More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2318 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0267  arginyl-tRNA synthetase  55.02 
 
 		 597 aa  689    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0251  arginyl-tRNA synthetase  58.22 
 
 		 592 aa  693    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05910  arginyl-tRNA synthetase  58.15 
 
 		 592 aa  702    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2678  arginyl-tRNA synthetase  56.64 
 
 		 592 aa  691    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0186  arginyl-tRNA synthetase  57.6 
 
 		 597 aa  692    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0599  arginyl-tRNA synthetase  56.78 
 
 		 596 aa  686    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0039  arginyl-tRNA synthetase  54.04 
 
 		 599 aa  674    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285018  normal  0.0776701 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2318  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 593 aa  1211    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.291854 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1577  arginyl-tRNA synthetase  58.68 
 
 		 621 aa  692    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.879493  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6433  arginyl-tRNA synthetase  51.87 
 
 		 642 aa  635    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.490682  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 590 aa  469  1.0000000000000001e-131  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0607  arginyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 585 aa  377  1e-103  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.872641  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0438  arginyl-tRNA synthetase  31.99 
 
 		 601 aa  267  5e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  33.13 
 
 		 566 aa  263  8.999999999999999e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  31.48 
 
 		 565 aa  255  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  31.31 
 
 		 565 aa  252  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1535  arginyl-tRNA synthetase  29.88 
 
 		 624 aa  250  6e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  29.72 
 
 		 565 aa  249  9e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  29.38 
 
 		 563 aa  249  1e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  29.88 
 
 		 562 aa  248  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  29.15 
 
 		 565 aa  248  3e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  28.79 
 
 		 563 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  29.39 
 
 		 562 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  29.54 
 
 		 562 aa  243  6e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  29.91 
 
 		 562 aa  243  6e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  29.54 
 
 		 562 aa  243  6e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  29.36 
 
 		 562 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  31.67 
 
 		 562 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0466  arginyl-tRNA synthetase  29.6 
 
 		 564 aa  239  8e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.795792  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  31.26 
 
 		 562 aa  238  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  30.07 
 
 		 564 aa  236  7e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  28.64 
 
 		 562 aa  233  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  28.66 
 
 		 574 aa  232  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  29.03 
 
 		 566 aa  231  4e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2236  arginyl-tRNA synthetase  30.45 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000339277  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1620  arginyl-tRNA synthetase  30.99 
 
 		 562 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010963  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1270  arginyl-tRNA synthetase  28.91 
 
 		 562 aa  220  5e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000463651  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  29.02 
 
 		 640 aa  220  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0562  arginyl-tRNA synthetase  28.7 
 
 		 550 aa  218  2.9999999999999998e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2213  arginyl-tRNA synthetase  28.52 
 
 		 555 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1309  arginyl-tRNA synthetase  30.04 
 
 		 613 aa  208  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.925397  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 		 571 aa  207  5e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4135  arginyl-tRNA synthetase  30.32 
 
 		 591 aa  206  9e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0899  arginyl-tRNA synthetase  28.48 
 
 		 566 aa  206  1e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0249713  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0271  arginyl-tRNA synthetase  27.81 
 
 		 558 aa  204  4e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3171  arginyl-tRNA synthetase  26.39 
 
 		 595 aa  203  8e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3319  arginyl-tRNA synthetase  30.57 
 
 		 575 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2837  arginyl-tRNA synthetase  26.83 
 
 		 555 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0222286 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01310  arginine-tRNA ligase, putative  31.24 
 
 		 622 aa  201  5e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0173932  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1633  arginyl-tRNA synthetase  28.93 
 
 		 566 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0568  arginyl-tRNA synthetase  28.74 
 
 		 566 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.078202  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1215  arginyl-tRNA synthetase  26.67 
 
 		 563 aa  196  1e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0564  arginyl-tRNA synthetase  28.6 
 
 		 635 aa  196  1e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0288  arginyl-tRNA synthetase  28.65 
 
 		 559 aa  194  3e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.124809 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0169  arginyl-tRNA synthetase  26.37 
 
 		 602 aa  194  4e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1102  arginyl-tRNA synthetase  28.72 
 
