More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2032 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2032  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 647 aa  1340    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0686  arginyl-tRNA synthetase  36.26 
 
 		 628 aa  354  2.9999999999999997e-96  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1036  arginyl-tRNA synthetase  33.7 
 
 		 628 aa  292  1e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475054 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2451  arginyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 		 612 aa  272  1e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0329  arginyl-tRNA synthetase  32.96 
 
 		 613 aa  265  2e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2213  arginyl-tRNA synthetase  29.04 
 
 		 555 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0568  arginyl-tRNA synthetase  28.28 
 
 		 566 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.078202  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  26.85 
 
 		 590 aa  173  9e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1102  arginyl-tRNA synthetase  26.24 
 
 		 574 aa  172  2e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0271  arginyl-tRNA synthetase  27.64 
 
 		 558 aa  170  7e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  25.77 
 
 		 565 aa  169  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  25.38 
 
 		 565 aa  169  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1633  arginyl-tRNA synthetase  27.76 
 
 		 566 aa  169  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0288  arginyl-tRNA synthetase  27.86 
 
 		 559 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.124809 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0268  arginyl-tRNA synthetase  28.12 
 
 		 566 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.107833  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0350  arginyl-tRNA synthetase  28.39 
 
 		 569 aa  163  1e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0564  arginyl-tRNA synthetase  25.87 
 
 		 635 aa  162  2e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0562  arginyl-tRNA synthetase  27.74 
 
 		 550 aa  161  3e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1508  arginyl-tRNA synthetase  27.2 
 
 		 558 aa  159  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.818041  normal  0.873479 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  24.35 
 
 		 564 aa  158  3e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0333  arginyl-tRNA synthetase  24.43 
 
 		 572 aa  157  5.0000000000000005e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  24.84 
 
 		 565 aa  157  7e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1270  arginyl-tRNA synthetase  25.44 
 
 		 562 aa  157  7e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000463651  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0441  arginyl-tRNA synthetase  25.57 
 
 		 629 aa  148  3e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0186  arginyl-tRNA synthetase  25.41 
 
 		 597 aa  147  7.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  23.69 
 
 		 563 aa  146  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3171  arginyl-tRNA synthetase  26.23 
 
 		 595 aa  145  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0466  arginyl-tRNA synthetase  24.26 
 
 		 564 aa  145  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.795792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  24.52 
 
 		 565 aa  145  3e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1715  arginyl-tRNA synthetase  24.63 
 
 		 619 aa  144  3e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1846  arginyl-tRNA synthetase  24.66 
 
 		 625 aa  144  5e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2678  arginyl-tRNA synthetase  23.91 
 
 		 592 aa  143  9e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0586  arginyl-tRNA synthetase  25.63 
 
 		 632 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000562405 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  24.72 
 
 		 566 aa  141  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  23.85 
 
 		 563 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004100  arginyl-tRNA synthetase  24.36 
 
 		 577 aa  140  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000862961  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0006  arginyl-tRNA synthetase  24.39 
 
 		 582 aa  140  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  22.68 
 
 		 566 aa  139  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0039  arginyl-tRNA synthetase  24.96 
 
 		 599 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285018  normal  0.0776701 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1577  arginyl-tRNA synthetase  25.58 
 
 		 635 aa  137  5e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1577  arginyl-tRNA synthetase  23.81 
 
 		 590 aa  137  6.0000000000000005e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1756  arginyl-tRNA synthetase  25.42 
 
 		 630 aa  137  8e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0324309  hitchhiker  0.00414873 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0535  arginyl-tRNA synthetase  24.84 
 
 		 579 aa  135  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.607806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1661  arginyl-tRNA synthetase  25.08 
 
 		 599 aa  135  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  24.18 
 
 		 562 aa  134  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0438  arginyl-tRNA synthetase  25.8 
 
 		 601 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01368  arginyl-tRNA synthetase  24.03 
 
 		 577 aa  133  9e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2791  arginyl-tRNA synthetase  23.91 
 
 		 576 aa  133  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.263184 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2110  arginyl-tRNA synthetase  24.2 
 
