More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2283 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 554 aa  1138    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0742  arginyl-tRNA synthetase  61.98 
 
 		 554 aa  710    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000856279  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  98.38 
 
 		 554 aa  1124    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  55.3 
 
 		 556 aa  620  1e-176  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2304  arginyl-tRNA synthetase  55.44 
 
 		 561 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0307018  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  55.09 
 
 		 559 aa  609  1e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  53.62 
 
 		 568 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 586 aa  565  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0648  arginyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 		 559 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0541152  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1434  arginyl-tRNA synthetase  51.06 
 
 		 569 aa  558  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0988806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  53.14 
 
 		 551 aa  558  1e-157  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  51.22 
 
 		 551 aa  555  1e-157  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0198  arginyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 592 aa  547  1e-154  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 		 556 aa  535  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 		 556 aa  535  1e-151  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 		 556 aa  534  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 		 556 aa  534  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 		 556 aa  532  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 		 556 aa  535  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 		 556 aa  534  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 		 556 aa  532  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 589 aa  533  1e-150  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 		 556 aa  534  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 		 557 aa  533  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 		 556 aa  533  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 		 556 aa  532  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2181  arginyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 		 563 aa  533  1e-150  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.264732  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 		 586 aa  529  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 		 570 aa  529  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 589 aa  531  1e-149  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 		 556 aa  528  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 561 aa  528  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3183  arginyl-tRNA synthetase  49.01 
 
 		 561 aa  528  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000169325  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 551 aa  528  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2410  arginyl-tRNA synthetase  49.44 
 
 		 560 aa  526  1e-148  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000917803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0285  arginyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 564 aa  526  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0318968  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1137  arginyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 		 564 aa  528  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0701665  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0247  arginyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 		 587 aa  523  1e-147  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0358001  normal  0.157381 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  46.28 
 
 		 559 aa  519  1e-146  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0077  arginyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 586 aa  518  1.0000000000000001e-145  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  49.05 
 
 		 551 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2456  arginyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 		 598 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0050  arginyl-tRNA synthetase  46.07 
 
 		 564 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2109  arginyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 592 aa  516  1.0000000000000001e-145  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.513959  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 551 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0612  arginyl-tRNA synthetase  49.82 
 
 		 562 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.954769  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2114  arginyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 		 588 aa  508  9.999999999999999e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0170  arginyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 		 579 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0743  arginyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 550 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0349  arginyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 		 579 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.87333 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 584 aa  507  9.999999999999999e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1019  arginyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 		 563 aa  504  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.637999  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0027  arginyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 585 aa  500  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1935  arginyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 		 564 aa  496  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000950947  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3866  arginyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 587 aa  493  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.42649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1486  arginyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 550 aa  495  9.999999999999999e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0720  arginyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 		 587 aa  491  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0294  arginyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 609 aa  487  1e-136  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0704  arginyl-tRNA synthetase  45 
 
 		 575 aa  486  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281403 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 553 aa  481  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2431  arginyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 		 598 aa  480  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146297  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2343  arginyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 		 598 aa  480  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2774  arginyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 		 611 aa  479  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.744463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 553 aa  481  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2288  arginyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 605 aa  477  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.770548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2036  arginyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 		 561 aa  476  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.432071  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 553 aa  472  1e-132  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1807  arginyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 		 597 aa  474  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.738277 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2239  arginyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 609 aa  472  1e-132  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.183357 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1723  arginyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 546 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1946  arginyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 		 609 aa  470  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1524  arginyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 		 598 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0658423  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1758  arginyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 		 597 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1650  arginyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 		 546 aa  464  1e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2508  arginyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 597 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0431095 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0598  arginyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 553 aa  461  9.999999999999999e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3194  arginyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 592 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4423  arginyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 		 598 aa  458  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.69944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1158  arginyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 		 585 aa  457  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.381889  normal  0.900625 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1507  arginyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 575 aa  456  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.164187  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1081  arginyl-tRNA synthetase  44.59 
 
 		 556 aa  458  1e-127  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0903  arginyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 580 aa  457  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1813  arginyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 		 585 aa  456  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06570  arginyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 575 aa  457  1e-127  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.645664 
 
 
-
 
NC_002936  DET1270  arginyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 556 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0106385  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1053  arginyl-tRNA synthetase  44.32 
 
 		 556 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0820  arginyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 561 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0474084  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0405  arginyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 542 aa  451  1e-125  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01700  arginyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 583 aa  450  1e-125  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000411406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2750  arginyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 597 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292272  normal  0.122337 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 556 aa  450  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 562 aa  449  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1482  arginyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 		 585 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.747678  normal  0.431119 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1944  arginyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 575 aa  444  1e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.567724  normal  0.240014 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2795  arginyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 597 aa  445  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0417013  normal  0.0873054 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0602  arginyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 		 561 aa  443  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.154913  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4245  arginyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 		 586 aa  443  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1680  arginyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 585 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5548  arginyl-tRNA synthetase  45.17 
 
 		 550 aa  442  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598965  normal  0.0339829 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1728  arginyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 581 aa  443  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.231273  normal  0.529501 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>