More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0216 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0216  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 558 aa  1143    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1008  arginyl-tRNA synthetase  53.6 
 
 		 569 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1739  arginyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 		 567 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2213  arginyl-tRNA synthetase  53.67 
 
 		 555 aa  561  1e-158  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0271  arginyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 		 558 aa  538  9.999999999999999e-153  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1508  arginyl-tRNA synthetase  50.75 
 
 		 558 aa  512  1e-144  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.818041  normal  0.873479 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2837  arginyl-tRNA synthetase  49.72 
 
 		 555 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0222286 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0288  arginyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 		 559 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.124809 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1102  arginyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 574 aa  462  1e-129  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1633  arginyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 566 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0568  arginyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 566 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.078202  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0268  arginyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 566 aa  435  1e-120  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.107833  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0350  arginyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 		 569 aa  428  1e-118  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1291  arginyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 591 aa  373  1e-102  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.456077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3171  arginyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 		 595 aa  372  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2012  arginyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 583 aa  369  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.750372  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1420  arginyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 600 aa  368  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.435817  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0169  arginyl-tRNA synthetase  37.46 
 
 		 602 aa  347  3e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0562  arginyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 		 550 aa  347  5e-94  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0564  arginyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 		 635 aa  276  8e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  30.81 
 
 		 566 aa  261  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0438  arginyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 		 601 aa  252  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1017  arginyl-tRNA synthetase  33.27 
 
 		 630 aa  244  3.9999999999999997e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.341311 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0329  arginyl-tRNA synthetase  31.57 
 
 		 613 aa  241  2e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1036  arginyl-tRNA synthetase  29.57 
 
 		 628 aa  241  4e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475054 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1715  arginyl-tRNA synthetase  30 
 
 		 619 aa  239  1e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0586  arginyl-tRNA synthetase  33.77 
 
 		 632 aa  233  6e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000562405 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2451  arginyl-tRNA synthetase  30.29 
 
 		 612 aa  229  8e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0405  arginyl-tRNA synthetase  31.05 
 
 		 542 aa  228  2e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1756  arginyl-tRNA synthetase  32.58 
 
 		 630 aa  227  3e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0324309  hitchhiker  0.00414873 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1846  arginyl-tRNA synthetase  29 
 
 		 625 aa  226  1e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  29.05 
 
 		 556 aa  226  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  29.1 
 
 		 556 aa  225  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  28.98 
 
 		 556 aa  226  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0632  arginyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 		 564 aa  225  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  29.1 
 
 		 556 aa  226  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1577  arginyl-tRNA synthetase  32.77 
 
 		 635 aa  226  1e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  28.98 
 
 		 556 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  29.05 
 
 		 556 aa  225  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  28.98 
 
 		 556 aa  225  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  28.98 
 
 		 556 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  28.64 
 
 		 556 aa  224  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  28.98 
 
 		 556 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  27.85 
 
 		 565 aa  224  4e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0686  arginyl-tRNA synthetase  28.68 
 
 		 628 aa  224  4e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  31.45 
 
 		 561 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01700  arginyl-tRNA synthetase  31.41 
 
 		 583 aa  223  8e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000411406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  29.32 
 
 		 562 aa  223  8e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1723  arginyl-tRNA synthetase  30.8 
 
 		 546 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  29.59 
 
 		 556 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  27.67 
 
 		 565 aa  220  5e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  29.13 
 
 		 556 aa  219  7e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  27.38 
 
 		 566 aa  219  7.999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  31.31 
 
 		 589 aa  219  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 562 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1650  arginyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 		 546 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  28.76 
 
 		 562 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  28.68 
 
 		 563 aa  217  4e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  29.26 
 
 		 556 aa  217  5e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  28.38 
 
 		 562 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  30.98 
 
 		 589 aa  216  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  28.38 
 
 		 562 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  28.65 
 
 		 553 aa  215  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  28.38 
 
 		 562 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0430  arginyl-tRNA synthetase  30.44 
 
 		 594 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  28.38 
 
 		 562 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0410  arginyl-tRNA synthetase  30.44 
 
 		 594 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1620  arginyl-tRNA synthetase  30.15 
 
 		 562 aa  213  7e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010963  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2484  arginyl-tRNA synthetase  32.07 
 
 		 551 aa  213  9e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00470527  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0188  arginyl-tRNA synthetase  30.07 
 
 		 594 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0084  arginyl-tRNA synthetase  30.62 
 
 		 594 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.72933  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1997  arginyl-tRNA synthetase  30.62 
 
 		 594 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0592  arginyl-tRNA synthetase  30.62 
 
 		 594 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597736  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0441  arginyl-tRNA synthetase  30.74 
 
 		 629 aa  213  1e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  30.22 
 
 		 559 aa  212  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2291  arginyl-tRNA synthetase  30.62 
 
 		 594 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3099  arginyl-tRNA synthetase  30.62 
 
 		 594 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  28.38 
 
 		 562 aa  212  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4230  arginyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 		 561 aa  211  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.228794 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  27.34 
 
 		 563 aa  210  4e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1659  arginyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 		 543 aa  210  5e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.826444  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0473  arginyl-tRNA synthetase  30.02 
 
 		 596 aa  210  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.274692 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1935  arginyl-tRNA synthetase  29.81 
 
 		 564 aa  209  7e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000950947  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  28.02 
 
 		 551 aa  209  8e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0355  arginyl-tRNA synthetase  30.27 
 
 		 594 aa  209  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  28.2 
 
 		 562 aa  209  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1019  arginyl-tRNA synthetase  29.61 
 
 		 563 aa  209  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.637999  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0050  arginyl-tRNA synthetase  31.71 
 
 		 564 aa  209  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 		 562 aa  208  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 		 553 aa  208  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 		 553 aa  208  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0124  arginyl-tRNA synthetase  29.79 
 
 		 562 aa  208  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4245  arginyl-tRNA synthetase  29.37 
 
 		 596 aa  207  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  26.9 
 
 		 590 aa  207  5e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  28.32 
 
 		 551 aa  207  5e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0529  arginyl-tRNA synthetase  29.78 
 
 		 614 aa  207  5e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000661895 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2304  arginyl-tRNA synthetase  29.59 
 
 		 561 aa  207  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0307018  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0109  arginyl-tRNA synthetase  29.61 
 
 		 562 aa  206  7e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  29.53 
 
 		 586 aa  206  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  30.4 
 
 		 557 aa  206  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>