 		 574 aa  192  1e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4156  arginyl-tRNA synthetase  29.03 
 
 		 581 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.204707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3151  arginyl-tRNA synthetase  28.2 
 
 		 585 aa  190  5.999999999999999e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2705  arginyl-tRNA synthetase  28.63 
 
 		 598 aa  190  7e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0268  arginyl-tRNA synthetase  28.49 
 
 		 566 aa  189  8e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.107833  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1008  arginyl-tRNA synthetase  30.04 
 
 		 569 aa  189  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1291  arginyl-tRNA synthetase  25.89 
 
 		 591 aa  189  1e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.456077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38727  arginyl-tRNA synthetase  28.07 
 
 		 603 aa  188  3e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.908762 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3474  arginyl-tRNA synthetase  26.41 
 
 		 580 aa  186  8e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387689  normal  0.108328 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0333  arginyl-tRNA synthetase  28.05 
 
 		 572 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0269  arginyl-tRNA synthetase  26.71 
 
 		 576 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0329  arginyl-tRNA synthetase  28.73 
 
 		 613 aa  182  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1508  arginyl-tRNA synthetase  27.5 
 
 		 558 aa  181  4e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.818041  normal  0.873479 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02786  arginyl-tRNA synthetase  28.12 
 
 		 576 aa  178  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8944  Arginine--tRNA ligase  29.05 
 
 		 584 aa  178  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1337  arginyl-tRNA synthetase  28.27 
 
 		 577 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014051 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0350  arginyl-tRNA synthetase  28.34 
 
 		 569 aa  177  4e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0216  arginyl-tRNA synthetase  25.18 
 
 		 558 aa  177  5e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2064  arginyl-tRNA synthetase  28.27 
 
 		 577 aa  177  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.10003 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2442  arginyl-tRNA synthetase  27.38 
 
 		 577 aa  177  6e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1213  arginyl-tRNA synthetase  28.27 
 
 		 577 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2124  arginyl-tRNA synthetase  28.27 
 
 		 577 aa  176  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  hitchhiker  0.0000003636 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2012  arginyl-tRNA synthetase  27.05 
 
 		 583 aa  176  9e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.750372  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2069  arginyl-tRNA synthetase  28.27 
 
 		 577 aa  176  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205082 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2451  arginyl-tRNA synthetase  27.06 
 
 		 612 aa  176  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02071  arginyl-tRNA synthetase  27.13 
 
 		 604 aa  176  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06368  arginyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G14030)  26.28 
 
 		 650 aa  175  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.908063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02051  arginyl-tRNA synthetase  27.68 
 
 		 604 aa  176  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0189  arginyl-tRNA synthetase  27.8 
 
 		 604 aa  175  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.177771  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1715  arginyl-tRNA synthetase  26.53 
 
 		 619 aa  175  1.9999999999999998e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4133  arginyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 		 576 aa  176  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0006  arginyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 582 aa  175  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1739  arginyl-tRNA synthetase  28.87 
 
 		 567 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1420  arginyl-tRNA synthetase  26.68 
 
 		 600 aa  174  3.9999999999999995e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.435817  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2108  arginyl-tRNA synthetase  28.08 
 
 		 577 aa  174  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1310  arginyl-tRNA synthetase  28.08 
 
 		 577 aa  174  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363287 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2613  arginyl-tRNA synthetase  28.08 
 
 		 577 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253751 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01847  arginyl-tRNA synthetase  28.08 
 
 		 577 aa  173  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1764  arginyl-tRNA synthetase  28.08 
 
 		 577 aa  173  6.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01836  hypothetical protein  28.08 
 
 		 577 aa  173  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1017  arginyl-tRNA synthetase  26.71 
 
 		 630 aa  173  1e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.341311 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004100  arginyl-tRNA synthetase  27.62 
 
 		 577 aa  172  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000862961  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1756  arginyl-tRNA synthetase  27.89 
 
 		 577 aa  171  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0153  arginyl-tRNA synthetase  27.89 
 
 		 572 aa  171  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4427  arginyl-tRNA synthetase  25.76 
 
 		 581 aa  171  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>