetase  29.14 
 
 		 594 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.72933  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0592  arginyl-tRNA synthetase  29.14 
 
 		 594 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597736  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3099  arginyl-tRNA synthetase  29.14 
 
 		 594 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2291  arginyl-tRNA synthetase  29.14 
 
 		 594 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0188  arginyl-tRNA synthetase  29.27 
 
 		 594 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1359  arginyl-tRNA synthetase  28.88 
 
 		 578 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0039  arginyl-tRNA synthetase  29.8 
 
 		 599 aa  191  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285018  normal  0.0776701 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1535  arginyl-tRNA synthetase  27.56 
 
 		 624 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1620  arginyl-tRNA synthetase  28.45 
 
 		 562 aa  190  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010963  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  28.08 
 
 		 551 aa  189  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1577  arginyl-tRNA synthetase  27.51 
 
 		 621 aa  188  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.879493  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  28.16 
 
 		 563 aa  188  2e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0473  arginyl-tRNA synthetase  29.62 
 
 		 596 aa  188  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.274692 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4135  arginyl-tRNA synthetase  27.66 
 
 		 591 aa  186  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0027  arginyl-tRNA synthetase  29.23 
 
 		 585 aa  184  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  28.5 
 
 		 551 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0378  arginyl-tRNA synthetase  26.59 
 
 		 581 aa  182  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05910  arginyl-tRNA synthetase  27.37 
 
 		 592 aa  182  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0385  arginyl-tRNA synthetase  29.27 
 
 		 598 aa  182  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603012  normal  0.077689 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1807  arginyl-tRNA synthetase  27.7 
 
 		 576 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.426497  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  29.79 
 
 		 561 aa  182  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2456  arginyl-tRNA synthetase  28.12 
 
 		 598 aa  182  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4230  arginyl-tRNA synthetase  26.8 
 
 		 561 aa  181  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.228794 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  28.7 
 
 		 556 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0269  arginyl-tRNA synthetase  28.73 
 
 		 576 aa  181  4e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>