More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0586 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0441  arginyl-tRNA synthetase  74.88 
 
 
629 aa  981    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1756  arginyl-tRNA synthetase  73.73 
 
 
630 aa  1003    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0324309  hitchhiker  0.00414873 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1577  arginyl-tRNA synthetase  78.32 
 
 
635 aa  1054    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502048  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0586  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
632 aa  1280    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000562405 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1017  arginyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 
630 aa  532  1e-150  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.341311 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0564  arginyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 
635 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1715  arginyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 
619 aa  365  2e-99  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1846  arginyl-tRNA synthetase  36.39 
 
 
625 aa  335  2e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2213  arginyl-tRNA synthetase  31.57 
 
 
555 aa  234  5e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0216  arginyl-tRNA synthetase  33.77 
 
 
558 aa  233  7.000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1739  arginyl-tRNA synthetase  31.17 
 
 
567 aa  230  5e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0271  arginyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 
558 aa  229  2e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1008  arginyl-tRNA synthetase  31.54 
 
 
569 aa  225  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2451  arginyl-tRNA synthetase  31.47 
 
 
612 aa  215  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1291  arginyl-tRNA synthetase  29.34 
 
 
591 aa  214  4.9999999999999996e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.456077  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2012  arginyl-tRNA synthetase  29.55 
 
 
583 aa  214  5.999999999999999e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.750372  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2837  arginyl-tRNA synthetase  29.43 
 
 
555 aa  209  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0222286 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0568  arginyl-tRNA synthetase  31.12 
 
 
566 aa  207  4e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.078202  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0288  arginyl-tRNA synthetase  30.31 
 
 
559 aa  207  6e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.124809 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1508  arginyl-tRNA synthetase  29.88 
 
 
558 aa  207  6e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.818041  normal  0.873479 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3171  arginyl-tRNA synthetase  28.5 
 
 
595 aa  206  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0329  arginyl-tRNA synthetase  30.82 
 
 
613 aa  204  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24923  predicted protein  27.98 
 
 
652 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.321104  normal  0.342415 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1036  arginyl-tRNA synthetase  28.94 
 
 
628 aa  201  3e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475054 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1633  arginyl-tRNA synthetase  30.74 
 
 
566 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0268  arginyl-tRNA synthetase  30.74 
 
 
566 aa  197  3e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.107833  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1102  arginyl-tRNA synthetase  28.85 
 
 
574 aa  195  2e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  27.78 
 
 
565 aa  188  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  28.84 
 
 
640 aa  187  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  26.62 
 
 
566 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0350  arginyl-tRNA synthetase  28.06 
 
 
569 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05910  arginyl-tRNA synthetase  27.74 
 
 
592 aa  183  7e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0267  arginyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
597 aa  182  2e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  26.7 
 
 
574 aa  182  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0186  arginyl-tRNA synthetase  26.27 
 
 
597 aa  181  2.9999999999999997e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1309  arginyl-tRNA synthetase  28.06 
 
 
613 aa  180  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.925397  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  27.83 
 
 
590 aa  178  2e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  27.21 
 
 
565 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0899  arginyl-tRNA synthetase  25.99 
 
 
566 aa  174  5e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0249713  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  27.39 
 
 
565 aa  174  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  25.56 
 
 
565 aa  172  1e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  25.22 
 
 
566 aa  173  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0438  arginyl-tRNA synthetase  33.95 
 
 
601 aa  171  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0562  arginyl-tRNA synthetase  33.15 
 
 
550 aa  170  8e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  25.42 
 
 
564 aa  169  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0443  arginyl-tRNA synthetase  27.84 
 
 
581 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0251  arginyl-tRNA synthetase  26.55 
 
 
592 aa  163  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1577  arginyl-tRNA synthetase  26.07 
 
 
621 aa  162  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.879493  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  27.05 
 
 
562 aa  161  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0039  arginyl-tRNA synthetase  26.61 
 
