More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0632 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0632  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
564 aa  1144    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2238  arginyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 
551 aa  534  1e-150  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.361874  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2879  arginyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 
552 aa  529  1e-149  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2487  arginyl-tRNA synthetase  48.61 
 
 
553 aa  521  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.619732  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2702  arginyl-tRNA synthetase  50.27 
 
 
551 aa  522  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.261036  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2092  arginyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 
552 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2484  arginyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 
551 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00470527  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0070  arginyl-tRNA synthetase  50.82 
 
 
552 aa  511  1e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0648  arginyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 
559 aa  472  1e-132  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0541152  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 
586 aa  473  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 
589 aa  469  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 
589 aa  468  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2181  arginyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 
563 aa  468  9.999999999999999e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.264732  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 
556 aa  465  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0247  arginyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 
587 aa  455  1e-127  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0358001  normal  0.157381 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 
557 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0198  arginyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 
592 aa  449  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 
559 aa  452  1e-125  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 
586 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 
554 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1723  arginyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 
546 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 
561 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 
570 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 
554 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0742  arginyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 
554 aa  443  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000856279  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3183  arginyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 
561 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000169325  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 
584 aa  442  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 
556 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0349  arginyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 
579 aa  442  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.87333 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2304  arginyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 
561 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0307018  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1486  arginyl-tRNA synthetase  39.03 
 
 
550 aa  441  9.999999999999999e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0170  arginyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 
579 aa  442  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 
556 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 
556 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1650  arginyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 
546 aa  442  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1935  arginyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 
564 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000950947  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 
568 aa  437  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 
556 aa  438  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 
556 aa  438  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 
556 aa  438  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 
556 aa  437  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 
556 aa  438  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 
556 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2114  arginyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 
588 aa  436  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0050  arginyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 
564 aa  437  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 
556 aa  432  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 
556 aa  435  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 
562 aa  432  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0612  arginyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 
562 aa  433  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.954769  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1659  arginyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 
543 aa  434  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.826444  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 
559 aa  435  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 
553 aa  429  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 
553 aa  429  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0077  arginyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 
586 aa  431  1e-119  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2410  arginyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 
560 aa  431  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000917803  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2109  arginyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 
592 aa  430  1e-119  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.513959  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0405  arginyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 
542 aa  429  1e-119  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1019  arginyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
563 aa  429  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.637999  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 
553 aa  428  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1434  arginyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 
569 aa  427  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0988806  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2774  arginyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 
611 aa  428  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.744463  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0820  arginyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 
561 aa  426  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0474084  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
551 aa  424  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
556 aa  425  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 
556 aa  422  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29980  arginyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 
551 aa  419  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.661681  normal  0.169962 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2036  arginyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 
561 aa  421  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.432071  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1137  arginyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 
564 aa  420  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0701665  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4155  arginyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 
553 aa  417  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.60572  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 
551 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0285  arginyl-tRNA synthetase  41.17 
 
 
564 aa  413  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0318968  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02918  arginyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 
562 aa  414  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0720  arginyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 
587 aa  409  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2456  arginyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 
598 aa  411  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 
551 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0602  arginyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 
561 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.154913  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0704  arginyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 
575 aa  407  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.281403 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 
551 aa  403  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6158  arginyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 
550 aa  403  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2343  arginyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 
598 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11319  arginyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 
550 aa  402  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4490  arginyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
561 aa  403  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.703488 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0109  arginyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 
562 aa  402  1e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 
551 aa  402  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0124  arginyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 
562 aa  402  1e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0137  arginyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 
596 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0598  arginyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 
553 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1946  arginyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 
609 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2431  arginyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 
598 aa  402  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146297  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2943  arginyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 
583 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.201497  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1728  arginyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 
581 aa  401  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.231273  normal  0.529501 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0573  arginyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 
569 aa  400  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0096  arginyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 
602 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0332  arginyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 
567 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.960888  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0343  arginyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 
577 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.401675  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2296  arginyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
550 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.847928 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0145  arginyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 
596 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4350  arginyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 
550 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301994 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0027  arginyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 
585 aa  397  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0743  arginyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 
550 aa  397  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>