 		 577 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.102153  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0169  arginyl-tRNA synthetase  25.59 
 
 		 602 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02786  arginyl-tRNA synthetase  23.91 
 
 		 576 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  24.73 
 
 		 562 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2434  arginyl-tRNA synthetase  23.65 
 
 		 576 aa  131  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.035286 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2155  arginyl-tRNA synthetase  23.9 
 
 		 576 aa  131  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0808745  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  24.26 
 
 		 562 aa  130  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  24.26 
 
 		 562 aa  130  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0899  arginyl-tRNA synthetase  22.65 
 
 		 566 aa  130  6e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0249713  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2043  arginyl-tRNA synthetase  23.45 
 
 		 576 aa  130  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  23.79 
 
 		 562 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2084  arginyl-tRNA synthetase  23.79 
 
 		 576 aa  130  9.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0251  arginyl-tRNA synthetase  22.49 
 
 		 592 aa  130  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1807  arginyl-tRNA synthetase  23.46 
 
 		 576 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.426497  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2169  arginyl-tRNA synthetase  25.15 
 
 		 577 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4427  arginyl-tRNA synthetase  22.97 
 
 		 581 aa  128  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0599  arginyl-tRNA synthetase  26.75 
 
 		 596 aa  128  3e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  23.44 
 
 		 562 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05910  arginyl-tRNA synthetase  24.64 
 
 		 592 aa  127  4.0000000000000003e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2613  arginyl-tRNA synthetase  25.23 
 
 		 577 aa  128  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253751 
 
 
-
 
NC_002950  PG0267  arginyl-tRNA synthetase  23.05 
 
 		 597 aa  127  5e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1756  arginyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 577 aa  127  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01847  arginyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 577 aa  127  6e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1764  arginyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 577 aa  127  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  23.32 
 
 		 562 aa  127  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1337  arginyl-tRNA synthetase  24.77 
 
 		 577 aa  127  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014051 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01836  hypothetical protein  25 
 
 		 577 aa  127  6e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1310  arginyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 577 aa  127  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363287 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0607  arginyl-tRNA synthetase  23.92 
 
 		 585 aa  127  9e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.872641  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2108  arginyl-tRNA synthetase  24.92 
 
 		 577 aa  126  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2064  arginyl-tRNA synthetase  24.77 
 
 		 577 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.10003 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2069  arginyl-tRNA synthetase  24.92 
 
 		 577 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205082 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4389  arginyl-tRNA synthetase  24.16 
 
 		 613 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1213  arginyl-tRNA synthetase  24.77 
 
 		 577 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2124  arginyl-tRNA synthetase  24.77 
 
 		 577 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  hitchhiker  0.0000003636 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3151  arginyl-tRNA synthetase  24.65 
 
 		 585 aa  125  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1971  arginyl-tRNA synthetase  24.85 
 
 		 577 aa  125  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2012  arginyl-tRNA synthetase  25.62 
 
 		 583 aa  124  7e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.750372  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2270  arginyl-tRNA synthetase  24.17 
 
 		 576 aa  123  9e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36013  predicted protein  24.92 
 
 		 573 aa  123  9e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2173  arginyl-tRNA synthetase  23.09 
 
 		 576 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2318  arginyl-tRNA synthetase  23.45 
 
 		 593 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.291854 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1215  arginyl-tRNA synthetase  22.27 
 
 		 563 aa  122  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1291  arginyl-tRNA synthetase  23.5 
 
 		 591 aa  121  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.456077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2566  arginyl-tRNA synthetase  23.98 
 
 		 590 aa  121  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2442  arginyl-tRNA synthetase  25.08 
 
 		 577 aa  121  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1535  arginyl-tRNA synthetase  22.61 
 
 		 624 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02621  arginyl-tRNA synthetase  22.76 
 
 		 607 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0249545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0955  arginyl-tRNA synthetase  23.67 
 
 		 577 aa  119  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1554  arginyl-tRNA synthetase  22.6 
 
 		 607 aa  117  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1650  arginyl-tRNA synthetase  24.33 
 
 		 546 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2451  arginyl-tRNA synthetase  23.7 
 
 		 590 aa  113  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>