More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2879 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_2092  arginyl-tRNA synthetase  73.73 
 
 		 552 aa  837    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0070  arginyl-tRNA synthetase  75 
 
 		 552 aa  832    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2487  arginyl-tRNA synthetase  70.34 
 
 		 553 aa  803    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.619732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2484  arginyl-tRNA synthetase  74.82 
 
 		 551 aa  860    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00470527  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2238  arginyl-tRNA synthetase  71.92 
 
 		 551 aa  811    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.361874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2702  arginyl-tRNA synthetase  75.72 
 
 		 551 aa  832    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.261036  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2879  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 552 aa  1139    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0632  arginyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 		 564 aa  521  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2410  arginyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 560 aa  422  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000917803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 559 aa  420  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0742  arginyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 554 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000856279  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0648  arginyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 559 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0541152  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 554 aa  414  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 554 aa  412  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 		 589 aa  406  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  39.85 
 
 		 556 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 		 589 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 		 561 aa  403  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 		 586 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 		 551 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 		 584 aa  400  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2456  arginyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 598 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3183  arginyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 		 561 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000169325  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 559 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2181  arginyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 563 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.264732  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1935  arginyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 		 564 aa  399  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000950947  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0050  arginyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 		 564 aa  397  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 586 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 556 aa  392  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 556 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 556 aa  392  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 556 aa  391  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1723  arginyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 546 aa  389  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  38.39 
 
 		 557 aa  392  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 551 aa  391  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0198  arginyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 		 592 aa  389  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 556 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  37.48 
 
 		 570 aa  392  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 556 aa  391  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1650  arginyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 546 aa  389  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 556 aa  391  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0602  arginyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 561 aa  390  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.154913  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 		 553 aa  389  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 556 aa  391  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 		 553 aa  389  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 		 556 aa  392  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0027  arginyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 		 585 aa  386  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  38.39 
 
 		 556 aa  389  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 556 aa  388  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 		 553 aa  383  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2114  arginyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 588 aa  382  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1137  arginyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 564 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0701665  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 551 aa  385  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1944  arginyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 		 575 aa  383  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.567724  normal  0.240014 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2109  arginyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 592 aa  384  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.513959  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 562 aa  383  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0077  arginyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 586 aa  384  1e-105  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  37.75 
 
 		 556 aa  382  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2774  arginyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 611 aa  379  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.744463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0285  arginyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 564 aa  382  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0318968  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 568 aa  378  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2036  arginyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 		 561 aa  374  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.432071  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06570  arginyl-tRNA synthetase  36.17 
 
 		 575 aa  373  1e-102  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.645664 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3866  arginyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 		 587 aa  372  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.42649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1486  arginyl-tRNA synthetase  37.57 
 
 		 550 aa  374  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0405  arginyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 		 542 aa  372  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0612  arginyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 562 aa  371  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.954769  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0247  arginyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 		 587 aa  372  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0358001  normal  0.157381 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2304  arginyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 		 561 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0307018  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1019  arginyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 		 563 aa  372  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.637999  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 551 aa  371  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0720  arginyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 587 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01700  arginyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 		 583 aa  367  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000411406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1654  arginyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 		 549 aa  368  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0671403  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0743  arginyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 550 aa  365  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 		 551 aa  365  2e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 		 556 aa  364  3e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0109  arginyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 562 aa  363  6e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1659  arginyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 		 543 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.826444  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0124  arginyl-tRNA synthetase  37.59 
 
 		 562 aa  361  2e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0820  arginyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 		 561 aa  360  3e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0474084  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02918  arginyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 		 562 aa  360  3e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0294  arginyl-tRNA synthetase  37.59 
 
 		 609 aa  358  9.999999999999999e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0170  arginyl-tRNA synthetase  36.05 
 
 		 579 aa  356  5.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0349  arginyl-tRNA synthetase  36.05 
 
 		 579 aa  356  5.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.87333 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2343  arginyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 		 598 aa  352  7e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0704  arginyl-tRNA synthetase  37.25 
 
 		 575 aa  352  8e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281403 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2431  arginyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 598 aa  351  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146297  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2288  arginyl-tRNA synthetase  35.74 
 
 		 605 aa  351  2e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.770548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1053  arginyl-tRNA synthetase  36.43 
 
 		 556 aa  351  2e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1434  arginyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 		 569 aa  351  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0988806  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1270  arginyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 		 556 aa  350  3e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0106385  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0598  arginyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 		 553 aa  350  4e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6158  arginyl-tRNA synthetase  36.41 
 
 		 550 aa  349  6e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1899  arginyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 550 aa  348  1e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2239  arginyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 		 609 aa  344  2.9999999999999997e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.183357 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3194  arginyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 		 592 aa  343  5e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2782  arginyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 557 aa  342  1e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.535695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2296  arginyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 550 aa  342  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.847928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1004  arginyl-tRNA synthetase  37.03 
 
 		 570 aa  341  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>