More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1756 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1577  arginyl-tRNA synthetase  75.47 
 
 		 635 aa  995    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0441  arginyl-tRNA synthetase  75.95 
 
 		 629 aa  971    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1756  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 630 aa  1275    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0324309  hitchhiker  0.00414873 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0586  arginyl-tRNA synthetase  73.73 
 
 		 632 aa  1003    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000562405 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1017  arginyl-tRNA synthetase  46 
 
 		 630 aa  529  1e-149  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.341311 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0564  arginyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 635 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1715  arginyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 		 619 aa  361  2e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1846  arginyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 		 625 aa  327  6e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2213  arginyl-tRNA synthetase  33.16 
 
 		 555 aa  248  2e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2012  arginyl-tRNA synthetase  31.67 
 
 		 583 aa  232  2e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.750372  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0216  arginyl-tRNA synthetase  32.58 
 
 		 558 aa  227  4e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0271  arginyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 		 558 aa  226  1e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1739  arginyl-tRNA synthetase  29.93 
 
 		 567 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1008  arginyl-tRNA synthetase  31.33 
 
 		 569 aa  218  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2451  arginyl-tRNA synthetase  31.3 
 
 		 612 aa  214  3.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1291  arginyl-tRNA synthetase  29.44 
 
 		 591 aa  214  5.999999999999999e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.456077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0568  arginyl-tRNA synthetase  29.73 
 
 		 566 aa  207  3e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.078202  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0288  arginyl-tRNA synthetase  30.88 
 
 		 559 aa  207  6e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.124809 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2837  arginyl-tRNA synthetase  30.32 
 
 		 555 aa  206  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0222286 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1633  arginyl-tRNA synthetase  30.41 
 
 		 566 aa  205  2e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1508  arginyl-tRNA synthetase  30.11 
 
 		 558 aa  204  3e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.818041  normal  0.873479 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24923  predicted protein  27.33 
 
 		 652 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.321104  normal  0.342415 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0268  arginyl-tRNA synthetase  29.73 
 
 		 566 aa  200  7.999999999999999e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.107833  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0329  arginyl-tRNA synthetase  30.88 
 
 		 613 aa  196  7e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1102  arginyl-tRNA synthetase  29.03 
 
 		 574 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1036  arginyl-tRNA synthetase  29.41 
 
 		 628 aa  196  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475054 
 
 
-
 
NC_002950  PG0267  arginyl-tRNA synthetase  28.88 
 
 		 597 aa  183  7e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  25.12 
 
 		 566 aa  182  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  27.41 
 
 		 640 aa  180  5.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  26.18 
 
 		 566 aa  178  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  27.26 
 
 		 574 aa  179  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  28.3 
 
 		 590 aa  176  9e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  28.55 
 
 		 565 aa  175  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0438  arginyl-tRNA synthetase  29.76 
 
 		 601 aa  172  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0186  arginyl-tRNA synthetase  26.9 
 
 		 597 aa  173  1e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  25.17 
 
 		 565 aa  171  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1309  arginyl-tRNA synthetase  26.85 
 
 		 613 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.925397  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  25.82 
 
 		 565 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05910  arginyl-tRNA synthetase  26.29 
 
 		 592 aa  167  5e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3171  arginyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 595 aa  166  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0562  arginyl-tRNA synthetase  33.06 
 
 		 550 aa  162  1e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0686  arginyl-tRNA synthetase  27.09 
 
 		 628 aa  160  5e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  25.39 
 
 		 565 aa  160  5e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0039  arginyl-tRNA synthetase  26.62 
 
 		 599 aa  160  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285018  normal  0.0776701 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0251  arginyl-tRNA synthetase  25.59 
 
 		 592 aa  160  6e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0899  arginyl-tRNA synthetase  24.42 
 
 		 566 aa  159  1e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0249713  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  24.81 
 
 		 564 aa  155  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1535  arginyl-tRNA synthetase  24.32 
 
 		 624 aa  154  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  24.58 
 
 		 571 aa  152  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0333  arginyl-tRNA synthetase  25.84 
 
 		 572 aa  152  2e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1420  arginyl-tRNA synthetase  30.61 
 
