More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2213 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0288  arginyl-tRNA synthetase  63.86 
 
 		 559 aa  731    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.124809 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1508  arginyl-tRNA synthetase  58.6 
 
 		 558 aa  674    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.818041  normal  0.873479 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2213  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 555 aa  1137    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2837  arginyl-tRNA synthetase  62.9 
 
 		 555 aa  704    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0222286 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0271  arginyl-tRNA synthetase  67.82 
 
 		 558 aa  778    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0216  arginyl-tRNA synthetase  53.67 
 
 		 558 aa  561  1e-158  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1739  arginyl-tRNA synthetase  52.3 
 
 		 567 aa  551  1e-155  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1008  arginyl-tRNA synthetase  52.61 
 
 		 569 aa  543  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0568  arginyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 566 aa  432  1e-120  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.078202  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1102  arginyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 574 aa  427  1e-118  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1633  arginyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 566 aa  426  1e-118  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0268  arginyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 566 aa  419  1e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.107833  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0350  arginyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 569 aa  413  1e-114  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3171  arginyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 595 aa  388  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2012  arginyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 		 583 aa  383  1e-105  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.750372  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1291  arginyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 591 aa  372  1e-102  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.456077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0562  arginyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 550 aa  372  1e-102  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1420  arginyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 600 aa  362  1e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.435817  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0169  arginyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 602 aa  359  8e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2451  arginyl-tRNA synthetase  32.38 
 
 		 612 aa  257  3e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0564  arginyl-tRNA synthetase  32.73 
 
 		 635 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1036  arginyl-tRNA synthetase  32.99 
 
 		 628 aa  254  4.0000000000000004e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475054 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1756  arginyl-tRNA synthetase  33.16 
 
 		 630 aa  248  1e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0324309  hitchhiker  0.00414873 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0438  arginyl-tRNA synthetase  33.46 
 
 		 601 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0329  arginyl-tRNA synthetase  31.88 
 
 		 613 aa  240  5e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1577  arginyl-tRNA synthetase  32.57 
 
 		 635 aa  237  4e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  32.77 
 
 		 565 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1017  arginyl-tRNA synthetase  31.96 
 
 		 630 aa  235  2.0000000000000002e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.341311 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0586  arginyl-tRNA synthetase  31.57 
 
 		 632 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000562405 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1715  arginyl-tRNA synthetase  31.78 
 
 		 619 aa  231  2e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  32.77 
 
 		 565 aa  230  6e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  30.39 
 
 		 566 aa  229  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0441  arginyl-tRNA synthetase  32.35 
 
 		 629 aa  226  9e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1846  arginyl-tRNA synthetase  28.55 
 
 		 625 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  29.83 
 
 		 590 aa  218  2e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  31.9 
 
 		 551 aa  217  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0039  arginyl-tRNA synthetase  29.31 
 
 		 599 aa  216  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285018  normal  0.0776701 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2318  arginyl-tRNA synthetase  28.52 
 
 		 593 aa  216  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.291854 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0686  arginyl-tRNA synthetase  28.69 
 
 		 628 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  30.38 
 
 		 589 aa  214  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  30.22 
 
 		 566 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  30.66 
 
 		 589 aa  213  5.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0267  arginyl-tRNA synthetase  29.62 
 
 		 597 aa  213  9e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1577  arginyl-tRNA synthetase  27.78 
 
 		 621 aa  212  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.879493  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  30.71 
 
 		 556 aa  212  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  31.34 
 
 		 574 aa  211  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  31.08 
 
 		 564 aa  211  2e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  31.46 
 
 		 563 aa  211  2e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  31.09 
 
 		 562 aa  211  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  30.36 
 
 		 563 aa  209  9e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  30.55 
 
 		 562 aa  209  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  30.84 
 
 		 562 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  31.09 
 
 		 562 aa  208  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  30.84 
 
 		 562 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  31.34 
 
 		 562 aa  208  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  31.29 
 
 		 551 aa  208  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  30.42 
 
 		 562 aa  207  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  30.55 
 
 		 562 aa  207  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2678  arginyl-tRNA synthetase  29 
 
 		 592 aa  206  7e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0632  arginyl-tRNA synthetase  32.35 
 
 		 564 aa  206  7e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  30.02 
 
 		 553 aa  206  8e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  30.07 
 
 		 562 aa  206  8e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2169  arginyl-tRNA synthetase  28.07 
 
 		 585 aa  206  8e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0430  arginyl-tRNA synthetase  28.91 
 
 		 594 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  30.81 
 
 		 562 aa  206  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0410  arginyl-tRNA synthetase  28.91 
 
 		 594 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0084  arginyl-tRNA synthetase  28.74 
 
 		 594 aa  203  6e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.72933  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0592  arginyl-tRNA synthetase  28.74 
 
 		 594 aa  203  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597736  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1997  arginyl-tRNA synthetase  28.74 
 
 		 594 aa  203  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2291  arginyl-tRNA synthetase  28.74 
 
 		 594 aa  203  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3099  arginyl-tRNA synthetase  28.74 
 
 		 594 aa  203  6e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0466  arginyl-tRNA synthetase  30.97 
 
 		 564 aa  203  7e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.795792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  31.85 
 
 		 565 aa  202  9e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0127  arginyl-tRNA synthetase  30.14 
 
 		 595 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0188  arginyl-tRNA synthetase  29 
 
 		 594 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05910  arginyl-tRNA synthetase  27.95 
 
 		 592 aa  202  9.999999999999999e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02918  arginyl-tRNA synthetase  30.97 
 
 		 562 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  30.11 
 
 		 553 aa  202  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  32.24 
 
 		 584 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  30.11 
 
 		 553 aa  202  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1686  arginyl-tRNA synthetase  29.95 
 
 		 575 aa  201  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  30.38 
 
 		 551 aa  200  6e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0355  arginyl-tRNA synthetase  29.36 
 
 		 594 aa  200  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1495  arginyl-tRNA synthetase  28.47 
 
 		 543 aa  199  9e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0186  arginyl-tRNA synthetase  27.3 
 
 		 597 aa  199  1.0000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0743  arginyl-tRNA synthetase  30.99 
 
 		 550 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  29.61 
 
 		 568 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1486  arginyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 		 550 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0405  arginyl-tRNA synthetase  29.2 
 
 		 542 aa  197  4.0000000000000005e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1019  arginyl-tRNA synthetase  28.88 
 
 		 563 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.637999  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2782  arginyl-tRNA synthetase  28.55 
 
 		 557 aa  197  5.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.535695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0096  arginyl-tRNA synthetase  29.81 
 
 		 602 aa  197  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  30.62 
 
 		 586 aa  196  6e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0077  arginyl-tRNA synthetase  30 
 
 		 586 aa  196  8.000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0137  arginyl-tRNA synthetase  30.09 
 
 		 596 aa  196  9e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0145  arginyl-tRNA synthetase  30.09 
 
 		 596 aa  195  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2109  arginyl-tRNA synthetase  30 
 
 		 592 aa  195  2e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.513959  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  29.43 
 
 		 551 aa  194  3e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  28.26 
 
 		 556 aa  194  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  29 
 
 		 559 aa  194  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>