More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0288 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0288  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 559 aa  1148    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.124809 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2213  arginyl-tRNA synthetase  63.86 
 
 		 555 aa  751    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2837  arginyl-tRNA synthetase  60.18 
 
 		 555 aa  674    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0222286 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1508  arginyl-tRNA synthetase  57.83 
 
 		 558 aa  652    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.818041  normal  0.873479 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0271  arginyl-tRNA synthetase  65.3 
 
 		 558 aa  753    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0216  arginyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 		 558 aa  522  1e-147  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1739  arginyl-tRNA synthetase  49.82 
 
 		 567 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1008  arginyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 		 569 aa  496  1e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1102  arginyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 574 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0568  arginyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 566 aa  398  1e-109  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.078202  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1633  arginyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 566 aa  396  1e-109  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0268  arginyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 566 aa  394  1e-108  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.107833  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0350  arginyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 569 aa  388  1e-106  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3171  arginyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 		 595 aa  365  1e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1420  arginyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 600 aa  348  1e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.435817  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2012  arginyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 583 aa  344  2.9999999999999997e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.750372  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1291  arginyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 		 591 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.456077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0562  arginyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 		 550 aa  341  2e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0169  arginyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 		 602 aa  327  3e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0438  arginyl-tRNA synthetase  33.08 
 
 		 601 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2451  arginyl-tRNA synthetase  32.56 
 
 		 612 aa  253  9.000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0564  arginyl-tRNA synthetase  32.8 
 
 		 635 aa  248  2e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1036  arginyl-tRNA synthetase  31.89 
 
 		 628 aa  242  1e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475054 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0329  arginyl-tRNA synthetase  32.59 
 
 		 613 aa  237  4e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1846  arginyl-tRNA synthetase  31.75 
 
 		 625 aa  233  8.000000000000001e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1017  arginyl-tRNA synthetase  31.66 
 
 		 630 aa  233  9e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.341311 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1715  arginyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 		 619 aa  231  3e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0686  arginyl-tRNA synthetase  30.19 
 
 		 628 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0267  arginyl-tRNA synthetase  30.7 
 
 		 597 aa  221  3e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1577  arginyl-tRNA synthetase  30.46 
 
 		 635 aa  218  2e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1756  arginyl-tRNA synthetase  31.05 
 
 		 630 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0324309  hitchhiker  0.00414873 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0586  arginyl-tRNA synthetase  30.42 
 
 		 632 aa  217  4e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000562405 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  29.14 
 
 		 589 aa  214  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  28.9 
 
 		 589 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0607  arginyl-tRNA synthetase  29.73 
 
 		 585 aa  211  3e-53  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.872641  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0039  arginyl-tRNA synthetase  30.14 
 
 		 599 aa  210  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285018  normal  0.0776701 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0441  arginyl-tRNA synthetase  30.27 
 
 		 629 aa  209  8e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  30.38 
 
 		 584 aa  207  6e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 		 590 aa  205  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0109  arginyl-tRNA synthetase  29.77 
 
 		 562 aa  204  3e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0124  arginyl-tRNA synthetase  29.77 
 
 		 562 aa  204  3e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  29.84 
 
 		 562 aa  204  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2318  arginyl-tRNA synthetase  28.65 
 
 		 593 aa  203  6e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.291854 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0084  arginyl-tRNA synthetase  31.41 
 
 		 594 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.72933  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0592  arginyl-tRNA synthetase  31.41 
 
 		 594 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597736  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1997  arginyl-tRNA synthetase  31.41 
 
 		 594 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0410  arginyl-tRNA synthetase  31.41 
 
 		 594 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0430  arginyl-tRNA synthetase  31.41 
 
 		 594 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2291  arginyl-tRNA synthetase  31.41 
 
 		 594 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3099  arginyl-tRNA synthetase  31.41 
 
 		 594 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0145  arginyl-tRNA synthetase  31.29 
 
