More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1507 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1588  arginyl-tRNA synthetase  69.48 
 
 		 580 aa  818    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.175533 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2767  arginyl-tRNA synthetase  56.26 
 
 		 583 aa  635    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0538697 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3935  arginyl-tRNA synthetase  57.84 
 
 		 576 aa  663    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1728  arginyl-tRNA synthetase  74.66 
 
 		 581 aa  885    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.231273  normal  0.529501 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0902  arginyl-tRNA synthetase  70.17 
 
 		 580 aa  815    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.09451  normal  0.0464581 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1807  arginyl-tRNA synthetase  57.39 
 
 		 597 aa  641    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.738277 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3022  arginyl-tRNA synthetase  57.73 
 
 		 583 aa  655    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2943  arginyl-tRNA synthetase  69.48 
 
 		 583 aa  818    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.201497  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1507  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 575 aa  1167    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.164187  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1758  arginyl-tRNA synthetase  56.73 
 
 		 597 aa  645    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0903  arginyl-tRNA synthetase  72.41 
 
 		 580 aa  844    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4245  arginyl-tRNA synthetase  58.19 
 
 		 586 aa  659    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1870  arginyl-tRNA synthetase  68.56 
 
 		 581 aa  778    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116057  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3194  arginyl-tRNA synthetase  55.35 
 
 		 592 aa  633  1e-180  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3587  arginyl-tRNA synthetase  56.57 
 
 		 594 aa  633  1e-180  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.170278  normal  0.919979 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2675  arginyl-tRNA synthetase  55.82 
 
 		 585 aa  633  1e-180  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135814  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2750  arginyl-tRNA synthetase  54.84 
 
 		 597 aa  630  1e-179  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292272  normal  0.122337 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3396  arginyl-tRNA synthetase  56.24 
 
 		 585 aa  629  1e-179  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.111317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3705  arginyl-tRNA synthetase  56.41 
 
 		 585 aa  631  1e-179  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.893232 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1158  arginyl-tRNA synthetase  54.86 
 
 		 585 aa  631  1e-179  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.381889  normal  0.900625 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2508  arginyl-tRNA synthetase  55.52 
 
 		 597 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0431095 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2795  arginyl-tRNA synthetase  55.18 
 
 		 597 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0417013  normal  0.0873054 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1680  arginyl-tRNA synthetase  54.97 
 
 		 585 aa  622  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1482  arginyl-tRNA synthetase  54.62 
 
 		 585 aa  623  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.747678  normal  0.431119 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2178  arginyl-tRNA synthetase  55.76 
 
 		 590 aa  619  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2480  arginyl-tRNA synthetase  57.17 
 
 		 586 aa  615  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.299544  normal  0.119664 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1138  arginyl-tRNA synthetase  55.96 
 
 		 575 aa  611  9.999999999999999e-175  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.596692 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4423  arginyl-tRNA synthetase  55.08 
 
 		 598 aa  610  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.69944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1779  arginyl-tRNA synthetase  54.48 
 
 		 592 aa  611  1e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0946273  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1813  arginyl-tRNA synthetase  54.28 
 
 		 585 aa  608  1e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2351  arginyl-tRNA synthetase  55.36 
 
 		 585 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0877  arginyl-tRNA synthetase  55.48 
 
 		 585 aa  598  1e-169  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1089  arginyl-tRNA synthetase  55.66 
 
 		 582 aa  598  1e-169  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2710  arginyl-tRNA synthetase  53.3 
 
 		 590 aa  597  1e-169  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.568206 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0495  arginyl-tRNA synthetase  54.5 
 
 		 598 aa  598  1e-169  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500043 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0949  arginyl-tRNA synthetase  54.62 
 
 		 596 aa  593  1e-168  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.53802  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0868  arginyl-tRNA synthetase  55.12 
 
 		 585 aa  590  1e-167  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0749  arginyl-tRNA synthetase  51.97 
 
 		 585 aa  591  1e-167  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0173421  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0443  arginyl-tRNA synthetase  53.02 
 
 		 597 aa  572  1.0000000000000001e-162  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0402  arginyl-tRNA synthetase  48 
 
 		 568 aa  565  1e-160  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0112  arginyl-tRNA synthetase  51.47 
 
 		 580 aa  561  1e-158  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0498  arginyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 576 aa  554  1e-156  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0537  arginyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 		 576 aa  552  1e-156  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0704  arginyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 575 aa  525  1e-148  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281403 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2343  arginyl-tRNA synthetase  48.3 
 
 		 598 aa  500  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2288  arginyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 		 605 aa  495  1e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.770548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2431  arginyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 		 598 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146297  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1524  arginyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 		 598 aa  491  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0658423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 554 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 554 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 		 586 aa  459  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 557 aa  444  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 584 aa  441  9.999999999999999e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0247  arginyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 587 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0358001  normal  0.157381 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 556 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0198  arginyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 592 aa  434  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 551 aa  430  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 551 aa  428  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 551 aa  426  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 586 aa  424  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  38.47 
 
 		 589 aa  422  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0742  arginyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 554 aa  422  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000856279  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 556 aa  424  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3183  arginyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 561 aa  425  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000169325  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 561 aa  424  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 559 aa  419  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 		 589 aa  417  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0648  arginyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 559 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0541152  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 556 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 551 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 556 aa  413  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 		 556 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 556 aa  414  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 556 aa  413  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 556 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 		 556 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 556 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 556 aa  413  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 556 aa  413  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2456  arginyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 598 aa  411  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 553 aa  411  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0049  arginyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 570 aa  410  1e-113  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 553 aa  411  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 		 551 aa  411  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 568 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  38.65 
 
 		 556 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0602  arginyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 561 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.154913  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2774  arginyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 611 aa  408  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.744463  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 553 aa  402  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0598  arginyl-tRNA synthetase  38.75 
 
 		 553 aa  404  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 570 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2109  arginyl-tRNA synthetase  37.05 
 
 		 592 aa  399  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.513959  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0743  arginyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 550 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0027  arginyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 		 585 aa  402  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4155  arginyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 553 aa  401  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.60572  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0820  arginyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 561 aa  401  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0474084  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 559 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6158  arginyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 550 aa  397  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2114  arginyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 		 588 aa  398  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0077  arginyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 		 586 aa  397  1e-109  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>