More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2451 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2451  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
612 aa  1234    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0329  arginyl-tRNA synthetase  71.52 
 
 
613 aa  866    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1036  arginyl-tRNA synthetase  52.58 
 
 
628 aa  628  1e-178  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475054 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0686  arginyl-tRNA synthetase  33.23 
 
 
628 aa  296  9e-79  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2032  arginyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 
647 aa  272  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2213  arginyl-tRNA synthetase  32.55 
 
 
555 aa  262  1e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2837  arginyl-tRNA synthetase  31.21 
 
 
555 aa  249  1e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0222286 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0288  arginyl-tRNA synthetase  32.73 
 
 
559 aa  248  2e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.124809 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0271  arginyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 
558 aa  246  9.999999999999999e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1008  arginyl-tRNA synthetase  30.32 
 
 
569 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1102  arginyl-tRNA synthetase  30.19 
 
 
574 aa  244  5e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1508  arginyl-tRNA synthetase  31.77 
 
 
558 aa  242  1e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.818041  normal  0.873479 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0350  arginyl-tRNA synthetase  30.18 
 
 
569 aa  236  7e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1633  arginyl-tRNA synthetase  29.63 
 
 
566 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0568  arginyl-tRNA synthetase  29.47 
 
 
566 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.078202  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1739  arginyl-tRNA synthetase  30.17 
 
 
567 aa  233  1e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0216  arginyl-tRNA synthetase  30.29 
 
 
558 aa  229  8e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0268  arginyl-tRNA synthetase  29.31 
 
 
566 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.107833  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0441  arginyl-tRNA synthetase  32.46 
 
 
629 aa  219  1e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0564  arginyl-tRNA synthetase  28.11 
 
 
635 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1756  arginyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 
630 aa  216  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0324309  hitchhiker  0.00414873 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0586  arginyl-tRNA synthetase  31.47 
 
 
632 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000562405 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  29.84 
 
 
565 aa  211  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  28.64 
 
 
562 aa  208  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  27.95 
 
 
565 aa  209  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  28.12 
 
 
565 aa  209  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1577  arginyl-tRNA synthetase  31.16 
 
 
635 aa  206  7e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502048  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0562  arginyl-tRNA synthetase  27.26 
 
 
550 aa  206  8e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  28.64 
 
 
562 aa  206  8e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3171  arginyl-tRNA synthetase  30.63 
 
 
595 aa  206  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  28.64 
 
 
562 aa  204  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  28.64 
 
 
562 aa  204  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  28.64 
 
 
562 aa  203  6e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  28.85 
 
 
562 aa  203  9e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  28.64 
 
 
562 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  29.47 
 
 
564 aa  201  3.9999999999999996e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1715  arginyl-tRNA synthetase  29.12 
 
 
619 aa  198  3e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1577  arginyl-tRNA synthetase  27.06 
 
 
621 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.879493  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0169  arginyl-tRNA synthetase  28.51 
 
 
602 aa  197  5.000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  28.32 
 
 
562 aa  197  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1420  arginyl-tRNA synthetase  29.88 
 
 
600 aa  194  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.435817  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  28.41 
 
 
562 aa  194  6e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0466  arginyl-tRNA synthetase  29.39 
 
 
564 aa  192  1e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.795792  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1215  arginyl-tRNA synthetase  29.15 
 
 
563 aa  192  2e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  26.73 
 
 
566 aa  191  5e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3474  arginyl-tRNA synthetase  30.11 
 
 
580 aa  191  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387689  normal  0.108328 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0899  arginyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 
566 aa  189  9e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0249713  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  29.88 
 
 
574 aa  188  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2379  arginyl-tRNA synthetase  29.62 
 
 
579 aa  187  7e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222047  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  29.17 
 
 
590 aa  185  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  26.11 
 
 
566 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1535  arginyl-tRNA synthetase  26.52 
 
 
624 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2318  arginyl-tRNA synthetase  27.53 
 