 		 600 aa  151  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.435817  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1577  arginyl-tRNA synthetase  27.34 
 
 		 621 aa  151  4e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.879493  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1110  arginyl-tRNA synthetase  26.27 
 
 		 582 aa  150  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4135  arginyl-tRNA synthetase  25.94 
 
 		 591 aa  150  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4427  arginyl-tRNA synthetase  27.12 
 
 		 581 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6433  arginyl-tRNA synthetase  25.82 
 
 		 642 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.490682  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  25.51 
 
 		 563 aa  148  3e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0443  arginyl-tRNA synthetase  26.74 
 
 		 581 aa  147  6e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06368  arginyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G14030)  26.75 
 
 		 650 aa  145  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.908063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2318  arginyl-tRNA synthetase  26.44 
 
 		 593 aa  145  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.291854 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0632  arginyl-tRNA synthetase  27.21 
 
 		 564 aa  144  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  26.76 
 
 		 561 aa  143  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0050  arginyl-tRNA synthetase  26.06 
 
 		 564 aa  142  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1807  arginyl-tRNA synthetase  24.34 
 
 		 576 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.426497  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0533  arginyl-tRNA synthetase  25.95 
 
 		 581 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.142076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2791  arginyl-tRNA synthetase  24.24 
 
 		 576 aa  140  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.263184 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  23.97 
 
 		 563 aa  140  6e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0169  arginyl-tRNA synthetase  29.97 
 
 		 602 aa  140  7.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2173  arginyl-tRNA synthetase  24.91 
 
 		 576 aa  140  8.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2678  arginyl-tRNA synthetase  25.52 
 
 		 592 aa  140  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01368  arginyl-tRNA synthetase  25.14 
 
 		 577 aa  140  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2270  arginyl-tRNA synthetase  25.14 
 
 		 576 aa  140  8.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0350  arginyl-tRNA synthetase  32.87 
 
 		 569 aa  139  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1337  arginyl-tRNA synthetase  25.44 
 
 		 577 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014051 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2084  arginyl-tRNA synthetase  24.15 
 
 		 576 aa  139  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2069  arginyl-tRNA synthetase  25.44 
 
 		 577 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205082 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2064  arginyl-tRNA synthetase  25.44 
 
 		 577 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.10003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2124  arginyl-tRNA synthetase  25.44 
 
 		 577 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  hitchhiker  0.0000003636 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1213  arginyl-tRNA synthetase  25.44 
 
 		 577 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004100  arginyl-tRNA synthetase  25.73 
 
 		 577 aa  138  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000862961  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2169  arginyl-tRNA synthetase  26.93 
 
 		 585 aa  138  3.0000000000000003e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3779  arginyl-tRNA synthetase  26.47 
 
 		 581 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.580214  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0466  arginyl-tRNA synthetase  24.36 
 
 		 564 aa  138  4e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.795792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2410  arginyl-tRNA synthetase  26.09 
 
 		 560 aa  137  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000917803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0355  arginyl-tRNA synthetase  29 
 
 		 594 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2032  arginyl-tRNA synthetase  25.42 
 
 		 647 aa  137  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38727  arginyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 603 aa  137  8e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.908762 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 562 aa  136  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0430  arginyl-tRNA synthetase  28.29 
 
 		 594 aa  137  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0410  arginyl-tRNA synthetase  28.29 
 
 		 594 aa  137  9e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0084  arginyl-tRNA synthetase  28.29 
 
 		 594 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.72933  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0592  arginyl-tRNA synthetase  28.29 
 
 		 594 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597736  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3099  arginyl-tRNA synthetase  28.29 
 
 		 594 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1997  arginyl-tRNA synthetase  28.29 
 
 		 594 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  27.29 
 
 		 551 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1359  arginyl-tRNA synthetase  24.39 
 
 		 578 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2291  arginyl-tRNA synthetase  28.29 
 
 		 594 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2181  arginyl-tRNA synthetase  25.68 
 
 		 563 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.264732  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2155  arginyl-tRNA synthetase  23.25 
 
 		 576 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0808745  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1215  arginyl-tRNA synthetase  28.38 
 
 		 563 aa  135  1.9999999999999998e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>