More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1434 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  78.03 
 
 		 568 aa  932    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02918  arginyl-tRNA synthetase  56.21 
 
 		 562 aa  641    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  56.21 
 
 		 562 aa  647    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1434  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 569 aa  1172    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0988806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2304  arginyl-tRNA synthetase  76.87 
 
 		 561 aa  909    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0307018  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  61.85 
 
 		 556 aa  692    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0820  arginyl-tRNA synthetase  59.5 
 
 		 561 aa  674    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0474084  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0602  arginyl-tRNA synthetase  59.33 
 
 		 561 aa  673    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.154913  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1137  arginyl-tRNA synthetase  70.04 
 
 		 564 aa  823    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0701665  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1019  arginyl-tRNA synthetase  70.62 
 
 		 563 aa  823    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.637999  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0109  arginyl-tRNA synthetase  54.26 
 
 		 562 aa  629  1e-179  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2782  arginyl-tRNA synthetase  54.98 
 
 		 557 aa  627  1e-178  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.535695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0124  arginyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 		 562 aa  625  1e-178  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0153  arginyl-tRNA synthetase  57.54 
 
 		 561 aa  619  1e-176  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0188  arginyl-tRNA synthetase  56.07 
 
 		 594 aa  621  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3701  arginyl-tRNA synthetase  57.76 
 
 		 558 aa  620  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0385  arginyl-tRNA synthetase  54.65 
 
 		 598 aa  620  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603012  normal  0.077689 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2291  arginyl-tRNA synthetase  55.44 
 
 		 594 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3099  arginyl-tRNA synthetase  55.44 
 
 		 594 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0084  arginyl-tRNA synthetase  55.44 
 
 		 594 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.72933  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0592  arginyl-tRNA synthetase  55.44 
 
 		 594 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597736  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2831  arginyl-tRNA synthetase  54.42 
 
 		 593 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1997  arginyl-tRNA synthetase  55.44 
 
 		 594 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2968  arginyl-tRNA synthetase  54.42 
 
 		 593 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0430  arginyl-tRNA synthetase  55.44 
 
 		 594 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0355  arginyl-tRNA synthetase  55.61 
 
 		 594 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0410  arginyl-tRNA synthetase  55.44 
 
 		 594 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4490  arginyl-tRNA synthetase  54.6 
 
 		 561 aa  609  1e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.703488 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0096  arginyl-tRNA synthetase  52.08 
 
 		 602 aa  609  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6262  arginyl-tRNA synthetase  54.15 
 
 		 593 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0414  arginyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 		 569 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.872884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0473  arginyl-tRNA synthetase  53.99 
 
 		 596 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.274692 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2934  arginyl-tRNA synthetase  54.15 
 
 		 593 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2305  arginyl-tRNA synthetase  54.15 
 
 		 593 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2919  arginyl-tRNA synthetase  54.15 
 
 		 593 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0573  arginyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 		 569 aa  604  1.0000000000000001e-171  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4230  arginyl-tRNA synthetase  54.8 
 
 		 561 aa  603  1.0000000000000001e-171  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.228794 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0127  arginyl-tRNA synthetase  54.24 
 
 		 595 aa  601  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0773  arginyl-tRNA synthetase  56.22 
 
 		 565 aa  601  1e-170  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4245  arginyl-tRNA synthetase  53.78 
 
 		 596 aa  601  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0461  arginyl-tRNA synthetase  55.27 
 
 		 561 aa  600  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185336  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0332  arginyl-tRNA synthetase  54.34 
 
 		 567 aa  592  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.960888  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0343  arginyl-tRNA synthetase  54.34 
 
 		 577 aa  592  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.401675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0137  arginyl-tRNA synthetase  52.25 
 
 		 596 aa  589  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0145  arginyl-tRNA synthetase  52.25 
 
 		 596 aa  589  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  52.29 
 
 		 554 aa  580  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  52.64 
 
 		 554 aa  578  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0669  arginyl-tRNA synthetase  53.79 
 
 		 565 aa  579  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0287  arginyl-tRNA synthetase  52.22 
 
 		 600 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1686  arginyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 		 575 aa  562  1.0000000000000001e-159  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0742  arginyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 		 554 aa  533  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000856279  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1977  arginyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 575 aa  533  1e-150  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 		 556 aa  508  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 556 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 		 556 aa  489  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 		 556 aa  489  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 		 556 aa  485  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 		 556 aa  487  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 		 556 aa  487  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 		 556 aa  485  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 		 556 aa  487  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 		 557 aa  487  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 		 556 aa  487  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 		 556 aa  484  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 556 aa  483  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 		 570 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 		 561 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 		 556 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 584 aa  463  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 553 aa  465  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1486  arginyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 		 550 aa  464  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2410  arginyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 560 aa  464  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000917803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 586 aa  462  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0247  arginyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 		 587 aa  459  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0358001  normal  0.157381 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2181  arginyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 563 aa  462  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.264732  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 551 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 		 551 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 589 aa  455  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 		 553 aa  458  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 		 553 aa  458  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 589 aa  452  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 		 551 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0050  arginyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 564 aa  450  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2109  arginyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 592 aa  451  1e-125  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.513959  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0077  arginyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 586 aa  451  1e-125  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 		 559 aa  447  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0648  arginyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 		 559 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0541152  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 551 aa  444  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 551 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0285  arginyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 564 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0318968  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0170  arginyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 579 aa  435  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0349  arginyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 579 aa  435  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.87333 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2456  arginyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 598 aa  432  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2431  arginyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 598 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146297  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 		 586 aa  431  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1723  arginyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 546 aa  430  1e-119  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0198  arginyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 592 aa  431  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3183  arginyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 561 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000169325  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2343  arginyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 598 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 559 aa  430  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>