More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3935 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0902  arginyl-tRNA synthetase  58.97 
 
 		 580 aa  667    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.09451  normal  0.0464581 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3705  arginyl-tRNA synthetase  58.12 
 
 		 585 aa  637    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.893232 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1807  arginyl-tRNA synthetase  58.5 
 
 		 597 aa  649    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.738277 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2943  arginyl-tRNA synthetase  58.45 
 
 		 583 aa  674    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.201497  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4245  arginyl-tRNA synthetase  56.92 
 
 		 586 aa  643    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2750  arginyl-tRNA synthetase  57.12 
 
 		 597 aa  651    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292272  normal  0.122337 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1089  arginyl-tRNA synthetase  67.82 
 
 		 582 aa  763    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1507  arginyl-tRNA synthetase  57.84 
 
 		 575 aa  657    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.164187  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2508  arginyl-tRNA synthetase  58.06 
 
 		 597 aa  658    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0431095 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3022  arginyl-tRNA synthetase  58.42 
 
 		 583 aa  657    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2795  arginyl-tRNA synthetase  56.78 
 
 		 597 aa  644    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0417013  normal  0.0873054 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1758  arginyl-tRNA synthetase  58.84 
 
 		 597 aa  673    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2178  arginyl-tRNA synthetase  58.47 
 
 		 590 aa  645    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3396  arginyl-tRNA synthetase  57.95 
 
 		 585 aa  635    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.111317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0903  arginyl-tRNA synthetase  57.19 
 
 		 580 aa  638    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0112  arginyl-tRNA synthetase  65.8 
 
 		 580 aa  750    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1138  arginyl-tRNA synthetase  71.43 
 
 		 575 aa  796    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.596692 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3194  arginyl-tRNA synthetase  58.38 
 
 		 592 aa  653    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1588  arginyl-tRNA synthetase  58.62 
 
 		 580 aa  676    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.175533 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1158  arginyl-tRNA synthetase  56.41 
 
 		 585 aa  648    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.381889  normal  0.900625 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2710  arginyl-tRNA synthetase  57.56 
 
 		 590 aa  640    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.568206 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1728  arginyl-tRNA synthetase  58.52 
 
 		 581 aa  668    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.231273  normal  0.529501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3935  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 576 aa  1160    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1870  arginyl-tRNA synthetase  59.89 
 
 		 581 aa  662    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116057  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2480  arginyl-tRNA synthetase  58.53 
 
 		 586 aa  632  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.299544  normal  0.119664 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0495  arginyl-tRNA synthetase  57.5 
 
 		 598 aa  632  1e-180  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500043 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3587  arginyl-tRNA synthetase  56.52 
 
 		 594 aa  629  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.170278  normal  0.919979 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1482  arginyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 		 585 aa  631  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.747678  normal  0.431119 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2675  arginyl-tRNA synthetase  54.11 
 
 		 585 aa  626  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135814  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1680  arginyl-tRNA synthetase  54.11 
 
 		 585 aa  627  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2767  arginyl-tRNA synthetase  56.95 
 
 		 583 aa  626  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0538697 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4423  arginyl-tRNA synthetase  56.27 
 
 		 598 aa  621  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.69944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2351  arginyl-tRNA synthetase  53.42 
 
 		 585 aa  612  9.999999999999999e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1779  arginyl-tRNA synthetase  55.48 
 
 		 592 aa  608  1e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0946273  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1813  arginyl-tRNA synthetase  53.42 
 
 		 585 aa  608  1e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0749  arginyl-tRNA synthetase  51.71 
 
 		 585 aa  611  1e-173  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0173421  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0877  arginyl-tRNA synthetase  53.08 
 
 		 585 aa  605  1.0000000000000001e-171  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0868  arginyl-tRNA synthetase  52.91 
 
 		 585 aa  602  1.0000000000000001e-171  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0443  arginyl-tRNA synthetase  56.44 
 
 		 597 aa  588  1e-167  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0949  arginyl-tRNA synthetase  55.75 
 
 		 596 aa  578  1e-164  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.53802  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0402  arginyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 		 568 aa  537  1e-151  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0498  arginyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 576 aa  512  1e-144  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0537  arginyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 		 576 aa  512  1e-144  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2343  arginyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 598 aa  508  1e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2431  arginyl-tRNA synthetase  49.11 
 
 		 598 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146297  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2288  arginyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 		 605 aa  500  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.770548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1524  arginyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 		 598 aa  488  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0658423  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0704  arginyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 575 aa  484  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281403 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 		 554 aa  443  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 		 554 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 551 aa  432  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 551 aa  434  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0743  arginyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 550 aa  426  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 559 aa  426  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 551 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 		 551 aa  420  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 586 aa  417  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 556 aa  413  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 556 aa  414  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 		 556 aa  415  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 		 556 aa  414  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 		 556 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 584 aa  414  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0742  arginyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 554 aa  414  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000856279  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 556 aa  414  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 557 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 		 556 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 551 aa  415  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 556 aa  412  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 556 aa  412  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  44.46 
 
 		 556 aa  412  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0648  arginyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 559 aa  410  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0541152  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 556 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0198  arginyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 592 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 		 556 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 556 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0247  arginyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 587 aa  399  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0358001  normal  0.157381 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0049  arginyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 		 570 aa  397  1e-109  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3183  arginyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 561 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000169325  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 586 aa  393  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 570 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 		 589 aa  391  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 		 561 aa  387  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 		 589 aa  388  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2304  arginyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 		 561 aa  385  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0307018  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2109  arginyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 592 aa  384  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.513959  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0077  arginyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 586 aa  384  1e-105  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 568 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 		 553 aa  379  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1486  arginyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 		 550 aa  380  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2410  arginyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 560 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000917803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2181  arginyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 563 aa  380  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.264732  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0602  arginyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 561 aa  380  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.154913  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0027  arginyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 585 aa  375  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2114  arginyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 588 aa  376  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0050  arginyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 564 aa  376  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0612  arginyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 562 aa  374  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.954769  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2774  arginyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 611 aa  375  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.744463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 		 559 aa  374  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 553 aa  373  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>