More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2296 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1228  arginyl-tRNA synthetase  70.73 
 
 		 550 aa  803    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2296  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 550 aa  1114    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.847928 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09800  arginyl-tRNA synthetase  61.72 
 
 		 559 aa  674    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0453043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6158  arginyl-tRNA synthetase  65.82 
 
 		 550 aa  754    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4350  arginyl-tRNA synthetase  91.27 
 
 		 550 aa  1017    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301994 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2467  arginyl-tRNA synthetase  61.81 
 
 		 566 aa  664    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0465289  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29980  arginyl-tRNA synthetase  67.33 
 
 		 551 aa  756    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.661681  normal  0.169962 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11319  arginyl-tRNA synthetase  82.91 
 
 		 550 aa  940    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4155  arginyl-tRNA synthetase  62.09 
 
 		 553 aa  694    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.60572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3972  arginyl-tRNA synthetase  85.82 
 
 		 550 aa  969    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1899  arginyl-tRNA synthetase  73.64 
 
 		 550 aa  822    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1052  arginyl-tRNA synthetase  61.79 
 
 		 560 aa  667    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4035  arginyl-tRNA synthetase  61.37 
 
 		 554 aa  693    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.205832  hitchhiker  0.00704959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3884  arginyl-tRNA synthetase  85.45 
 
 		 550 aa  963    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.103344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3653  arginyl-tRNA synthetase  62.09 
 
 		 554 aa  705    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3898  arginyl-tRNA synthetase  85.82 
 
 		 550 aa  969    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0879275  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5548  arginyl-tRNA synthetase  58.7 
 
 		 550 aa  651    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598965  normal  0.0339829 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1250  arginyl-tRNA synthetase  61.01 
 
 		 554 aa  679    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0409478  normal  0.0986355 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2092  arginyl-tRNA synthetase  64.78 
 
 		 551 aa  671    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000567814  normal  0.0511831 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1742  arginyl-tRNA synthetase  58.81 
 
 		 522 aa  632  1e-180  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1793  arginyl-tRNA synthetase  58.47 
 
 		 558 aa  613  9.999999999999999e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0628  arginyl-tRNA synthetase  55.98 
 
 		 562 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0559225  decreased coverage  0.00224273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1004  arginyl-tRNA synthetase  54.37 
 
 		 570 aa  598  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1197  arginyl-tRNA synthetase  53.42 
 
 		 556 aa  582  1.0000000000000001e-165  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0195  arginine--tRNA ligase  50.17 
 
 		 598 aa  568  1e-161  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2625  arginyl-tRNA synthetase  50.9 
 
 		 554 aa  556  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.657674  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18400  arginyl-tRNA synthetase  50.36 
 
 		 547 aa  552  1e-156  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.25654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1605  arginyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 		 620 aa  550  1e-155  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2358  arginyl-tRNA synthetase  50.54 
 
 		 554 aa  551  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000260389 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08000  arginyl-tRNA synthetase  50.89 
 
 		 556 aa  533  1e-150  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00405045  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 556 aa  438  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 561 aa  435  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 		 556 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0602  arginyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 561 aa  432  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.154913  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 553 aa  431  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 553 aa  431  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0648  arginyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 559 aa  431  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0541152  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 		 557 aa  432  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 553 aa  427  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 551 aa  428  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 		 551 aa  427  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 554 aa  422  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 554 aa  423  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0820  arginyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 561 aa  425  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0474084  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01700  arginyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 583 aa  420  1e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000411406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2181  arginyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 563 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.264732  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 551 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 556 aa  413  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 556 aa  415  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 556 aa  412  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 556 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0050  arginyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 564 aa  412  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 559 aa  415  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 556 aa  411  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 556 aa  412  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 556 aa  411  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06570  arginyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 		 575 aa  409  1e-113  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.645664 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 556 aa  412  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 		 586 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3183  arginyl-tRNA synthetase  40.22 
 
 		 561 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000169325  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 562 aa  409  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0124  arginyl-tRNA synthetase  41.17 
 
 		 562 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 556 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 586 aa  404  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 556 aa  402  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0529  arginyl-tRNA synthetase  39.87 
 
 		 614 aa  403  1e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000661895 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0109  arginyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 562 aa  405  1e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 570 aa  405  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 556 aa  405  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 551 aa  403  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 559 aa  402  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 568 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0385  arginyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 598 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603012  normal  0.077689 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0743  arginyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 550 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2410  arginyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 560 aa  400  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000917803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1659  arginyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 543 aa  400  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.826444  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 551 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0247  arginyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 587 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0358001  normal  0.157381 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0430  arginyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 594 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0410  arginyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 594 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 589 aa  398  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02918  arginyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 562 aa  396  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1944  arginyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 575 aa  397  1e-109  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.567724  normal  0.240014 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0742  arginyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 554 aa  396  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000856279  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0573  arginyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 569 aa  396  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0285  arginyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 564 aa  395  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0318968  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0084  arginyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 594 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.72933  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 		 589 aa  395  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1053  arginyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 		 556 aa  392  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0592  arginyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 594 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597736  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1434  arginyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 569 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0988806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2304  arginyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 561 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0307018  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3099  arginyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 594 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 556 aa  395  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1686  arginyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 		 575 aa  394  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1997  arginyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 594 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2291  arginyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 594 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1137  arginyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 564 aa  391  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0701665  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1935  arginyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 		 564 aa  390  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000950947  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2036  arginyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 		 561 aa  391  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.432071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>