More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1812 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 568 aa  1170    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0124  arginyl-tRNA synthetase  54.88 
 
 		 562 aa  640    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1434  arginyl-tRNA synthetase  77.86 
 
 		 569 aa  914    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0988806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1137  arginyl-tRNA synthetase  72.66 
 
 		 564 aa  841    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0701665  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0109  arginyl-tRNA synthetase  55.06 
 
 		 562 aa  642    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2304  arginyl-tRNA synthetase  77.01 
 
 		 561 aa  915    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0307018  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02918  arginyl-tRNA synthetase  58.44 
 
 		 562 aa  659    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  62.89 
 
 		 556 aa  698    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0602  arginyl-tRNA synthetase  58.9 
 
 		 561 aa  665    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.154913  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  57.9 
 
 		 562 aa  665    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0820  arginyl-tRNA synthetase  60.64 
 
 		 561 aa  689    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0474084  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1019  arginyl-tRNA synthetase  69.45 
 
 		 563 aa  805    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.637999  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2782  arginyl-tRNA synthetase  55.61 
 
 		 557 aa  633  1e-180  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.535695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0153  arginyl-tRNA synthetase  57.12 
 
 		 561 aa  623  1e-177  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3701  arginyl-tRNA synthetase  55.99 
 
 		 558 aa  615  1e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4490  arginyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 		 561 aa  616  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.703488 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0188  arginyl-tRNA synthetase  55.22 
 
 		 594 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0385  arginyl-tRNA synthetase  54.22 
 
 		 598 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603012  normal  0.077689 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0430  arginyl-tRNA synthetase  52.89 
 
 		 594 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0355  arginyl-tRNA synthetase  53.06 
 
 		 594 aa  608  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0773  arginyl-tRNA synthetase  54.74 
 
 		 565 aa  610  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0332  arginyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 567 aa  609  1e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.960888  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0410  arginyl-tRNA synthetase  52.89 
 
 		 594 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2291  arginyl-tRNA synthetase  52.72 
 
 		 594 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0084  arginyl-tRNA synthetase  52.72 
 
 		 594 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.72933  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1997  arginyl-tRNA synthetase  52.72 
 
 		 594 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0592  arginyl-tRNA synthetase  52.72 
 
 		 594 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597736  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3099  arginyl-tRNA synthetase  52.72 
 
 		 594 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4245  arginyl-tRNA synthetase  55.52 
 
 		 596 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0096  arginyl-tRNA synthetase  51.83 
 
 		 602 aa  606  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0343  arginyl-tRNA synthetase  55.37 
 
 		 577 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.401675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2831  arginyl-tRNA synthetase  53.57 
 
 		 593 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0127  arginyl-tRNA synthetase  54.59 
 
 		 595 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0473  arginyl-tRNA synthetase  54.98 
 
 		 596 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.274692 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2968  arginyl-tRNA synthetase  53.23 
 
 		 593 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2934  arginyl-tRNA synthetase  53.47 
 
 		 593 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0573  arginyl-tRNA synthetase  54.06 
 
 		 569 aa  598  1e-170  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2305  arginyl-tRNA synthetase  53.47 
 
 		 593 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0414  arginyl-tRNA synthetase  52.9 
 
 		 569 aa  598  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.872884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2919  arginyl-tRNA synthetase  53.47 
 
 		 593 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6262  arginyl-tRNA synthetase  53.47 
 
 		 593 aa  597  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0461  arginyl-tRNA synthetase  53.29 
 
 		 561 aa  595  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185336  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0669  arginyl-tRNA synthetase  53.44 
 
 		 565 aa  593  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4230  arginyl-tRNA synthetase  53.8 
 
 		 561 aa  592  1e-168  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.228794 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0145  arginyl-tRNA synthetase  54.02 
 
 		 596 aa  587  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  53.62 
 
 		 554 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0137  arginyl-tRNA synthetase  53.85 
 
 		 596 aa  585  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  53.26 
 
 		 554 aa  581  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0287  arginyl-tRNA synthetase  52.75 
 
 		 600 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1686  arginyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 		 575 aa  550  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0742  arginyl-tRNA synthetase  50.53 
 
 		 554 aa  536  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000856279  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1977  arginyl-tRNA synthetase  51.87 
 
 		 575 aa  524  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 		 556 aa  496  1e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 556 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 		 570 aa  488  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 		 556 aa  485  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 		 556 aa  485  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 556 aa  482  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 556 aa  484  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 556 aa  483  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 556 aa  482  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 556 aa  483  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 556 aa  483  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 556 aa  480  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 561 aa  479  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 		 556 aa  481  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 556 aa  478  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2181  arginyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 		 563 aa  477  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.264732  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 557 aa  475  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0648  arginyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 		 559 aa  474  1e-132  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0541152  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1486  arginyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 550 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 		 559 aa  469  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2410  arginyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 		 560 aa  468  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000917803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0247  arginyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 587 aa  466  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0358001  normal  0.157381 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 		 584 aa  463  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 551 aa  462  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 586 aa  464  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 551 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 553 aa  457  1e-127  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 		 586 aa  458  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 		 551 aa  457  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2456  arginyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 598 aa  458  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2109  arginyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 592 aa  452  1.0000000000000001e-126  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.513959  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 589 aa  453  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0612  arginyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 562 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.954769  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3183  arginyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 561 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000169325  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0077  arginyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 586 aa  453  1.0000000000000001e-126  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0285  arginyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 564 aa  450  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0318968  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 		 551 aa  451  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1935  arginyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 564 aa  450  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000950947  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0050  arginyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 564 aa  449  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 559 aa  449  1e-125  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 553 aa  448  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 589 aa  448  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1723  arginyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 546 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 553 aa  448  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  44.73 
 
 		 551 aa  443  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0170  arginyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 579 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0349  arginyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 579 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.87333 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0198  arginyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 592 aa  436  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>