More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1053 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1270  arginyl-tRNA synthetase  98.92 
 
 		 556 aa  1144    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0106385  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1081  arginyl-tRNA synthetase  93.71 
 
 		 556 aa  1071    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1053  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 556 aa  1152    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2410  arginyl-tRNA synthetase  50.66 
 
 		 560 aa  545  1e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000917803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0285  arginyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 564 aa  523  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0318968  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1935  arginyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 		 564 aa  518  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000950947  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 		 561 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 570 aa  503  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 		 556 aa  499  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1486  arginyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 550 aa  499  1e-140  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0648  arginyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 		 559 aa  498  1e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0541152  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2181  arginyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 		 563 aa  496  1e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.264732  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 559 aa  497  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 		 556 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 		 556 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 		 556 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 		 556 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 556 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 		 559 aa  494  9.999999999999999e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 		 556 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 		 556 aa  491  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 		 556 aa  490  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 		 556 aa  491  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 		 556 aa  491  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0612  arginyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 562 aa  479  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.954769  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 		 557 aa  481  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 556 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3183  arginyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 561 aa  473  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000169325  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2036  arginyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 		 561 aa  472  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.432071  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0050  arginyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 564 aa  473  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 589 aa  469  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0742  arginyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 554 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000856279  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 589 aa  468  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 586 aa  465  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  44.32 
 
 		 554 aa  462  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 554 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 584 aa  459  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1723  arginyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 546 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1650  arginyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 		 546 aa  450  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0198  arginyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 		 592 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2456  arginyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 		 598 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 		 586 aa  444  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 553 aa  442  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 553 aa  442  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0704  arginyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 		 575 aa  444  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281403 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 		 551 aa  442  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1944  arginyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 575 aa  441  9.999999999999999e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.567724  normal  0.240014 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2109  arginyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 592 aa  439  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.513959  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 553 aa  438  1e-121  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 		 556 aa  437  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0077  arginyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 		 586 aa  436  1e-121  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01700  arginyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 583 aa  432  1e-120  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000411406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 551 aa  433  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2774  arginyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 611 aa  433  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.744463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0170  arginyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 579 aa  430  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 551 aa  430  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3866  arginyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 		 587 aa  429  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.42649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 551 aa  430  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0349  arginyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 579 aa  430  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.87333 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 568 aa  425  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06570  arginyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 575 aa  422  1e-117  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.645664 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0247  arginyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 		 587 aa  422  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0358001  normal  0.157381 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2288  arginyl-tRNA synthetase  37.31 
 
 		 605 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.770548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0820  arginyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 561 aa  420  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0474084  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0720  arginyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 587 aa  419  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2114  arginyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 		 588 aa  419  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1742  arginyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 522 aa  421  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4155  arginyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 553 aa  417  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.60572  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 551 aa  413  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0405  arginyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 		 542 aa  410  1e-113  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 		 562 aa  409  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0027  arginyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 585 aa  412  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0529  arginyl-tRNA synthetase  38.09 
 
 		 614 aa  409  1e-113  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000661895 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0602  arginyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 		 561 aa  409  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.154913  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0294  arginyl-tRNA synthetase  37.46 
 
 		 609 aa  411  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0628  arginyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 		 562 aa  409  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0559225  decreased coverage  0.00224273 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1654  arginyl-tRNA synthetase  37.75 
 
 		 549 aa  407  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0671403  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0598  arginyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 		 553 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1482  arginyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 585 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.747678  normal  0.431119 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1137  arginyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 		 564 aa  403  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0701665  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1680  arginyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 585 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2296  arginyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 		 550 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.847928 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1946  arginyl-tRNA synthetase  36.47 
 
 		 609 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2343  arginyl-tRNA synthetase  35.37 
 
 		 598 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2431  arginyl-tRNA synthetase  35.37 
 
 		 598 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146297  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0903  arginyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 		 580 aa  399  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1004  arginyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 570 aa  401  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29980  arginyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 551 aa  395  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.661681  normal  0.169962 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2304  arginyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 		 561 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0307018  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2239  arginyl-tRNA synthetase  36.41 
 
 		 609 aa  398  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.183357 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0743  arginyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 550 aa  397  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6158  arginyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 550 aa  397  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2943  arginyl-tRNA synthetase  37.44 
 
 		 583 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.201497  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1524  arginyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 		 598 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0658423  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 		 556 aa  392  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0124  arginyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 562 aa  393  1e-108  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02918  arginyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 		 562 aa  393  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1588  arginyl-tRNA synthetase  37.44 
 
 		 580 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.175533 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3653  arginyl-tRNA synthetase  40.26 
 
 		 554 aa  394  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1507  arginyl-tRNA synthetase  37.7 
 
 		 575 aa  389  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.164187  normal  0.602608 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>