More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0329 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2451  arginyl-tRNA synthetase  71.52 
 
 		 612 aa  872    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0329  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 613 aa  1246    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1036  arginyl-tRNA synthetase  51.71 
 
 		 628 aa  615  1e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475054 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0686  arginyl-tRNA synthetase  33.71 
 
 		 628 aa  279  9e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2032  arginyl-tRNA synthetase  32.15 
 
 		 647 aa  266  5.999999999999999e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1102  arginyl-tRNA synthetase  31.02 
 
 		 574 aa  251  2e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0216  arginyl-tRNA synthetase  31.57 
 
 		 558 aa  250  7e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2213  arginyl-tRNA synthetase  32.03 
 
 		 555 aa  248  3e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0271  arginyl-tRNA synthetase  31.77 
 
 		 558 aa  246  9e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  31.04 
 
 		 565 aa  238  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  31.21 
 
 		 565 aa  238  2e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2837  arginyl-tRNA synthetase  31.16 
 
 		 555 aa  237  4e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0222286 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1508  arginyl-tRNA synthetase  30.21 
 
 		 558 aa  237  4e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.818041  normal  0.873479 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0350  arginyl-tRNA synthetase  30.54 
 
 		 569 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0288  arginyl-tRNA synthetase  32.72 
 
 		 559 aa  234  3e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.124809 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1008  arginyl-tRNA synthetase  29.98 
 
 		 569 aa  234  3e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0564  arginyl-tRNA synthetase  28.28 
 
 		 635 aa  232  1e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0568  arginyl-tRNA synthetase  30.5 
 
 		 566 aa  232  2e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.078202  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1633  arginyl-tRNA synthetase  30.74 
 
 		 566 aa  231  3e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1739  arginyl-tRNA synthetase  30.58 
 
 		 567 aa  229  1e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0268  arginyl-tRNA synthetase  30.33 
 
 		 566 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.107833  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0562  arginyl-tRNA synthetase  29.31 
 
 		 550 aa  224  4e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1577  arginyl-tRNA synthetase  29.16 
 
 		 621 aa  223  8e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.879493  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 		 565 aa  222  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0441  arginyl-tRNA synthetase  29.71 
 
 		 629 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  30.54 
 
 		 590 aa  216  9.999999999999999e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0586  arginyl-tRNA synthetase  30.86 
 
 		 632 aa  211  4e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000562405 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3474  arginyl-tRNA synthetase  31.64 
 
 		 580 aa  210  7e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387689  normal  0.108328 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1270  arginyl-tRNA synthetase  29.34 
 
 		 562 aa  207  3e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000463651  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  27.62 
 
 		 565 aa  207  3e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2678  arginyl-tRNA synthetase  29.23 
 
 		 592 aa  206  9e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  27 
 
 		 566 aa  206  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1715  arginyl-tRNA synthetase  27.89 
 
 		 619 aa  206  1e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  27.53 
 
 		 566 aa  205  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3171  arginyl-tRNA synthetase  28.79 
 
 		 595 aa  205  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2012  arginyl-tRNA synthetase  28.95 
 
 		 583 aa  204  5e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.750372  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1756  arginyl-tRNA synthetase  30.97 
 
 		 630 aa  203  7e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0324309  hitchhiker  0.00414873 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1535  arginyl-tRNA synthetase  27.81 
 
 		 624 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1291  arginyl-tRNA synthetase  29.32 
 
 		 591 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.456077  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1846  arginyl-tRNA synthetase  26.84 
 
 		 625 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0169  arginyl-tRNA synthetase  27.96 
 
 		 602 aa  198  3e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2379  arginyl-tRNA synthetase  28.76 
 
 		 579 aa  197  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222047  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1577  arginyl-tRNA synthetase  30.39 
 
 		 635 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1420  arginyl-tRNA synthetase  28.74 
 
 		 600 aa  196  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.435817  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  29.09 
 
 		 564 aa  196  1e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  28.74 
 
 		 562 aa  193  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2318  arginyl-tRNA synthetase  28.73 
 
 		 593 aa  193  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.291854 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2442  arginyl-tRNA synthetase  28.08 
 
