More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4389 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4389  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 613 aa  1237    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2213  arginyl-tRNA synthetase  55.54 
 
 		 588 aa  623  1e-177  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.518161 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1274  arginyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 594 aa  442  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000144018  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3845  arginyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 		 581 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0498  arginyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 		 581 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0474  arginyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 		 581 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0495  arginyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 		 581 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4123  arginyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 581 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0378  arginyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 		 581 aa  376  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0550  arginyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 		 581 aa  375  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259334  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3496  arginyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 		 581 aa  375  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0456  arginyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 		 581 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3673  arginyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 		 581 aa  374  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0533  arginyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 		 581 aa  371  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.142076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4134  arginyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 		 577 aa  371  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440291  hitchhiker  0.000000042149 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3762  arginyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 		 581 aa  372  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0761225  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0443  arginyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 		 581 aa  372  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5138  arginyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 		 578 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.447973  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2379  arginyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 		 579 aa  366  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222047  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3357  arginyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 		 581 aa  364  2e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4427  arginyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 581 aa  362  8e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0397  arginyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 579 aa  359  7e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2705  arginyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 598 aa  355  2e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3779  arginyl-tRNA synthetase  36.66 
 
 		 581 aa  353  4e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.580214  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5089  arginyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 		 578 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1337  arginyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 		 577 aa  352  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014051 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0535  arginyl-tRNA synthetase  38.04 
 
 		 579 aa  352  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.607806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5139  arginyl-tRNA synthetase  36.5 
 
 		 578 aa  350  4e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4962  arginyl-tRNA synthetase  36.5 
 
 		 578 aa  350  4e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2069  arginyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 		 577 aa  350  6e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205082 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2064  arginyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 		 577 aa  350  6e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.10003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2124  arginyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 		 577 aa  350  6e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  hitchhiker  0.0000003636 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1213  arginyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 		 577 aa  350  6e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0399  arginyl-tRNA synthetase  36 
 
 		 578 aa  348  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66750  arginyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 		 587 aa  348  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1971  arginyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 		 577 aa  347  3e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2613  arginyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 		 577 aa  347  4e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253751 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2110  arginyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 		 577 aa  347  4e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.102153  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0006  arginyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 		 582 aa  347  4e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.653166 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01847  arginyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 		 577 aa  347  5e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1764  arginyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 		 577 aa  347  5e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01836  hypothetical protein  36.67 
 
 		 577 aa  347  5e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1756  arginyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 		 577 aa  346  6e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1310  arginyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 		 577 aa  346  6e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363287 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0376  arginyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 		 578 aa  346  7e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2173  arginyl-tRNA synthetase  35.23 
 
 		 576 aa  345  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5788  arginyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 		 587 aa  345  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2169  arginyl-tRNA synthetase  36.47 
 
 		 577 aa  345  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004100  arginyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 		 577 aa  345  2e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000862961  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1661  arginyl-tRNA synthetase  37.29 
 
 		 599 aa  345  2e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1577  arginyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 		 590 aa  343  4e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2108  arginyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 		 577 aa  343  4e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2442  arginyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 		 577 aa  342  8e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01368  arginyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 		 577 aa  342  8e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02786  arginyl-tRNA synthetase  36.03 
 
 		 576 aa  341  2e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1359  arginyl-tRNA synthetase  36.69 
 
 		 578 aa  341  2e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1110  arginyl-tRNA synthetase  36.66 
 
 		 582 aa  340  2.9999999999999998e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2270  arginyl-tRNA synthetase  36.2 
 
 		 576 aa  341  2.9999999999999998e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0333  arginyl-tRNA synthetase  34.17 
 
 		 572 aa  340  5e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0269  arginyl-tRNA synthetase  35.66 
 
 		 576 aa  339  8e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2084  arginyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 		 576 aa  336  9e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8944  Arginine--tRNA ligase  34.77 
 
 		 584 aa  335  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0955  arginyl-tRNA synthetase  35.44 
 
 		 577 aa  335  1e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2169  arginyl-tRNA synthetase  34.61 
 
 		 585 aa  335  2e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3238  arginyl-tRNA synthetase  36.13 
 
 		 585 aa  334  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3671  arginyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 		 585 aa  333  5e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1807  arginyl-tRNA synthetase  33.93 
 
 		 576 aa  333  8e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.426497  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45360  arginyl-tRNA synthetase  37.33 
 
 		 579 aa  332  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621239  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2791  arginyl-tRNA synthetase  33.93 
 
 		 576 aa  332  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.263184 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2434  arginyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 		 576 aa  332  1e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.035286 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2155  arginyl-tRNA synthetase  34.09 
 
 		 576 aa  331  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0808745  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3956  arginyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 		 574 aa  331  2e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2043  arginyl-tRNA synthetase  34.09 
 
 		 576 aa  331  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0153  arginyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 		 572 aa  329  9e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0630  arginyl-tRNA synthetase  37.29 
 
 		 593 aa  325  2e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5574  arginyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 619 aa  324  3e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.469409  normal  0.593378 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27471  arginyl-tRNA synthetase  35.92 
 
 		 603 aa  323  8e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.471612 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4156  arginyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 		 581 aa  322  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.204707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3561  arginyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 		 588 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3985  arginyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 		 585 aa  320  7e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  32.94 
 
 		 571 aa  319  7e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02161  arginyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 		 602 aa  318  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3319  arginyl-tRNA synthetase  34.57 
 
 		 575 aa  316  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0146  arginyl-tRNA synthetase  36.41 
 
 		 572 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3277  arginyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 		 570 aa  314  3.9999999999999997e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.431918  normal  0.529534 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02621  arginyl-tRNA synthetase  33.83 
 
 		 607 aa  313  5.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0249545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1554  arginyl-tRNA synthetase  33.77 
 
 		 607 aa  312  9e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0276  arginyl-tRNA synthetase  31.97 
 
 		 578 aa  311  2e-83  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36013  predicted protein  34.04 
 
 		 573 aa  310  4e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2060  arginyl-tRNA synthetase  34.68 
 
 		 585 aa  310  5e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.571937  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02051  arginyl-tRNA synthetase  32.76 
 
 		 603 aa  306  7e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3151  arginyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 		 585 aa  303  6.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0542  arginyl-tRNA synthetase  33.87 
 
 		 585 aa  303  9e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.475442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02071  arginyl-tRNA synthetase  32.63 
 
 		 604 aa  301  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0525  arginyl-tRNA synthetase  33.56 
 
 		 585 aa  300  5e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02051  arginyl-tRNA synthetase  32.14 
 
 		 604 aa  299  8e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2451  arginyl-tRNA synthetase  35.02 
 
 		 590 aa  299  1e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0189  arginyl-tRNA synthetase  33.01 
 
 		 604 aa  299  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.177771  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2134  arginyl-tRNA synthetase  36.01 
 
 		 590 aa  291  2e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0739  arginyl-tRNA synthetase  32.14 
 
 		 563 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>