More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0438 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0438  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
601 aa  1239    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  31.47 
 
 
566 aa  289  9e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  31.74 
 
 
566 aa  288  1e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  33.22 
 
 
565 aa  288  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  33.05 
 
 
565 aa  286  7e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1535  arginyl-tRNA synthetase  32.96 
 
 
624 aa  282  1e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  33.4 
 
 
565 aa  275  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0267  arginyl-tRNA synthetase  32.01 
 
 
597 aa  271  2.9999999999999997e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0568  arginyl-tRNA synthetase  33.9 
 
 
566 aa  271  4e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.078202  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1620  arginyl-tRNA synthetase  31.1 
 
 
562 aa  270  8e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010963  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1577  arginyl-tRNA synthetase  33.02 
 
 
621 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.879493  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2318  arginyl-tRNA synthetase  31.99 
 
 
593 aa  267  5e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.291854 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1633  arginyl-tRNA synthetase  33.9 
 
 
566 aa  267  5e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0268  arginyl-tRNA synthetase  33.84 
 
 
566 aa  265  1e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.107833  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  29.4 
 
 
590 aa  265  2e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  30.98 
 
 
562 aa  265  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  30.81 
 
 
562 aa  262  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  30.46 
 
 
562 aa  261  3e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  30.64 
 
 
562 aa  261  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  30.64 
 
 
562 aa  260  4e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  30.64 
 
 
562 aa  260  4e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  30.64 
 
 
562 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1008  arginyl-tRNA synthetase  32.82 
 
 
569 aa  259  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1739  arginyl-tRNA synthetase  30.85 
 
 
567 aa  258  2e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0186  arginyl-tRNA synthetase  31.02 
 
 
597 aa  258  3e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  31.44 
 
 
563 aa  256  6e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  30.46 
 
 
562 aa  256  7e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01847  arginyl-tRNA synthetase  31.65 
 
 
577 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1764  arginyl-tRNA synthetase  31.65 
 
 
577 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1310  arginyl-tRNA synthetase  31.65 
 
 
577 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.363287 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01836  hypothetical protein  31.65 
 
 
577 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2613  arginyl-tRNA synthetase  31.65 
 
 
577 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253751 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0533  arginyl-tRNA synthetase  31.92 
 
 
581 aa  254  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.142076  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  30.81 
 
 
562 aa  254  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1971  arginyl-tRNA synthetase  31.65 
 
 
577 aa  254  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4427  arginyl-tRNA synthetase  31.18 
 
 
581 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2169  arginyl-tRNA synthetase  31.46 
 
 
577 aa  253  8.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1756  arginyl-tRNA synthetase  31.46 
 
 
577 aa  253  8.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  29.49 
 
 
565 aa  253  1e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0216  arginyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 
558 aa  252  1e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1102  arginyl-tRNA synthetase  31.35 
 
 
574 aa  251  2e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  30.18 
 
 
574 aa  251  3e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  32.26 
 
 
564 aa  250  6e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2442  arginyl-tRNA synthetase  31.46 
 
 
577 aa  249  8e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  31.63 
 
 
563 aa  249  8e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2108  arginyl-tRNA synthetase  31.27 
 
 
577 aa  249  1e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0251  arginyl-tRNA synthetase  33.13 
 
 
592 aa  249  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2678  arginyl-tRNA synthetase  30.43 
 
 
592 aa  248  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4123  arginyl-tRNA synthetase  31.64 
 
 
581 aa  248  3e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0039  arginyl-tRNA synthetase  30.23 
 
 
599 aa  248  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285018  normal  0.0776701 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0456  arginyl-tRNA synthetase  31.43 
 
 
581 aa  246  6e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0466  arginyl-tRNA synthetase  31.86 
 
 
564 aa  247  6e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.795792  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3673  arginyl-tRNA synthetase  31.43 
 
 
581 aa  246  8e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3496  arginyl-tRNA synthetase  31.43 
 
 
581 aa  246  9e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0288  arginyl-tRNA synthetase  33.08 
 
