More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1723 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1723  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
546 aa  1116    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1650  arginyl-tRNA synthetase  95.6 
 
 
546 aa  1077    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0405  arginyl-tRNA synthetase  57.01 
 
 
542 aa  632  1e-180  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1495  arginyl-tRNA synthetase  54.21 
 
 
543 aa  598  1e-170  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1654  arginyl-tRNA synthetase  51.28 
 
 
549 aa  580  1e-164  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0671403  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 
556 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 
557 aa  487  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 
556 aa  479  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0742  arginyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 
554 aa  478  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000856279  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 
556 aa  476  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 
556 aa  472  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 
556 aa  474  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 
556 aa  474  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 
556 aa  475  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 
556 aa  474  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 
556 aa  474  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1486  arginyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 
550 aa  474  1e-132  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 
556 aa  474  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2181  arginyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 
563 aa  470  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.264732  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0050  arginyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 
564 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 
554 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 
554 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 
556 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 
556 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 
561 aa  464  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0648  arginyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 
559 aa  462  9.999999999999999e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0541152  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2410  arginyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 
560 aa  459  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000917803  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0598  arginyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 
553 aa  455  1e-127  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 
559 aa  458  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 
586 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 
589 aa  454  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3183  arginyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 
561 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000169325  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0285  arginyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 
564 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0318968  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 
589 aa  450  1e-125  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 
568 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1935  arginyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 
564 aa  444  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000950947  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 
551 aa  442  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2774  arginyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 
611 aa  444  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.744463  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 
551 aa  442  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_002936  DET1270  arginyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 
556 aa  440  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0106385  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0612  arginyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 
562 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.954769  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1053  arginyl-tRNA synthetase  42 
 
 
556 aa  441  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 
559 aa  441  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 
570 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 
586 aa  438  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0198  arginyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 
592 aa  436  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1081  arginyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 
556 aa  436  1e-121  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0247  arginyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 
587 aa  433  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0358001  normal  0.157381 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2304  arginyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 
561 aa  431  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0307018  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2036  arginyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 
561 aa  429  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.432071  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 
556 aa  432  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0632  arginyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 
564 aa  427  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 
553 aa  427  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0027  arginyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 
585 aa  425  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 
551 aa  428  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1944  arginyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 
575 aa  427  1e-118  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.567724  normal  0.240014 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 
553 aa  427  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 
553 aa  425  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 
551 aa  422  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0077  arginyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 
586 aa  425  1e-117  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2114  arginyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 
588 aa  422  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 
584 aa  423  1e-117  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2109  arginyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 
592 aa  424  1e-117  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.513959  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0704  arginyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 
575 aa  422  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.281403 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0820  arginyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 
561 aa  425  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0474084  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 
551 aa  419  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2456  arginyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 
598 aa  419  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0349  arginyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 
579 aa  422  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.87333 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0170  arginyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 
579 aa  422  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1019  arginyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 
563 aa  419  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.637999  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 
562 aa  416  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
556 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0602  arginyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 
561 aa  418  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.154913  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1434  arginyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 
569 aa  412  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0988806  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1137  arginyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 
564 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0701665  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01700  arginyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 
583 aa  409  1e-113  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000411406  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0743  arginyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 
550 aa  402  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0720  arginyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 
587 aa  403  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1946  arginyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 
609 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3866  arginyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 
587 aa  395  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.42649  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0109  arginyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 
562 aa  397  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0124  arginyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 
562 aa  395  1e-109  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0294  arginyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 
609 aa  398  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2239  arginyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 
609 aa  398  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.183357 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1659  arginyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 
543 aa  396  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.826444  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02918  arginyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 
562 aa  395  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2782  arginyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 
557 aa  392  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.535695  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2343  arginyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 
598 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4155  arginyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 
553 aa  385  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.60572  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2431  arginyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 
598 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146297  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1524  arginyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 
598 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0658423  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4490  arginyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 
561 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.703488 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2487  arginyl-tRNA synthetase  39.77 
 
 
553 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.619732  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2288  arginyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 
605 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.770548  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3701  arginyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 
558 aa  378  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0897  arginyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 
532 aa  375  1e-103  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000469666 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06570  arginyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 
575 aa  378  1e-103  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.645664 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2879  arginyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
552 aa  378  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2238  arginyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 
551 aa  377  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.361874  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0628  arginyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 
562 aa  375  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0559225  decreased coverage  0.00224273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>