More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0267 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0267  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 597 aa  1229    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0186  arginyl-tRNA synthetase  55.69 
 
 		 597 aa  669    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05910  arginyl-tRNA synthetase  52.73 
 
 		 592 aa  658    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0251  arginyl-tRNA synthetase  53.34 
 
 		 592 aa  655    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2318  arginyl-tRNA synthetase  55.02 
 
 		 593 aa  689    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.291854 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1577  arginyl-tRNA synthetase  53.47 
 
 		 621 aa  633  1e-180  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.879493  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0039  arginyl-tRNA synthetase  53.02 
 
 		 599 aa  634  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285018  normal  0.0776701 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2678  arginyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 		 592 aa  627  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0599  arginyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 		 596 aa  618  1e-176  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6433  arginyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 		 642 aa  566  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.490682  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 590 aa  466  9.999999999999999e-131  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0607  arginyl-tRNA synthetase  36.47 
 
 		 585 aa  392  1e-108  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.872641  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0438  arginyl-tRNA synthetase  32.01 
 
 		 601 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1535  arginyl-tRNA synthetase  31.15 
 
 		 624 aa  270  7e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  31.72 
 
 		 574 aa  263  8e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  29.59 
 
 		 566 aa  256  7e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  29.06 
 
 		 565 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  29.43 
 
 		 565 aa  246  8e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  29.43 
 
 		 565 aa  246  9e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  28.87 
 
 		 566 aa  246  9.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  30.09 
 
 		 565 aa  243  5e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 562 aa  239  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0564  arginyl-tRNA synthetase  31.16 
 
 		 635 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  29.48 
 
 		 563 aa  235  2.0000000000000002e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  27.66 
 
 		 562 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  27.78 
 
 		 562 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  27.44 
 
 		 562 aa  233  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  27.61 
 
 		 562 aa  233  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  27.61 
 
 		 562 aa  233  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0466  arginyl-tRNA synthetase  28.1 
 
 		 564 aa  232  1e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.795792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  27.32 
 
 		 562 aa  233  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  26.98 
 
 		 562 aa  230  4e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  29 
 
 		 564 aa  230  5e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  28.92 
 
 		 563 aa  230  6e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  28.69 
 
 		 640 aa  226  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1270  arginyl-tRNA synthetase  28.74 
 
 		 562 aa  223  9.999999999999999e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000463651  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  27.06 
 
 		 562 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0333  arginyl-tRNA synthetase  29.32 
 
 		 572 aa  218  2e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0899  arginyl-tRNA synthetase  27.74 
 
 		 566 aa  216  8e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0249713  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2837  arginyl-tRNA synthetase  29.06 
 
 		 555 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0222286 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2169  arginyl-tRNA synthetase  27.38 
 
 		 585 aa  212  1e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2213  arginyl-tRNA synthetase  29.62 
 
 		 555 aa  213  1e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0288  arginyl-tRNA synthetase  30.7 
 
 		 559 aa  212  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.124809 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1620  arginyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 		 562 aa  211  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010963  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1739  arginyl-tRNA synthetase  28.83 
 
 		 567 aa  209  8e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0562  arginyl-tRNA synthetase  29.29 
 
 		 550 aa  209  1e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2236  arginyl-tRNA synthetase  28.39 
 
 		 433 aa  209  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000339277  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1309  arginyl-tRNA synthetase  28 
 
 		 613 aa  208  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.925397  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3474  arginyl-tRNA synthetase  28.02 
 
 		 580 aa  208  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387689  normal  0.108328 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1017  arginyl-tRNA synthetase  28.1 
 
 		 630 aa  207  4e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.341311 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  26.73 
 
 		 571 aa  206  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4135  arginyl-tRNA synthetase  27.59 
 
 		 591 aa  204  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0269  arginyl-tRNA synthetase  28.08 
 
 		 576 aa  203  8e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1215  arginyl-tRNA synthetase  27.95 
 