 		 577 aa  192  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  28.74 
 
 		 562 aa  191  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  29.97 
 
 		 563 aa  191  4e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  28.09 
 
 		 562 aa  190  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1971  arginyl-tRNA synthetase  27.53 
 
 		 577 aa  190  8e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0438  arginyl-tRNA synthetase  28.77 
 
 		 601 aa  189  9e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01847  arginyl-tRNA synthetase  27.53 
 
 		 577 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1764  arginyl-tRNA synthetase  27.53 
 
 		 577 aa  189  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  28.38 
 
 		 562 aa  189  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01836  hypothetical protein  27.53 
 
 		 577 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1756  arginyl-tRNA synthetase  27.53 
 
 		 577 aa  188  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2108  arginyl-tRNA synthetase  27.53 
 
 		 577 aa  188  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1310  arginyl-tRNA synthetase  27.53 
 
 		 577 aa  189  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363287 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  27.71 
 
 		 562 aa  188  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2613  arginyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 		 577 aa  188  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253751 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2169  arginyl-tRNA synthetase  27.37 
 
 		 577 aa  187  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  27.76 
 
 		 562 aa  187  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2069  arginyl-tRNA synthetase  26.2 
 
 		 577 aa  187  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205082 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  27.76 
 
 		 562 aa  187  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2084  arginyl-tRNA synthetase  27.46 
 
 		 576 aa  187  6e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2064  arginyl-tRNA synthetase  26.2 
 
 		 577 aa  187  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.10003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2124  arginyl-tRNA synthetase  26.2 
 
 		 577 aa  187  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  hitchhiker  0.0000003636 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1213  arginyl-tRNA synthetase  26.2 
 
 		 577 aa  186  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0899  arginyl-tRNA synthetase  27.41 
 
 		 566 aa  186  1.0000000000000001e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0249713  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 562 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05910  arginyl-tRNA synthetase  27.31 
 
 		 592 aa  185  2.0000000000000003e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0039  arginyl-tRNA synthetase  29.14 
 
 		 599 aa  184  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285018  normal  0.0776701 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1807  arginyl-tRNA synthetase  27.5 
 
 		 576 aa  185  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.426497  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1215  arginyl-tRNA synthetase  29.53 
 
 		 563 aa  184  3e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1337  arginyl-tRNA synthetase  26.04 
 
 		 577 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014051 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0186  arginyl-tRNA synthetase  27.44 
 
 		 597 aa  184  4.0000000000000006e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  28.98 
 
 		 563 aa  184  5.0000000000000004e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2169  arginyl-tRNA synthetase  27.9 
 
 		 585 aa  183  7e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  29.27 
 
 		 574 aa  183  8.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02786  arginyl-tRNA synthetase  26.96 
 
 		 576 aa  182  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  28.61 
 
 		 640 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0333  arginyl-tRNA synthetase  27.34 
 
 		 572 aa  182  1e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0466  arginyl-tRNA synthetase  29.15 
 
 		 564 aa  182  2e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.795792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0251  arginyl-tRNA synthetase  27.16 
 
 		 592 aa  182  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2173  arginyl-tRNA synthetase  28.06 
 
 		 576 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1309  arginyl-tRNA synthetase  29.32 
 
 		 613 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.925397  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1661  arginyl-tRNA synthetase  28.71 
 
 		 599 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2110  arginyl-tRNA synthetase  27.13 
 
 		 577 aa  181  4.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.102153  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2791  arginyl-tRNA synthetase  27.11 
 
 		 576 aa  180  5.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.263184 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  25.35 
 
 		 571 aa  179  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0006  arginyl-tRNA synthetase  27.11 
 
 		 582 aa  179  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  27.59 
 
 		 562 aa  178  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2270  arginyl-tRNA synthetase  26.23 
 
 		 576 aa  177  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2043  arginyl-tRNA synthetase  27.1 
 
 		 576 aa  177  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0267  arginyl-tRNA synthetase  26.59 
 
 		 597 aa  176  9.999999999999999e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2236  arginyl-tRNA synthetase  28.89 
 
 		 433 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000339277  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1017  arginyl-tRNA synthetase  26.71 
 
 		 630 aa  176  9.999999999999999e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.341311 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0955  arginyl-tRNA synthetase  28.19 
 
 		 577 aa  176  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>