More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2678 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_05910  arginyl-tRNA synthetase  55.8 
 
 		 592 aa  667    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0251  arginyl-tRNA synthetase  57.14 
 
 		 592 aa  668    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2678  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 592 aa  1218    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0039  arginyl-tRNA synthetase  63.11 
 
 		 599 aa  791    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285018  normal  0.0776701 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1577  arginyl-tRNA synthetase  60.37 
 
 		 621 aa  731    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.879493  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0599  arginyl-tRNA synthetase  57.21 
 
 		 596 aa  714    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2318  arginyl-tRNA synthetase  56.64 
 
 		 593 aa  691    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.291854 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0186  arginyl-tRNA synthetase  54.27 
 
 		 597 aa  655    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0267  arginyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 		 597 aa  627  1e-178  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6433  arginyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 		 642 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.490682  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 590 aa  452  1.0000000000000001e-126  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0607  arginyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 585 aa  387  1e-106  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.872641  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  30.27 
 
 		 565 aa  250  6e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0438  arginyl-tRNA synthetase  30.43 
 
 		 601 aa  248  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  30.27 
 
 		 565 aa  248  3e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1535  arginyl-tRNA synthetase  28.67 
 
 		 624 aa  247  4.9999999999999997e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  30.5 
 
 		 564 aa  244  3e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  30.78 
 
 		 565 aa  241  2e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  29.75 
 
 		 565 aa  236  7e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  28.95 
 
 		 563 aa  234  5e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  29.9 
 
 		 562 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0466  arginyl-tRNA synthetase  29.09 
 
 		 564 aa  232  2e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.795792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  29.9 
 
 		 562 aa  231  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  29.72 
 
 		 563 aa  231  3e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  29.72 
 
 		 562 aa  231  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  29.72 
 
 		 562 aa  231  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  29.62 
 
 		 562 aa  231  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  29.55 
 
 		 562 aa  231  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  29.9 
 
 		 562 aa  230  5e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  29.72 
 
 		 562 aa  228  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  29.67 
 
 		 562 aa  226  9e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  26.4 
 
 		 574 aa  226  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0899  arginyl-tRNA synthetase  28.9 
 
 		 566 aa  225  2e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0249713  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  28.25 
 
 		 566 aa  224  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1270  arginyl-tRNA synthetase  32.19 
 
 		 562 aa  224  4e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000463651  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  27.86 
 
 		 640 aa  220  6e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1309  arginyl-tRNA synthetase  28.03 
 
 		 613 aa  216  7e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.925397  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0562  arginyl-tRNA synthetase  29.2 
 
 		 550 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1620  arginyl-tRNA synthetase  29.95 
 
 		 562 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010963  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1739  arginyl-tRNA synthetase  30.57 
 
 		 567 aa  212  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  26.66 
 
 		 571 aa  208  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2213  arginyl-tRNA synthetase  29 
 
 		 555 aa  206  7e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0564  arginyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 		 635 aa  206  1e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0333  arginyl-tRNA synthetase  27.95 
 
 		 572 aa  204  4e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2837  arginyl-tRNA synthetase  28.42 
 
 		 555 aa  203  6e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0222286 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2236  arginyl-tRNA synthetase  29.89 
 
 		 433 aa  203  8e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000339277  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  26.92 
 
 		 566 aa  202  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2012  arginyl-tRNA synthetase  29.03 
 
 		 583 aa  201  3e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.750372  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1291  arginyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 591 aa  201  3e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.456077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0169  arginyl-tRNA synthetase  28.42 
 
 		 602 aa  199  7.999999999999999e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1508  arginyl-tRNA synthetase  28.97 
 
 		 558 aa  199  9e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.818041  normal  0.873479 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3171  arginyl-tRNA synthetase  28.05 
 
 		 595 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0269  arginyl-tRNA synthetase  26.61 
 
 		 576 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1633  arginyl-tRNA synthetase  27.7 
 
 		 566 aa  196  1e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2705  arginyl-tRNA synthetase  28.96 
 
