More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0561 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 559 aa  1142    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  55.47 
 
 		 554 aa  608  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  55.09 
 
 		 554 aa  609  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0742  arginyl-tRNA synthetase  55.72 
 
 		 554 aa  605  9.999999999999999e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000856279  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  52.65 
 
 		 556 aa  585  1e-166  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0648  arginyl-tRNA synthetase  52.35 
 
 		 559 aa  551  1e-155  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0541152  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3183  arginyl-tRNA synthetase  50.19 
 
 		 561 aa  546  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000169325  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  49.62 
 
 		 551 aa  525  1e-148  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 		 561 aa  521  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 		 586 aa  514  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 589 aa  514  1e-144  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 		 589 aa  512  1e-144  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 		 551 aa  515  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 586 aa  514  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 		 551 aa  511  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2181  arginyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 		 563 aa  509  1e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.264732  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0198  arginyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 		 592 aa  507  9.999999999999999e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2410  arginyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 560 aa  508  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000917803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 		 570 aa  504  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  48.04 
 
 		 551 aa  496  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0294  arginyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 609 aa  498  1e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2109  arginyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 592 aa  494  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.513959  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  48.03 
 
 		 551 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2456  arginyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 		 598 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1486  arginyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 		 550 aa  492  9.999999999999999e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0285  arginyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 		 564 aa  489  1e-137  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0318968  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1946  arginyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 		 609 aa  489  1e-137  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0612  arginyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 562 aa  488  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.954769  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0050  arginyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 		 564 aa  491  1e-137  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 584 aa  490  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 		 556 aa  490  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0077  arginyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 		 586 aa  491  1e-137  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0704  arginyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 		 575 aa  489  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281403 
 
 
-
 
NC_002936  DET1270  arginyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 556 aa  485  1e-136  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0106385  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0743  arginyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 		 550 aa  487  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 		 556 aa  485  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2114  arginyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 		 588 aa  486  1e-136  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1081  arginyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 556 aa  487  1e-136  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2239  arginyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 		 609 aa  488  1e-136  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.183357 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 559 aa  486  1e-136  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0170  arginyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 		 579 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0349  arginyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 		 579 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.87333 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1053  arginyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 556 aa  488  1e-136  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 		 556 aa  482  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 556 aa  482  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3866  arginyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 		 587 aa  483  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.42649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0027  arginyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 585 aa  484  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2774  arginyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 		 611 aa  482  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.744463  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 556 aa  480  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 		 557 aa  480  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 556 aa  480  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 556 aa  481  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 		 556 aa  481  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 		 556 aa  479  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 556 aa  480  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 556 aa  481  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2036  arginyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 561 aa  479  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.432071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 556 aa  481  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2343  arginyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 598 aa  472  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 		 568 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0720  arginyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 		 587 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2431  arginyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 598 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146297  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0247  arginyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 587 aa  466  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0358001  normal  0.157381 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1935  arginyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 564 aa  464  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000950947  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2288  arginyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 605 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.770548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2304  arginyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 		 561 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0307018  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1524  arginyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 598 aa  458  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0658423  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1137  arginyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 564 aa  457  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0701665  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1650  arginyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 546 aa  457  1e-127  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1723  arginyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 546 aa  458  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 553 aa  455  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 553 aa  454  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 553 aa  454  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1813  arginyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 585 aa  451  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0820  arginyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 561 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0474084  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1944  arginyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 575 aa  447  1.0000000000000001e-124  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.567724  normal  0.240014 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0903  arginyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 580 aa  442  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3194  arginyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 592 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 556 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06570  arginyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 575 aa  439  9.999999999999999e-123  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.645664 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1019  arginyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 		 563 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.637999  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1728  arginyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 581 aa  436  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.231273  normal  0.529501 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1807  arginyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 597 aa  436  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.738277 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1758  arginyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 597 aa  438  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1680  arginyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 585 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01700  arginyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 583 aa  436  1e-121  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000411406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1482  arginyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 585 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.747678  normal  0.431119 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4245  arginyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 586 aa  432  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0598  arginyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 553 aa  432  1e-120  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 		 562 aa  433  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2782  arginyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 557 aa  429  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.535695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1434  arginyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 569 aa  429  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0988806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2178  arginyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 590 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2508  arginyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 597 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0431095 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2351  arginyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 585 aa  430  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0749  arginyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 		 585 aa  427  1e-118  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0173421  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3935  arginyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 576 aa  426  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4423  arginyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 598 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.69944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0602  arginyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 561 aa  426  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.154913  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2710  arginyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 590 aa  425  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.568206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>