More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1794 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0413  arginyl-tRNA synthetase  62.31 
 
 		 528 aa  680    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1794  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 527 aa  1073    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1254  arginyl-tRNA synthetase  60.42 
 
 		 529 aa  646    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1190  arginyl-tRNA synthetase  59.49 
 
 		 530 aa  624  1e-177  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1309  arginyl-tRNA synthetase  59.3 
 
 		 530 aa  623  1e-177  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.96623  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0554  arginyl-tRNA synthetase  59.3 
 
 		 530 aa  620  1e-176  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.717877  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0543  arginyl-tRNA synthetase  58.45 
 
 		 527 aa  617  1e-175  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.29596  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1433  arginyl-tRNA synthetase  56.76 
 
 		 531 aa  617  1e-175  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1087  arginyl-tRNA synthetase  54.98 
 
 		 531 aa  602  1.0000000000000001e-171  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.661396  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1254  arginyl-tRNA synthetase  54.37 
 
 		 525 aa  570  1e-161  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  37.31 
 
 		 554 aa  343  5e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 		 554 aa  342  7e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  37.31 
 
 		 551 aa  331  2e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  36.18 
 
 		 551 aa  329  7e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0598  arginyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 		 553 aa  329  8e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  35.98 
 
 		 551 aa  329  9e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 		 556 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1486  arginyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 550 aa  327  3e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 		 559 aa  325  1e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 		 557 aa  325  2e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  37.15 
 
 		 556 aa  324  3e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  35.82 
 
 		 551 aa  323  4e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 		 551 aa  322  8e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2508  arginyl-tRNA synthetase  35.35 
 
 		 597 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0431095 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2410  arginyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 		 560 aa  320  3.9999999999999996e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000917803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0742  arginyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 		 554 aa  320  6e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000856279  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0743  arginyl-tRNA synthetase  35.36 
 
 		 550 aa  319  7.999999999999999e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0050  arginyl-tRNA synthetase  36.86 
 
 		 564 aa  318  1e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  35.46 
 
 		 556 aa  317  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  35.46 
 
 		 556 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  35.46 
 
 		 556 aa  317  3e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  35.59 
 
 		 556 aa  317  3e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  35.46 
 
 		 556 aa  317  3e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  35.46 
 
 		 556 aa  317  3e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  35.59 
 
 		 556 aa  317  3e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  35.46 
 
 		 556 aa  317  4e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2036  arginyl-tRNA synthetase  37.81 
 
 		 561 aa  317  4e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.432071  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1081  arginyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 		 556 aa  316  6e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 		 556 aa  316  7e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1944  arginyl-tRNA synthetase  35.1 
 
 		 575 aa  315  9.999999999999999e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.567724  normal  0.240014 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1053  arginyl-tRNA synthetase  35.42 
 
 		 556 aa  315  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  35.08 
 
 		 556 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3705  arginyl-tRNA synthetase  34.9 
 
 		 585 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.893232 
 
 
-
 
NC_002936  DET1270  arginyl-tRNA synthetase  35.23 
 
 		 556 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0106385  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3396  arginyl-tRNA synthetase  34.9 
 
 		 585 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.111317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0648  arginyl-tRNA synthetase  33.71 
 
 		 559 aa  312  7.999999999999999e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0541152  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2456  arginyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 		 598 aa  312  1e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  34.91 
 
 		 556 aa  312  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  36.62 
 
 		 553 aa  311  2e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  32.86 
 
 		 589 aa  311  2e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2178  arginyl-tRNA synthetase  34.4 
 
 		 590 aa  311  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  33.77 
 
 		 559 aa  311  2e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3183  arginyl-tRNA synthetase  35.97 
 
 		 561 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000169325  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0414  arginyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 		 539 aa  311  2.9999999999999997e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187834  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3194  arginyl-tRNA synthetase  35 
 
 		 592 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  32.8 
 
 		 589 aa  310  5e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  35.74 
 
 		 553 aa  309  6.999999999999999e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  35.74 
 
 		 553 aa  309  6.999999999999999e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  35.42 
 
 		 561 aa  309  9e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0349  arginyl-tRNA synthetase  34.66 
 
 		 579 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.87333 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0170  arginyl-tRNA synthetase  34.66 
 
 		 579 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2710  arginyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 		 590 aa  307  3e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.568206 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1758  arginyl-tRNA synthetase  34.4 
 
 		 597 aa  306  9.000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6158  arginyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 		 550 aa  304  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  34.04 
 
 		 586 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1588  arginyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 		 580 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.175533 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2675  arginyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 		 585 aa  304  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135814  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1482  arginyl-tRNA synthetase  33.8 
 
 		 585 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.747678  normal  0.431119 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2795  arginyl-tRNA synthetase  34.4 
 
 		 597 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0417013  normal  0.0873054 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0704  arginyl-tRNA synthetase  34.98 
 
 		 575 aa  303  6.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281403 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1807  arginyl-tRNA synthetase  33.39 
 
 		 597 aa  302  8.000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.738277 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2943  arginyl-tRNA synthetase  33.94 
 
 		 583 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.201497  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3587  arginyl-tRNA synthetase  33.93 
 
 		 594 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.170278  normal  0.919979 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1728  arginyl-tRNA synthetase  33.58 
 
 		 581 aa  302  9e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.231273  normal  0.529501 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  34.31 
 
 		 570 aa  302  9e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3866  arginyl-tRNA synthetase  34.4 
 
 		 587 aa  301  1e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.42649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2351  arginyl-tRNA synthetase  34.41 
 
 		 585 aa  302  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  33.21 
 
 		 584 aa  301  1e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1659  arginyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 		 543 aa  301  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.826444  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2750  arginyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 		 597 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292272  normal  0.122337 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2181  arginyl-tRNA synthetase  34.2 
 
 		 563 aa  300  3e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.264732  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1680  arginyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 585 aa  300  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06570  arginyl-tRNA synthetase  33.64 
 
 		 575 aa  299  7e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.645664 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0247  arginyl-tRNA synthetase  33.04 
 
 		 587 aa  299  8e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0358001  normal  0.157381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4245  arginyl-tRNA synthetase  34.77 
 
 		 586 aa  298  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4423  arginyl-tRNA synthetase  33.75 
 
 		 598 aa  298  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.69944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0903  arginyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 		 580 aa  298  2e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 		 586 aa  297  4e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0632  arginyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 		 564 aa  297  4e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1813  arginyl-tRNA synthetase  33.45 
 
 		 585 aa  297  4e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0749  arginyl-tRNA synthetase  33.27 
 
 		 585 aa  296  6e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0173421  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2238  arginyl-tRNA synthetase  32.96 
 
 		 551 aa  296  6e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.361874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0612  arginyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 		 562 aa  296  6e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.954769  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0877  arginyl-tRNA synthetase  34.18 
 
 		 585 aa  296  9e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1158  arginyl-tRNA synthetase  33.04 
 
 		 585 aa  295  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.381889  normal  0.900625 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0868  arginyl-tRNA synthetase  33.88 
 
 		 585 aa  295  2e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0027  arginyl-tRNA synthetase  33.87 
 
 		 585 aa  295  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2480  arginyl-tRNA synthetase  33.45 
 
 		 586 aa  294  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.299544  normal  0.119664 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0285  arginyl-tRNA synthetase  33.71 
 
 		 564 aa  294  3e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0318968  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3022  arginyl-tRNA synthetase  32.61 
 
 		 583 aa  294  3e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184997  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>