More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2767 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1482  arginyl-tRNA synthetase  60.48 
 
 
585 aa  714    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.747678  normal  0.431119 
 
 
-
 
NC_004310  BR0877  arginyl-tRNA synthetase  58.6 
 
 
585 aa  672    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2675  arginyl-tRNA synthetase  59.97 
 
 
585 aa  703    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135814  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2178  arginyl-tRNA synthetase  80.03 
 
 
590 aa  927    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2710  arginyl-tRNA synthetase  64.97 
 
 
590 aa  739    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.568206 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3194  arginyl-tRNA synthetase  64.69 
 
 
592 aa  754    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1807  arginyl-tRNA synthetase  64.52 
 
 
597 aa  736    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.738277 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1680  arginyl-tRNA synthetase  60.14 
 
 
585 aa  714    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21246  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0868  arginyl-tRNA synthetase  58.09 
 
 
585 aa  664    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2943  arginyl-tRNA synthetase  58.56 
 
 
583 aa  657    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.201497  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2351  arginyl-tRNA synthetase  58.43 
 
 
585 aa  673    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4423  arginyl-tRNA synthetase  64.3 
 
 
598 aa  743    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.69944  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3396  arginyl-tRNA synthetase  82.39 
 
 
585 aa  949    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.111317  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3587  arginyl-tRNA synthetase  80.64 
 
 
594 aa  936    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.170278  normal  0.919979 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2750  arginyl-tRNA synthetase  63.84 
 
 
597 aa  750    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292272  normal  0.122337 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0495  arginyl-tRNA synthetase  65.31 
 
 
598 aa  732    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500043 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2508  arginyl-tRNA synthetase  63.33 
 
 
597 aa  716    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0431095 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3705  arginyl-tRNA synthetase  82.56 
 
 
585 aa  950    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.893232 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2767  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
583 aa  1169    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0538697 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1728  arginyl-tRNA synthetase  58.29 
 
 
581 aa  671    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.231273  normal  0.529501 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1588  arginyl-tRNA synthetase  58.73 
 
 
580 aa  659    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.175533 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0902  arginyl-tRNA synthetase  58.73 
 
 
580 aa  653    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.09451  normal  0.0464581 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2795  arginyl-tRNA synthetase  64.01 
 
 
597 aa  753    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0417013  normal  0.0873054 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1758  arginyl-tRNA synthetase  64.01 
 
 
597 aa  739    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2480  arginyl-tRNA synthetase  79.05 
 
 
586 aa  898    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.299544  normal  0.119664 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0903  arginyl-tRNA synthetase  57.63 
 
 
580 aa  654    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1813  arginyl-tRNA synthetase  61.02 
 
 
585 aa  695    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1158  arginyl-tRNA synthetase  60.31 
 
 
585 aa  701    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.381889  normal  0.900625 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0749  arginyl-tRNA synthetase  53.3 
 
 
585 aa  635    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0173421  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3022  arginyl-tRNA synthetase  61.71 
 
 
583 aa  700    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184997  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4245  arginyl-tRNA synthetase  64.12 
 
 
586 aa  716    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1870  arginyl-tRNA synthetase  59.93 
 
 
581 aa  639    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116057  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1779  arginyl-tRNA synthetase  57.26 
 
 
592 aa  629  1e-179  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0946273  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1507  arginyl-tRNA synthetase  56.26 
 
 
575 aa  625  1e-178  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.164187  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3935  arginyl-tRNA synthetase  56.95 
 
 
576 aa  626  1e-178  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0443  arginyl-tRNA synthetase  55.02 
 
 
597 aa  587  1e-166  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1138  arginyl-tRNA synthetase  54.48 
 
 
575 aa  579  1e-164  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.596692 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1089  arginyl-tRNA synthetase  54.93 
 
 
582 aa  571  1e-161  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0402  arginyl-tRNA synthetase  47 
 
 
568 aa  552  1e-156  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0112  arginyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 
580 aa  537  1e-151  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0949  arginyl-tRNA synthetase  53.62 
 
 
596 aa  530  1e-149  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.53802  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0498  arginyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
576 aa  525  1e-147  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0537  arginyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 
576 aa  520  1e-146  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2343  arginyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 
598 aa  482  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2431  arginyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 
598 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146297  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2288  arginyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 
605 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.770548  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0704  arginyl-tRNA synthetase  44.59 
 
 
575 aa  470  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.281403 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1524  arginyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 
598 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0658423  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 
557 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
554 aa  434  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 
554 aa  434  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 
556 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  46.75 
 
 
551 aa  428  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 
556 aa  422  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  40 
 
 
589 aa  419  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 
559 aa  421  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 
589 aa  416  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
551 aa  419  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 
551 aa  415  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0598  arginyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 
553 aa  412  1e-114  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 
556 aa  411  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 
556 aa  410  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 
556 aa  409  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0742  arginyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 
554 aa  410  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000856279  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 
556 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 
551 aa  410  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 
556 aa  411  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0743  arginyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 
550 aa  409  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 
553 aa  409  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 
556 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 
556 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 
556 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 
556 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 
556 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 
584 aa  409  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 
586 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 
556 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 
586 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0648  arginyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 
559 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0541152  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 
551 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 
553 aa  398  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0027  arginyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 
585 aa  395  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0247  arginyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 
587 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0358001  normal  0.157381 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 
553 aa  398  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0049  arginyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 
570 aa  395  1e-108  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4155  arginyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 
553 aa  387  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.60572  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29980  arginyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 
551 aa  387  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.661681  normal  0.169962 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0198  arginyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 
592 aa  385  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2456  arginyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 
598 aa  384  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3183  arginyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 
561 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000169325  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1659  arginyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 
543 aa  383  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.826444  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1486  arginyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 
550 aa  384  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 
561 aa  383  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 
559 aa  382  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0332  arginyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 
567 aa  376  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.960888  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 
562 aa  377  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 
570 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0170  arginyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 
579 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2410  arginyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 
560 aa  379  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000917803  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0349  arginyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 
579 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.87333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>