 		 563 aa  202  9.999999999999999e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1008  arginyl-tRNA synthetase  28.16 
 
 		 569 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0550  arginyl-tRNA synthetase  29.06 
 
 		 581 aa  199  9e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259334  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0216  arginyl-tRNA synthetase  28.88 
 
 		 558 aa  199  9e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0271  arginyl-tRNA synthetase  27.3 
 
 		 558 aa  199  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3845  arginyl-tRNA synthetase  28.38 
 
 		 581 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0495  arginyl-tRNA synthetase  28.38 
 
 		 581 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3762  arginyl-tRNA synthetase  28.55 
 
 		 581 aa  197  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0761225  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0498  arginyl-tRNA synthetase  28.38 
 
 		 581 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0474  arginyl-tRNA synthetase  28.38 
 
 		 581 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0378  arginyl-tRNA synthetase  28.52 
 
 		 581 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1633  arginyl-tRNA synthetase  29.73 
 
 		 566 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4123  arginyl-tRNA synthetase  28.72 
 
 		 581 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0568  arginyl-tRNA synthetase  30.5 
 
 		 566 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.078202  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0456  arginyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 		 581 aa  196  7e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3496  arginyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 		 581 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1508  arginyl-tRNA synthetase  30.4 
 
 		 558 aa  196  9e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.818041  normal  0.873479 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0443  arginyl-tRNA synthetase  28.45 
 
 		 581 aa  196  9e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4134  arginyl-tRNA synthetase  28.68 
 
 		 577 aa  196  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440291  hitchhiker  0.000000042149 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0441  arginyl-tRNA synthetase  30.06 
 
 		 629 aa  196  1e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3673  arginyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 		 581 aa  196  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0153  arginyl-tRNA synthetase  28.52 
 
 		 572 aa  195  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4427  arginyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 		 581 aa  194  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3319  arginyl-tRNA synthetase  27.98 
 
 		 575 aa  193  7e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0268  arginyl-tRNA synthetase  29.81 
 
 		 566 aa  192  1e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.107833  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1577  arginyl-tRNA synthetase  30.65 
 
 		 635 aa  192  1e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2705  arginyl-tRNA synthetase  28.34 
 
 		 598 aa  192  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0533  arginyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 		 581 aa  192  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.142076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3357  arginyl-tRNA synthetase  26.92 
 
 		 581 aa  190  8e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38727  arginyl-tRNA synthetase  27.39 
 
 		 603 aa  189  9e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.908762 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0146  arginyl-tRNA synthetase  28.26 
 
 		 572 aa  187  6e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3779  arginyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 		 581 aa  186  8e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.580214  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4133  arginyl-tRNA synthetase  26.86 
 
 		 576 aa  184  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3151  arginyl-tRNA synthetase  28.99 
 
 		 585 aa  184  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1756  arginyl-tRNA synthetase  28.88 
 
 		 630 aa  183  6e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0324309  hitchhiker  0.00414873 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3171  arginyl-tRNA synthetase  27.07 
 
 		 595 aa  184  6e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4156  arginyl-tRNA synthetase  28.76 
 
 		 581 aa  183  7e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.204707  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01847  arginyl-tRNA synthetase  27.48 
 
 		 577 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1764  arginyl-tRNA synthetase  27.48 
 
 		 577 aa  181  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01836  hypothetical protein  27.48 
 
 		 577 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1756  arginyl-tRNA synthetase  27.48 
 
 		 577 aa  181  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0189  arginyl-tRNA synthetase  28.03 
 
 		 604 aa  182  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.177771  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0586  arginyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 632 aa  182  2e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000562405 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2613  arginyl-tRNA synthetase  27.48 
 
 		 577 aa  182  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253751 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1310  arginyl-tRNA synthetase  27.32 
 
 		 577 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363287 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2169  arginyl-tRNA synthetase  27.32 
 
 		 577 aa  180  5.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02786  arginyl-tRNA synthetase  28.89 
 
 		 576 aa  180  5.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>