 
599 aa  161  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285018  normal  0.0776701 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2379  arginyl-tRNA synthetase  24.91 
 
 
579 aa  160  8e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222047  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1535  arginyl-tRNA synthetase  24.78 
 
 
624 aa  159  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  26.88 
 
 
562 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0632  arginyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 
564 aa  159  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0466  arginyl-tRNA synthetase  25.04 
 
 
564 aa  159  1e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.795792  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  25.04 
 
 
562 aa  159  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  25.41 
 
 
571 aa  158  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  26.7 
 
 
562 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  26.88 
 
 
562 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1420  arginyl-tRNA synthetase  30.87 
 
 
600 aa  157  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.435817  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  26.88 
 
 
562 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  26.53 
 
 
562 aa  157  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2318  arginyl-tRNA synthetase  26.95 
 
 
593 aa  157  8e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.291854 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1661  arginyl-tRNA synthetase  25.89 
 
 
599 aa  155  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  24.49 
 
 
563 aa  155  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1110  arginyl-tRNA synthetase  26.05 
 
 
582 aa  154  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  26.75 
 
 
562 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38727  arginyl-tRNA synthetase  26.76 
 
 
603 aa  154  7e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.908762 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  26.47 
 
 
563 aa  153  7e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  27.63 
 
 
561 aa  153  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01368  arginyl-tRNA synthetase  25.89 
 
 
577 aa  152  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4135  arginyl-tRNA synthetase  25.93 
 
 
591 aa  152  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0333  arginyl-tRNA synthetase  25.83 
 
 
572 aa  152  2e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0686  arginyl-tRNA synthetase  25.67 
 
 
628 aa  151  3e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06368  arginyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G14030)  26.64 
 
 
650 aa  151  4e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.908063  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0169  arginyl-tRNA synthetase  29.34 
 
 
602 aa  150  7e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2791  arginyl-tRNA synthetase  23.77 
 
 
576 aa  150  7e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.263184 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2613  arginyl-tRNA synthetase  24.68 
 
 
577 aa  150  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253751 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2124  arginyl-tRNA synthetase  24.51 
 
 
577 aa  150  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  hitchhiker  0.0000003636 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2069  arginyl-tRNA synthetase  24.51 
 
 
577 aa  150  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205082 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1971  arginyl-tRNA synthetase  24.84 
 
 
577 aa  150  9e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01847  arginyl-tRNA synthetase  24.68 
 
 
577 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1764  arginyl-tRNA synthetase  24.68 
 
 
577 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2173  arginyl-tRNA synthetase  25.19 
 
 
576 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01836  hypothetical protein  24.68 
 
 
577 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6433  arginyl-tRNA synthetase  25.05 
 
 
642 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.490682  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  25.36 
 
 
589 aa  149  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  25.18 
 
 
589 aa  148  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1310  arginyl-tRNA synthetase  24.52 
 
 
577 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.363287 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1337  arginyl-tRNA synthetase  24.34 
 
 
577 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014051 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3357  arginyl-tRNA synthetase  25.19 
 
 
581 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1213  arginyl-tRNA synthetase  24.34 
 
 
577 aa  148  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1756  arginyl-tRNA synthetase  24.52 
 
 
577 aa  148  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2169  arginyl-tRNA synthetase  27.95 
 
 
585 aa  148  3e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2169  arginyl-tRNA synthetase  24.52 
 
 
577 aa  148  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2064  arginyl-tRNA synthetase  24.34 
 
 
577 aa  148  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.10003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2678  arginyl-tRNA synthetase  24.81 
 
 
592 aa  147  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2155  arginyl-tRNA synthetase  23.58 
 
 
576 aa  147  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0808745  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2108  arginyl-tRNA synthetase  25.38 
 
 
577 aa  147  9e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4134  arginyl-tRNA synthetase  25.09 
 
 
577 aa  146  9e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440291  hitchhiker  0.000000042149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>