 		 598 aa  196  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1215  arginyl-tRNA synthetase  29.1 
 
 		 563 aa  196  1e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0329  arginyl-tRNA synthetase  29.23 
 
 		 613 aa  193  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3319  arginyl-tRNA synthetase  27.48 
 
 		 575 aa  192  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4135  arginyl-tRNA synthetase  27.29 
 
 		 591 aa  191  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0271  arginyl-tRNA synthetase  27.83 
 
 		 558 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0568  arginyl-tRNA synthetase  28.18 
 
 		 566 aa  190  5e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.078202  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1008  arginyl-tRNA synthetase  26.97 
 
 		 569 aa  189  9e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0268  arginyl-tRNA synthetase  27.98 
 
 		 566 aa  189  1e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.107833  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1102  arginyl-tRNA synthetase  27.76 
 
 		 574 aa  186  8e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0288  arginyl-tRNA synthetase  28.72 
 
 		 559 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.124809 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3474  arginyl-tRNA synthetase  26.42 
 
 		 580 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387689  normal  0.108328 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2169  arginyl-tRNA synthetase  24.6 
 
 		 585 aa  186  2.0000000000000003e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3151  arginyl-tRNA synthetase  27.75 
 
 		 585 aa  183  7e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0216  arginyl-tRNA synthetase  26.96 
 
 		 558 aa  182  1e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4427  arginyl-tRNA synthetase  26.58 
 
 		 581 aa  182  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0443  arginyl-tRNA synthetase  25.97 
 
 		 581 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0350  arginyl-tRNA synthetase  26.96 
 
 		 569 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1017  arginyl-tRNA synthetase  26.71 
 
 		 630 aa  181  4e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.341311 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0456  arginyl-tRNA synthetase  26.46 
 
 		 581 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3673  arginyl-tRNA synthetase  26.46 
 
 		 581 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3496  arginyl-tRNA synthetase  26.46 
 
 		 581 aa  180  7e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0630  arginyl-tRNA synthetase  27.36 
 
 		 593 aa  179  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0550  arginyl-tRNA synthetase  27.18 
 
 		 581 aa  179  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259334  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0378  arginyl-tRNA synthetase  26.1 
 
 		 581 aa  177  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4123  arginyl-tRNA synthetase  26.33 
 
 		 581 aa  177  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3779  arginyl-tRNA synthetase  27.5 
 
 		 581 aa  177  6e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.580214  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2379  arginyl-tRNA synthetase  28.32 
 
 		 579 aa  177  6e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222047  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8944  Arginine--tRNA ligase  26.49 
 
 		 584 aa  176  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0686  arginyl-tRNA synthetase  25.71 
 
 		 628 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01310  arginine-tRNA ligase, putative  26.24 
 
 		 622 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0173932  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0533  arginyl-tRNA synthetase  26.19 
 
 		 581 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.142076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3357  arginyl-tRNA synthetase  26.37 
 
 		 581 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4156  arginyl-tRNA synthetase  25.5 
 
 		 581 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.204707  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2451  arginyl-tRNA synthetase  27.19 
 
 		 612 aa  174  3.9999999999999995e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3277  arginyl-tRNA synthetase  27.45 
 
 		 570 aa  174  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.431918  normal  0.529534 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3845  arginyl-tRNA synthetase  26.43 
 
 		 581 aa  173  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02786  arginyl-tRNA synthetase  25.29 
 
 		 576 aa  172  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02051  arginyl-tRNA synthetase  27.03 
 
 		 604 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02161  arginyl-tRNA synthetase  26.6 
 
 		 602 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0474  arginyl-tRNA synthetase  26.43 
 
 		 581 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1577  arginyl-tRNA synthetase  26.59 
 
 		 590 aa  171  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02071  arginyl-tRNA synthetase  26.7 
 
 		 604 aa  172  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0498  arginyl-tRNA synthetase  26.43 
 
 		 581 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0495  arginyl-tRNA synthetase  26.43 
 
 		 581 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2213  arginyl-tRNA synthetase  25.61 
 
 		 588 aa  172  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.518161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>