More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1008 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1008  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 569 aa  1162    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1739  arginyl-tRNA synthetase  67.84 
 
 		 567 aa  805    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0216  arginyl-tRNA synthetase  53.6 
 
 		 558 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2213  arginyl-tRNA synthetase  52.61 
 
 		 555 aa  543  1e-153  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1508  arginyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 		 558 aa  532  1e-150  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.818041  normal  0.873479 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2837  arginyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 		 555 aa  514  1e-144  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0222286 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0271  arginyl-tRNA synthetase  50.46 
 
 		 558 aa  514  1e-144  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0288  arginyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 		 559 aa  486  1e-136  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.124809 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1102  arginyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 		 574 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0568  arginyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 		 566 aa  456  1e-127  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.078202  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1633  arginyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 566 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0268  arginyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 566 aa  450  1e-125  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.107833  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0350  arginyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 		 569 aa  435  1e-120  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3171  arginyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 595 aa  410  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0169  arginyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 602 aa  409  1e-113  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1291  arginyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 591 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.456077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2012  arginyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 583 aa  401  9.999999999999999e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.750372  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1420  arginyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 600 aa  392  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.435817  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0562  arginyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 		 550 aa  340  5.9999999999999996e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  29.9 
 
 		 566 aa  267  2.9999999999999995e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  32.26 
 
 		 551 aa  259  7e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0438  arginyl-tRNA synthetase  32.82 
 
 		 601 aa  259  1e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0564  arginyl-tRNA synthetase  31.89 
 
 		 635 aa  258  1e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1036  arginyl-tRNA synthetase  29.81 
 
 		 628 aa  252  1e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475054 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  31.61 
 
 		 589 aa  250  5e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  31.61 
 
 		 589 aa  250  6e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  32.47 
 
 		 553 aa  246  6.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2451  arginyl-tRNA synthetase  30.63 
 
 		 612 aa  245  9.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  31.29 
 
 		 553 aa  244  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  31.29 
 
 		 553 aa  244  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  32.13 
 
 		 551 aa  243  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  32.92 
 
 		 551 aa  240  4e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  31.26 
 
 		 590 aa  239  1e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  30.3 
 
 		 565 aa  236  6e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  29.36 
 
 		 566 aa  236  7e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  30.3 
 
 		 565 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1715  arginyl-tRNA synthetase  30.35 
 
 		 619 aa  234  5e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  30.57 
 
 		 586 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0027  arginyl-tRNA synthetase  31.72 
 
 		 585 aa  231  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0632  arginyl-tRNA synthetase  32.92 
 
 		 564 aa  229  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  32.33 
 
 		 570 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  29.48 
 
 		 564 aa  226  7e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2456  arginyl-tRNA synthetase  28.69 
 
 		 598 aa  226  8e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0329  arginyl-tRNA synthetase  29.98 
 
 		 613 aa  226  9e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01700  arginyl-tRNA synthetase  30.72 
 
 		 583 aa  226  1e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000411406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1053  arginyl-tRNA synthetase  30.95 
 
 		 556 aa  225  2e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0586  arginyl-tRNA synthetase  31.54 
 
 		 632 aa  225  2e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000562405 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1486  arginyl-tRNA synthetase  29.69 
 
 		 550 aa  225  2e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1577  arginyl-tRNA synthetase  30.86 
 
 		 635 aa  224  3e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0198  arginyl-tRNA synthetase  31.24 
 
 		 592 aa  224  4e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1270  arginyl-tRNA synthetase  30.78 
 
 		 556 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0106385  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0686  arginyl-tRNA synthetase  29 
 
 		 628 aa  223  8e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4230  arginyl-tRNA synthetase  30.32 
 
 		 561 aa  223  9e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.228794 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1081  arginyl-tRNA synthetase  30.89 
 
 		 556 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  30.1 
 
 		 561 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0441  arginyl-tRNA synthetase  31.42 
 
 		 629 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  30.84 
 
 		 556 aa  221  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0743  arginyl-tRNA synthetase  31.03 
 
 		 550 aa  220  5e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  30.59 
 
 		 562 aa  220  6e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  30.22 
 
 		 559 aa  219  7.999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3183  arginyl-tRNA synthetase  30.78 
 
 		 561 aa  219  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000169325  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1756  arginyl-tRNA synthetase  31.33 
 
 		 630 aa  218  2e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0324309  hitchhiker  0.00414873 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  29.85 
 
 		 562 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0188  arginyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 		 594 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0607  arginyl-tRNA synthetase  32.15 
 
 		 585 aa  218  2.9999999999999998e-55  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.872641  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  28.47 
 
 		 556 aa  216  7e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1659  arginyl-tRNA synthetase  30.55 
 
 		 543 aa  216  8e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.826444  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  29.96 
 
 		 562 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1935  arginyl-tRNA synthetase  29.44 
 
 		 564 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000950947  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0473  arginyl-tRNA synthetase  30.85 
 
 		 596 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.274692 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2782  arginyl-tRNA synthetase  30.26 
 
 		 557 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.535695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0285  arginyl-tRNA synthetase  30.91 
 
 		 564 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0318968  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  29.65 
 
 		 562 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0648  arginyl-tRNA synthetase  30.17 
 
 		 559 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0541152  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2410  arginyl-tRNA synthetase  30.61 
 
 		 560 aa  214  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000917803  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  29.67 
 
 		 562 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0349  arginyl-tRNA synthetase  29.67 
 
 		 579 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.87333 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  29.67 
 
 		 562 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0170  arginyl-tRNA synthetase  29.67 
 
 		 579 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4245  arginyl-tRNA synthetase  29.47 
 
 		 596 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  29.65 
 
 		 562 aa  213  7e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  29.49 
 
 		 562 aa  213  7e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  29.67 
 
 		 562 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2304  arginyl-tRNA synthetase  31.02 
 
 		 561 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0307018  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1620  arginyl-tRNA synthetase  29.55 
 
 		 562 aa  212  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010963  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2036  arginyl-tRNA synthetase  31.34 
 
 		 561 aa  213  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.432071  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  30.18 
 
 		 584 aa  212  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0405  arginyl-tRNA synthetase  28.32 
 
 		 542 aa  212  1e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  29.39 
 
 		 556 aa  211  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  29.78 
 
 		 562 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  28.73 
 
 		 559 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0077  arginyl-tRNA synthetase  28.52 
 
 		 586 aa  211  3e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0137  arginyl-tRNA synthetase  30.69 
 
 		 596 aa  211  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  28.52 
 
 		 554 aa  211  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4135  arginyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 		 591 aa  211  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  29.79 
 
 		 565 aa  211  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 		 551 aa  211  4e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02918  arginyl-tRNA synthetase  29.36 
 
 		 562 aa  210  5e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2774  arginyl-tRNA synthetase  30.65 
 
 		 611 aa  210  5e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.744463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2109  arginyl-tRNA synthetase  28.52 
 
 		 592 aa  210  6e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.513959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>