More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0562 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0562  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 550 aa  1123    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2213  arginyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 555 aa  384  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0568  arginyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 		 566 aa  374  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.078202  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1633  arginyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 566 aa  375  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0268  arginyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 566 aa  365  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.107833  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1102  arginyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 		 574 aa  366  1e-100  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2837  arginyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 		 555 aa  363  4e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0222286 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0216  arginyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 		 558 aa  355  1e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1508  arginyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 558 aa  353  5e-96  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.818041  normal  0.873479 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0271  arginyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 		 558 aa  351  2e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0350  arginyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 569 aa  347  3e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1008  arginyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 		 569 aa  346  5e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1739  arginyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 		 567 aa  346  7e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0288  arginyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 		 559 aa  334  3e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.124809 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3171  arginyl-tRNA synthetase  36.87 
 
 		 595 aa  333  5e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1291  arginyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 		 591 aa  332  9e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.456077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2012  arginyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 583 aa  327  4.0000000000000003e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.750372  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1420  arginyl-tRNA synthetase  37.03 
 
 		 600 aa  321  1.9999999999999998e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.435817  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0169  arginyl-tRNA synthetase  35.77 
 
 		 602 aa  311  2.9999999999999997e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  33.74 
 
 		 566 aa  286  5.999999999999999e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  33.71 
 
 		 566 aa  280  5e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  31.54 
 
 		 562 aa  273  7e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0466  arginyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 		 564 aa  270  5e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.795792  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  31.48 
 
 		 562 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  31.79 
 
 		 562 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  31.48 
 
 		 562 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  31.92 
 
 		 565 aa  266  5.999999999999999e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  31.42 
 
 		 562 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  30.7 
 
 		 562 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  31.35 
 
 		 562 aa  264  3e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  31.18 
 
 		 562 aa  264  3e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  30.5 
 
 		 565 aa  262  1e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1535  arginyl-tRNA synthetase  31.68 
 
 		 624 aa  259  1e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  31.24 
 
 		 563 aa  256  6e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  31.35 
 
 		 562 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  32.04 
 
 		 565 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  32.04 
 
 		 565 aa  253  8.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0564  arginyl-tRNA synthetase  31.31 
 
 		 635 aa  251  2e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05910  arginyl-tRNA synthetase  30.9 
 
 		 592 aa  251  3e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  31.14 
 
 		 563 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1620  arginyl-tRNA synthetase  31.88 
 
 		 562 aa  247  4.9999999999999997e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010963  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  30.78 
 
 		 564 aa  245  9.999999999999999e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1036  arginyl-tRNA synthetase  29.68 
 
 		 628 aa  240  5.999999999999999e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475054 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  30.5 
 
 		 590 aa  239  9e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1270  arginyl-tRNA synthetase  29.04 
 
 		 562 aa  235  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000463651  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1215  arginyl-tRNA synthetase  29.62 
 
 		 563 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0186  arginyl-tRNA synthetase  29.14 
 
 		 597 aa  234  3e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1846  arginyl-tRNA synthetase  31.41 
 
 		 625 aa  233  5e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1577  arginyl-tRNA synthetase  28.47 
 
 		 621 aa  232  1e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.879493  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1715  arginyl-tRNA synthetase  30.85 
 
 		 619 aa  231  2e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  28.93 
 
 		 574 aa  231  4e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0438  arginyl-tRNA synthetase  31.18 
 
 		 601 aa  229  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2318  arginyl-tRNA synthetase  28.7 
 
 		 593 aa  225  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.291854 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0329  arginyl-tRNA synthetase  29.31 
 
 		 613 aa  225  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0586  arginyl-tRNA synthetase  31.16 
 
 		 632 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000562405 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0251  arginyl-tRNA synthetase  29.64 
 
 		 592 aa  222  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0039  arginyl-tRNA synthetase  28.85 
 
 		 599 aa  222  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285018  normal  0.0776701 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1017  arginyl-tRNA synthetase  29.04 
 
 		 630 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.341311 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2678  arginyl-tRNA synthetase  29.73 
 
 		 592 aa  221  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0686  arginyl-tRNA synthetase  28.93 
 
 		 628 aa  219  1e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  30.65 
 
 		 640 aa  219  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0899  arginyl-tRNA synthetase  28 
 
 		 566 aa  218  2e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0249713  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0267  arginyl-tRNA synthetase  30.03 
 
 		 597 aa  217  5e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2451  arginyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 		 612 aa  216  5.9999999999999996e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4135  arginyl-tRNA synthetase  29.93 
 
 		 591 aa  216  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0599  arginyl-tRNA synthetase  28.3 
 
 		 596 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4134  arginyl-tRNA synthetase  27.62 
 
 		 577 aa  206  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440291  hitchhiker  0.000000042149 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0607  arginyl-tRNA synthetase  28.5 
 
 		 585 aa  205  2e-51  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.872641  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1309  arginyl-tRNA synthetase  29.61 
 
 		 613 aa  199  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.925397  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2169  arginyl-tRNA synthetase  26.52 
 
 		 585 aa  199  2.0000000000000003e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0405  arginyl-tRNA synthetase  30.91 
 
 		 542 aa  196  8.000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  27.62 
 
 		 571 aa  195  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  29.68 
 
 		 556 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2238  arginyl-tRNA synthetase  27 
 
 		 551 aa  193  8e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.361874  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5138  arginyl-tRNA synthetase  27.37 
 
 		 578 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.447973  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0333  arginyl-tRNA synthetase  29.59 
 
 		 572 aa  191  4e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2379  arginyl-tRNA synthetase  27.29 
 
 		 579 aa  190  5.999999999999999e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222047  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02786  arginyl-tRNA synthetase  27.05 
 
 		 576 aa  190  7e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  29.43 
 
 		 559 aa  189  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  30.48 
 
 		 556 aa  188  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004100  arginyl-tRNA synthetase  28.11 
 
 		 577 aa  188  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000862961  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2236  arginyl-tRNA synthetase  29.19 
 
 		 433 aa  188  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000339277  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  29.62 
 
 		 557 aa  188  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0550  arginyl-tRNA synthetase  27.71 
 
 		 581 aa  187  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259334  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3474  arginyl-tRNA synthetase  26.64 
 
 		 580 aa  187  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387689  normal  0.108328 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3845  arginyl-tRNA synthetase  27.91 
 
 		 581 aa  187  5e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0533  arginyl-tRNA synthetase  27.6 
 
 		 581 aa  187  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.142076  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 		 589 aa  187  6e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0955  arginyl-tRNA synthetase  27.55 
 
 		 577 aa  187  6e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2484  arginyl-tRNA synthetase  27.84 
 
 		 551 aa  187  6e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00470527  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1794  arginyl-tRNA synthetase  28.06 
 
 		 527 aa  186  7e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3319  arginyl-tRNA synthetase  28.46 
 
 		 575 aa  186  7e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0474  arginyl-tRNA synthetase  27.73 
 
 		 581 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0498  arginyl-tRNA synthetase  27.73 
 
 		 581 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0495  arginyl-tRNA synthetase  27.73 
 
 		 581 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4123  arginyl-tRNA synthetase  27.96 
 
 		 581 aa  186  8e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0397  arginyl-tRNA synthetase  26.65 
 
 		 579 aa  186  9e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2879  arginyl-tRNA synthetase  27.94 
 
 		 552 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 		 589 aa  185  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1935  arginyl-tRNA synthetase  28.32 
 
 		 564 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000950947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>