 		 596 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0137  arginyl-tRNA synthetase  31.29 
 
 		 596 aa  201  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0385  arginyl-tRNA synthetase  31.94 
 
 		 598 aa  200  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603012  normal  0.077689 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  30.61 
 
 		 565 aa  199  9e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2410  arginyl-tRNA synthetase  32.51 
 
 		 560 aa  199  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000917803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  27.96 
 
 		 566 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4230  arginyl-tRNA synthetase  29.75 
 
 		 561 aa  198  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.228794 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0188  arginyl-tRNA synthetase  29.48 
 
 		 594 aa  197  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0186  arginyl-tRNA synthetase  28.67 
 
 		 597 aa  196  6e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  29.02 
 
 		 574 aa  196  7e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2304  arginyl-tRNA synthetase  30.69 
 
 		 561 aa  196  7e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0307018  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2831  arginyl-tRNA synthetase  31.01 
 
 		 593 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1486  arginyl-tRNA synthetase  27.57 
 
 		 550 aa  195  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0096  arginyl-tRNA synthetase  29.98 
 
 		 602 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2678  arginyl-tRNA synthetase  28.5 
 
 		 592 aa  195  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1434  arginyl-tRNA synthetase  31.11 
 
 		 569 aa  195  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0988806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  29.74 
 
 		 565 aa  193  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0077  arginyl-tRNA synthetase  27.47 
 
 		 586 aa  194  5e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  26.55 
 
 		 563 aa  193  7e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0355  arginyl-tRNA synthetase  31.24 
 
 		 594 aa  193  7e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2109  arginyl-tRNA synthetase  27.41 
 
 		 592 aa  193  8e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.513959  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0349  arginyl-tRNA synthetase  29.85 
 
 		 579 aa  192  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.87333 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0170  arginyl-tRNA synthetase  29.85 
 
 		 579 aa  192  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0127  arginyl-tRNA synthetase  28.85 
 
 		 595 aa  192  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2968  arginyl-tRNA synthetase  30.66 
 
 		 593 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1650  arginyl-tRNA synthetase  29.68 
 
 		 546 aa  191  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2934  arginyl-tRNA synthetase  31.59 
 
 		 593 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  27.59 
 
 		 562 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2305  arginyl-tRNA synthetase  31.59 
 
 		 593 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2919  arginyl-tRNA synthetase  31.59 
 
 		 593 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  28.85 
 
 		 551 aa  191  4e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  27.22 
 
 		 562 aa  191  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1686  arginyl-tRNA synthetase  29.45 
 
 		 575 aa  191  4e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1577  arginyl-tRNA synthetase  27.86 
 
 		 621 aa  191  4e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.879493  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  27.04 
 
 		 562 aa  190  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02918  arginyl-tRNA synthetase  28.9 
 
 		 562 aa  190  5e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0343  arginyl-tRNA synthetase  28.22 
 
 		 577 aa  190  7e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.401675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  27.22 
 
 		 562 aa  189  8e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0473  arginyl-tRNA synthetase  29.83 
 
 		 596 aa  189  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.274692 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  26.62 
 
 		 566 aa  189  9e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  27.87 
 
 		 551 aa  189  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6262  arginyl-tRNA synthetase  31.41 
 
 		 593 aa  189  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  28.5 
 
 		 556 aa  189  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0287  arginyl-tRNA synthetase  30.87 
 
 		 600 aa  188  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0332  arginyl-tRNA synthetase  27.76 
 
 		 567 aa  188  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.960888  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  29.26 
 
 		 559 aa  188  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0632  arginyl-tRNA synthetase  30.41 
 
 		 564 aa  188  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2169  arginyl-tRNA synthetase  27.9 
 
 		 585 aa  187  4e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2774  arginyl-tRNA synthetase  29.48 
 
 		 611 aa  187  4e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.744463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  29.82 
 
 		 551 aa  187  5e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>