 
593 aa  183  9.000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.291854 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2012  arginyl-tRNA synthetase  28.9 
 
 
583 aa  182  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.750372  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1291  arginyl-tRNA synthetase  29.35 
 
 
591 aa  182  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.456077  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1846  arginyl-tRNA synthetase  26.87 
 
 
625 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  28.44 
 
 
640 aa  181  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0186  arginyl-tRNA synthetase  27.25 
 
 
597 aa  180  5.999999999999999e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2678  arginyl-tRNA synthetase  27.19 
 
 
592 aa  180  7e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1270  arginyl-tRNA synthetase  27.71 
 
 
562 aa  180  7e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000463651  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0438  arginyl-tRNA synthetase  27.08 
 
 
601 aa  179  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2169  arginyl-tRNA synthetase  28.39 
 
 
585 aa  177  6e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1620  arginyl-tRNA synthetase  29.01 
 
 
562 aa  177  7e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010963  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0039  arginyl-tRNA synthetase  28.39 
 
 
599 aa  175  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285018  normal  0.0776701 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1017  arginyl-tRNA synthetase  26.46 
 
 
630 aa  174  5e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.341311 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  26.78 
 
 
563 aa  173  7.999999999999999e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1309  arginyl-tRNA synthetase  27.22 
 
 
613 aa  173  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.925397  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  26.11 
 
 
565 aa  172  1e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2124  arginyl-tRNA synthetase  27.44 
 
 
577 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  hitchhiker  0.0000003636 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1213  arginyl-tRNA synthetase  27.44 
 
 
577 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2064  arginyl-tRNA synthetase  26.91 
 
 
577 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.10003 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2069  arginyl-tRNA synthetase  26.91 
 
 
577 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205082 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  27.24 
 
 
563 aa  171  5e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05910  arginyl-tRNA synthetase  26.49 
 
 
592 aa  170  6e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2236  arginyl-tRNA synthetase  28.77 
 
 
433 aa  170  8e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000339277  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1807  arginyl-tRNA synthetase  27.2 
 
 
576 aa  169  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.426497  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1337  arginyl-tRNA synthetase  26.91 
 
 
577 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014051 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2084  arginyl-tRNA synthetase  26.88 
 
 
576 aa  169  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0251  arginyl-tRNA synthetase  26.1 
 
 
592 aa  168  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2613  arginyl-tRNA synthetase  26.83 
 
 
577 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253751 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1310  arginyl-tRNA synthetase  26.83 
 
 
577 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.363287 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01847  arginyl-tRNA synthetase  26.83 
 
 
577 aa  167  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1764  arginyl-tRNA synthetase  26.83 
 
 
577 aa  167  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01836  hypothetical protein  26.83 
 
 
577 aa  167  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0006  arginyl-tRNA synthetase  26.91 
 
 
582 aa  167  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1971  arginyl-tRNA synthetase  26.83 
 
 
577 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2169  arginyl-tRNA synthetase  26.83 
 
 
577 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1756  arginyl-tRNA synthetase  26.83 
 
 
577 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0599  arginyl-tRNA synthetase  25.91 
 
 
596 aa  167  6.9999999999999995e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02786  arginyl-tRNA synthetase  28.26 
 
 
576 aa  166  8e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2270  arginyl-tRNA synthetase  27.34 
 
 
576 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4135  arginyl-tRNA synthetase  27.96 
 
 
591 aa  166  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0267  arginyl-tRNA synthetase  25.42 
 
 
597 aa  164  3e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2791  arginyl-tRNA synthetase  27.13 
 
 
576 aa  161  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.263184 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2181  arginyl-tRNA synthetase  28.42 
 
 
563 aa  159  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.264732  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  26.58 
 
 
589 aa  158  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  27.03 
 
 
556 aa  159  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  25.6 
 
 
556 aa  158  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  25.6 
 
 
556 aa  158  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2173  arginyl-tRNA synthetase  26.78 
 
 
576 aa  158  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>