More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1633 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_1102  arginyl-tRNA synthetase  66.15 
 
 
574 aa  759    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0268  arginyl-tRNA synthetase  95.94 
 
 
566 aa  1078    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.107833  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0350  arginyl-tRNA synthetase  79.44 
 
 
569 aa  891    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0568  arginyl-tRNA synthetase  97 
 
 
566 aa  1107    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.078202  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1633  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
566 aa  1153    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1008  arginyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 
569 aa  462  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0216  arginyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 
558 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2213  arginyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 
555 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1739  arginyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 
567 aa  436  1e-121  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2837  arginyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 
555 aa  429  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0222286 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1508  arginyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 
558 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.818041  normal  0.873479 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0271  arginyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 
558 aa  394  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0288  arginyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
559 aa  394  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.124809 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0562  arginyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 
550 aa  379  1e-104  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1291  arginyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 
591 aa  361  2e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.456077  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3171  arginyl-tRNA synthetase  36.09 
 
 
595 aa  356  7.999999999999999e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2012  arginyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 
583 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.750372  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0169  arginyl-tRNA synthetase  34.67 
 
 
602 aa  340  5e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1420  arginyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 
600 aa  327  3e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.435817  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0438  arginyl-tRNA synthetase  33.9 
 
 
601 aa  279  1e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0564  arginyl-tRNA synthetase  31.97 
 
 
635 aa  269  1e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1036  arginyl-tRNA synthetase  29.79 
 
 
628 aa  266  8e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475054 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  30.84 
 
 
590 aa  247  4e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  32.37 
 
 
565 aa  241  2e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2451  arginyl-tRNA synthetase  29.47 
 
 
612 aa  241  2.9999999999999997e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  30.03 
 
 
565 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  29.86 
 
 
565 aa  232  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1715  arginyl-tRNA synthetase  28.26 
 
 
619 aa  230  5e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1017  arginyl-tRNA synthetase  30.32 
 
 
630 aa  230  6e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.341311 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0329  arginyl-tRNA synthetase  31.02 
 
 
613 aa  229  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  29.53 
 
 
566 aa  229  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0441  arginyl-tRNA synthetase  30.54 
 
 
629 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  28.6 
 
 
563 aa  224  3e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  28.82 
 
 
563 aa  224  3e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  31.13 
 
 
562 aa  223  7e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  30.49 
 
 
589 aa  223  7e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0632  arginyl-tRNA synthetase  30.78 
 
 
564 aa  223  8e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1846  arginyl-tRNA synthetase  28.15 
 
 
625 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  30.95 
 
 
562 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  30.95 
 
 
562 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  31.13 
 
 
562 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  30.95 
 
 
562 aa  220  5e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  29.76 
 
 
566 aa  220  5e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0039  arginyl-tRNA synthetase  27.97 
 
 
599 aa  219  7e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285018  normal  0.0776701 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  29.43 
 
 
551 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  29.51 
 
 
589 aa  219  1e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  30.59 
 
 
562 aa  219  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  30.41 
 
 
562 aa  219  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  30.62 
 
 
562 aa  218  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0285  arginyl-tRNA synthetase  31.87 
 
 
564 aa  217  5e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0318968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  30.41 
 
 
562 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  29.14 
 
 
564 aa  215  1.9999999999999998e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1577  arginyl-tRNA synthetase  28.67 
 
 
621 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.879493  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  28.08 
 
 
565 aa  214  3.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1756  arginyl-tRNA synthetase  30.41 
 
 
630 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0324309  hitchhiker  0.00414873 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1935  arginyl-tRNA synthetase  31.39 
 
 
564 aa  214  3.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000950947  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0686  arginyl-tRNA synthetase  28.81 
 
 
628 aa  212  2e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0267  arginyl-tRNA synthetase  30.07 
 
 
597 aa  211  3e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1723  arginyl-tRNA synthetase  28.86 
 
 
546 aa  211  3e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  29.81 
 
 
556 aa  210  5e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  29.93 
 
 
561 aa  210  5e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  28.5 
 
 
551 aa  210  5e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  29.33 
 
 
584 aa  210  5e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2318  arginyl-tRNA synthetase  29 
 
 
593 aa  210  6e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.291854 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1650  arginyl-tRNA synthetase  28.69 
 
 
546 aa  210  7e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05910  arginyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 
592 aa  209  1e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1659  arginyl-tRNA synthetase  28.15 
 
 
543 aa  209  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.826444  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  31.41 
 
 
557 aa  209  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0586  arginyl-tRNA synthetase  30.74 
 
 
632 aa  209  1e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000562405 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0186  arginyl-tRNA synthetase  28.04 
 
 
597 aa  207  6e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2678  arginyl-tRNA synthetase  27.7 
 
 
592 aa  206  6e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1577  arginyl-tRNA synthetase  30.43 
 
 
635 aa  206  8e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502048  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 
556 aa  205  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  29.07 
 
 
556 aa  205  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  29.49 
 
 
556 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 
556 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 
556 aa  204  3e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 
556 aa  204  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  28.72 
 
 
586 aa  204  5e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0109  arginyl-tRNA synthetase  27.57 
 
 
562 aa  203  5e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 
556 aa  203  6e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 
556 aa  203  7e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  29.62 
 
 
568 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  29.45 
 
 
553 aa  202  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0124  arginyl-tRNA synthetase  27.57 
 
 
562 aa  202  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  29.45 
 
 
553 aa  202  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 
556 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  28.7 
 
 
556 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 
556 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  28.87 
 
 
556 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  28.45 
 
 
553 aa  201  3e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1654  arginyl-tRNA synthetase  28.26 
 
 
549 aa  201  3e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0671403  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0198  arginyl-tRNA synthetase  30.07 
 
 
592 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0251  arginyl-tRNA synthetase  29.79 
 
 
592 aa  199  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1215  arginyl-tRNA synthetase  27.6 
 
 
563 aa  199  1.0000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2304  arginyl-tRNA synthetase  28.33 
 
 
561 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0307018  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  28.07 
 
 
571 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  27.71 
 
 
554 aa  197  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  28.4 
 
 
551 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0742  arginyl-tRNA synthetase  29.4 
 
 
554 aa  197  5.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000856279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>