More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4123 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01847  arginyl-tRNA synthetase  55.08 
 
 		 577 aa  644    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1764  arginyl-tRNA synthetase  55.08 
 
 		 577 aa  644    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5089  arginyl-tRNA synthetase  64.39 
 
 		 578 aa  743    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1337  arginyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 		 577 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014051 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1213  arginyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 		 577 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3779  arginyl-tRNA synthetase  85.89 
 
 		 581 aa  1053    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.580214  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01836  hypothetical protein  55.08 
 
 		 577 aa  644    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45360  arginyl-tRNA synthetase  64.04 
 
 		 579 aa  735    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621239  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4427  arginyl-tRNA synthetase  84.17 
 
 		 581 aa  1028    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4123  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 581 aa  1196    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5138  arginyl-tRNA synthetase  65.69 
 
 		 578 aa  771    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.447973  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2270  arginyl-tRNA synthetase  54.83 
 
 		 576 aa  638    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2108  arginyl-tRNA synthetase  54.83 
 
 		 577 aa  641    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2169  arginyl-tRNA synthetase  55 
 
 		 577 aa  644    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0397  arginyl-tRNA synthetase  65.41 
 
 		 579 aa  750    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5788  arginyl-tRNA synthetase  64.64 
 
 		 587 aa  738    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0378  arginyl-tRNA synthetase  84.17 
 
 		 581 aa  1033    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0498  arginyl-tRNA synthetase  93.98 
 
 		 581 aa  1132    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0399  arginyl-tRNA synthetase  63.35 
 
 		 578 aa  732    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0474  arginyl-tRNA synthetase  93.98 
 
 		 581 aa  1132    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0495  arginyl-tRNA synthetase  93.98 
 
 		 581 aa  1132    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4134  arginyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 577 aa  678    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440291  hitchhiker  0.000000042149 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0533  arginyl-tRNA synthetase  83.99 
 
 		 581 aa  1033    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.142076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3357  arginyl-tRNA synthetase  88.64 
 
 		 581 aa  1075    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2064  arginyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 		 577 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.10003 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2613  arginyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 		 577 aa  641    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253751 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3845  arginyl-tRNA synthetase  94.15 
 
 		 581 aa  1133    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1310  arginyl-tRNA synthetase  55.08 
 
 		 577 aa  644    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363287 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2173  arginyl-tRNA synthetase  55.34 
 
 		 576 aa  638    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2442  arginyl-tRNA synthetase  55.08 
 
 		 577 aa  639    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004100  arginyl-tRNA synthetase  55.9 
 
 		 577 aa  635    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000862961  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3496  arginyl-tRNA synthetase  97.07 
 
 		 581 aa  1166    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0456  arginyl-tRNA synthetase  97.25 
 
 		 581 aa  1167    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3762  arginyl-tRNA synthetase  88.47 
 
 		 581 aa  1079    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0761225  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0550  arginyl-tRNA synthetase  94.32 
 
 		 581 aa  1130    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259334  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66750  arginyl-tRNA synthetase  64.13 
 
 		 587 aa  732    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1756  arginyl-tRNA synthetase  55 
 
 		 577 aa  644    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5139  arginyl-tRNA synthetase  64.91 
 
 		 578 aa  748    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3673  arginyl-tRNA synthetase  97.07 
 
 		 581 aa  1164    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0376  arginyl-tRNA synthetase  65.44 
 
 		 578 aa  751    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1971  arginyl-tRNA synthetase  55.08 
 
 		 577 aa  644    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0443  arginyl-tRNA synthetase  84.68 
 
 		 581 aa  1026    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0535  arginyl-tRNA synthetase  65.96 
 
 		 579 aa  763    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.607806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4962  arginyl-tRNA synthetase  64.39 
 
 		 578 aa  742    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0006  arginyl-tRNA synthetase  66.04 
 
 		 582 aa  785    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1807  arginyl-tRNA synthetase  53.45 
 
 		 576 aa  634  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.426497  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2069  arginyl-tRNA synthetase  54.22 
 
 		 577 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205082 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2124  arginyl-tRNA synthetase  54.22 
 
 		 577 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  hitchhiker  0.0000003636 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01368  arginyl-tRNA synthetase  55.9 
 
 		 577 aa  630  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2084  arginyl-tRNA synthetase  53.54 
 
 		 576 aa  631  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2379  arginyl-tRNA synthetase  55.33 
 
 		 579 aa  625  1e-178  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222047  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2110  arginyl-tRNA synthetase  54.98 
 
 		 577 aa  618  1e-176  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.102153  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2434  arginyl-tRNA synthetase  52.5 
 
 		 576 aa  621  1e-176  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.035286 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2043  arginyl-tRNA synthetase  52.5 
 
 		 576 aa  620  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2155  arginyl-tRNA synthetase  52.76 
 
 		 576 aa  621  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0808745  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2791  arginyl-tRNA synthetase  53.79 
 
 		 576 aa  617  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.263184 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1661  arginyl-tRNA synthetase  55.54 
 
 		 599 aa  618  1e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02786  arginyl-tRNA synthetase  54.17 
 
 		 576 aa  612  9.999999999999999e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0955  arginyl-tRNA synthetase  52.92 
 
 		 577 aa  610  1e-173  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1359  arginyl-tRNA synthetase  56.06 
 
 		 578 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1110  arginyl-tRNA synthetase  51.97 
 
 		 582 aa  578  1e-164  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0276  arginyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 578 aa  562  1.0000000000000001e-159  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1577  arginyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 590 aa  516  1.0000000000000001e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0269  arginyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 576 aa  505  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0146  arginyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 572 aa  495  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3956  arginyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 		 574 aa  496  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0542  arginyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 		 585 aa  495  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.475442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0525  arginyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 		 585 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4156  arginyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 		 581 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.204707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0153  arginyl-tRNA synthetase  46.62 
 
 		 572 aa  491  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3671  arginyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 585 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3561  arginyl-tRNA synthetase  49.01 
 
 		 588 aa  487  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2705  arginyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 		 598 aa  485  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3319  arginyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 		 575 aa  482  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02051  arginyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 		 603 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3238  arginyl-tRNA synthetase  48.55 
 
 		 585 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27471  arginyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 603 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.471612 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3985  arginyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 		 585 aa  479  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2060  arginyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 		 585 aa  480  1e-134  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.571937  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0630  arginyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 		 593 aa  476  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3277  arginyl-tRNA synthetase  46.07 
 
 		 570 aa  476  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.431918  normal  0.529534 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8944  Arginine--tRNA ligase  45.19 
 
 		 584 aa  472  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02621  arginyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 		 607 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0249545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36013  predicted protein  46.3 
 
 		 573 aa  469  1.0000000000000001e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1554  arginyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 		 607 aa  465  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5574  arginyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 619 aa  465  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.469409  normal  0.593378 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0189  arginyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 604 aa  461  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.177771  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02051  arginyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 604 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02071  arginyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 		 604 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2169  arginyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 585 aa  443  1e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2451  arginyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 590 aa  444  1e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3151  arginyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 585 aa  442  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02161  arginyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 602 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0739  arginyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 563 aa  436  1e-121  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2134  arginyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 590 aa  434  1e-120  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06550  arginyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 588 aa  422  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.386576  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 571 aa  416  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0333  arginyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 		 572 aa  384  1e-105  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2566  arginyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 590 aa  376  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4389  arginyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 613 aa  372  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.872152 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>