 
559 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.124809 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2837  arginyl-tRNA synthetase  32.21 
 
 
555 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0222286 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2213  arginyl-tRNA synthetase  33.46 
 
 
555 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2069  arginyl-tRNA synthetase  30.64 
 
 
577 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205082 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2124  arginyl-tRNA synthetase  30.64 
 
 
577 aa  246  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  hitchhiker  0.0000003636 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0271  arginyl-tRNA synthetase  31.39 
 
 
558 aa  244  3e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  30.04 
 
 
640 aa  244  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1508  arginyl-tRNA synthetase  33.27 
 
 
558 aa  244  3e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.818041  normal  0.873479 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3779  arginyl-tRNA synthetase  31.76 
 
 
581 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.580214  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2064  arginyl-tRNA synthetase  30.45 
 
 
577 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.10003 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1213  arginyl-tRNA synthetase  30.45 
 
 
577 aa  244  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0378  arginyl-tRNA synthetase  30.61 
 
 
581 aa  243  7e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0350  arginyl-tRNA synthetase  33.4 
 
 
569 aa  241  2e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05910  arginyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 
592 aa  241  2e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2169  arginyl-tRNA synthetase  27.68 
 
 
585 aa  241  4e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1337  arginyl-tRNA synthetase  30.26 
 
 
577 aa  240  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014051 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0550  arginyl-tRNA synthetase  31.18 
 
 
581 aa  239  8e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259334  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3357  arginyl-tRNA synthetase  30.49 
 
 
581 aa  239  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3762  arginyl-tRNA synthetase  31.05 
 
 
581 aa  239  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0761225  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6433  arginyl-tRNA synthetase  29.05 
 
 
642 aa  239  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.490682  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1270  arginyl-tRNA synthetase  30.17 
 
 
562 aa  236  6e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000463651  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3845  arginyl-tRNA synthetase  30.81 
 
 
581 aa  237  6e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0495  arginyl-tRNA synthetase  30.81 
 
 
581 aa  236  9e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0498  arginyl-tRNA synthetase  30.81 
 
 
581 aa  236  9e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0474  arginyl-tRNA synthetase  30.81 
 
 
581 aa  236  9e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0443  arginyl-tRNA synthetase  31.25 
 
 
581 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0333  arginyl-tRNA synthetase  30 
 
 
572 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2379  arginyl-tRNA synthetase  31.32 
 
 
579 aa  235  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222047  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0599  arginyl-tRNA synthetase  30.42 
 
 
596 aa  233  6e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0607  arginyl-tRNA synthetase  28.74 
 
 
585 aa  233  1e-59  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.872641  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2173  arginyl-tRNA synthetase  29.66 
 
 
576 aa  231  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004100  arginyl-tRNA synthetase  29.57 
 
 
577 aa  230  7e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000862961  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0535  arginyl-tRNA synthetase  30.86 
 
 
579 aa  229  9e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.607806  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1807  arginyl-tRNA synthetase  29.7 
 
 
576 aa  229  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.426497  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  28.28 
 
 
571 aa  229  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3171  arginyl-tRNA synthetase  31.15 
 
 
595 aa  228  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1215  arginyl-tRNA synthetase  30.42 
 
 
563 aa  227  4e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0006  arginyl-tRNA synthetase  28.7 
 
 
582 aa  226  6e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0899  arginyl-tRNA synthetase  29.72 
 
 
566 aa  226  9e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0249713  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01368  arginyl-tRNA synthetase  29.08 
 
 
577 aa  226  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2084  arginyl-tRNA synthetase  29.51 
 
 
576 aa  225  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4134  arginyl-tRNA synthetase  31.63 
 
 
577 aa  226  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440291  hitchhiker  0.000000042149 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2270  arginyl-tRNA synthetase  29.96 
 
 
576 aa  225  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2236  arginyl-tRNA synthetase  31.54 
 
 
433 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000339277  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0562  arginyl-tRNA synthetase  31.18 
 
 
550 aa  223  9.999999999999999e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2705  arginyl-tRNA synthetase  30.39 
 
 
598 aa  223  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>