More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2012 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2012  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 583 aa  1170    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.750372  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1291  arginyl-tRNA synthetase  78.17 
 
 		 591 aa  886    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.456077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3171  arginyl-tRNA synthetase  71.62 
 
 		 595 aa  801    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1420  arginyl-tRNA synthetase  69.65 
 
 		 600 aa  759    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.435817  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0169  arginyl-tRNA synthetase  69.6 
 
 		 602 aa  760    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1739  arginyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 567 aa  432  1e-120  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1008  arginyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 		 569 aa  426  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2213  arginyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 555 aa  404  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0216  arginyl-tRNA synthetase  40.03 
 
 		 558 aa  392  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1508  arginyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 558 aa  388  1e-106  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.818041  normal  0.873479 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0271  arginyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 558 aa  388  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2837  arginyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 555 aa  375  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0222286 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0568  arginyl-tRNA synthetase  37.52 
 
 		 566 aa  367  1e-100  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.078202  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1102  arginyl-tRNA synthetase  34.39 
 
 		 574 aa  365  2e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1633  arginyl-tRNA synthetase  37.52 
 
 		 566 aa  363  4e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0268  arginyl-tRNA synthetase  36.47 
 
 		 566 aa  354  2e-96  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.107833  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0288  arginyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 559 aa  350  3e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.124809 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0350  arginyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 		 569 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0562  arginyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 550 aa  338  1.9999999999999998e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1756  arginyl-tRNA synthetase  32.21 
 
 		 630 aa  252  2e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0324309  hitchhiker  0.00414873 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0564  arginyl-tRNA synthetase  32.78 
 
 		 635 aa  251  2e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  30.29 
 
 		 566 aa  251  4e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1017  arginyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 		 630 aa  243  7e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.341311 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1577  arginyl-tRNA synthetase  31.72 
 
 		 635 aa  241  2e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0438  arginyl-tRNA synthetase  32.21 
 
 		 601 aa  241  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0586  arginyl-tRNA synthetase  30.76 
 
 		 632 aa  241  2e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000562405 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4135  arginyl-tRNA synthetase  32.17 
 
 		 591 aa  238  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  27.97 
 
 		 566 aa  236  8e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  32.24 
 
 		 574 aa  236  9e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  30.12 
 
 		 553 aa  236  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  29.93 
 
 		 553 aa  234  3e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  29.93 
 
 		 553 aa  234  3e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0441  arginyl-tRNA synthetase  31.32 
 
 		 629 aa  233  6e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  31.33 
 
 		 640 aa  230  7e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  30.4 
 
 		 590 aa  225  2e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  29.64 
 
 		 551 aa  224  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1036  arginyl-tRNA synthetase  28.04 
 
 		 628 aa  224  4e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475054 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  28.89 
 
 		 565 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1846  arginyl-tRNA synthetase  27.48 
 
 		 625 aa  222  9.999999999999999e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  29.6 
 
 		 556 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  29.6 
 
 		 556 aa  221  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  29.6 
 
 		 556 aa  221  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0612  arginyl-tRNA synthetase  31.79 
 
 		 562 aa  221  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.954769  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1309  arginyl-tRNA synthetase  31.43 
 
 		 613 aa  221  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.925397  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  29.64 
 
 		 556 aa  220  5e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  29.43 
 
 		 556 aa  220  7e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  29.43 
 
 		 556 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  29.43 
 
 		 556 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  28.19 
 
 		 565 aa  219  1e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2678  arginyl-tRNA synthetase  30.68 
 
 		 592 aa  218  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  28.55 
 
 		 565 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  29.43 
 
 		 556 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  29.43 
 
 		 556 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  29.64 
 
 		 556 aa  217  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  30.81 
 
 		 551 aa  216  7e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1715  arginyl-tRNA synthetase  29.79 
 
 		 619 aa  216  7e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0329  arginyl-tRNA synthetase  29.44 
 
 		 613 aa  216  8e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0686  arginyl-tRNA synthetase  26.05 
 
 		 628 aa  216  9.999999999999999e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1935  arginyl-tRNA synthetase  29.37 
 
 		 564 aa  214  4.9999999999999996e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000950947  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  28.85 
 
 		 561 aa  212  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0632  arginyl-tRNA synthetase  30.6 
 
 		 564 aa  212  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1577  arginyl-tRNA synthetase  29.29 
 
 		 621 aa  211  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.879493  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1650  arginyl-tRNA synthetase  28.17 
 
 		 546 aa  211  4e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  31.24 
 
 		 559 aa  210  6e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  28.9 
 
 		 562 aa  210  6e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  29.83 
 
 		 551 aa  208  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  28.72 
 
 		 562 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0607  arginyl-tRNA synthetase  26.48 
 
 		 585 aa  207  4e-52  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.872641  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  29.47 
 
 		 564 aa  207  5e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 		 586 aa  207  5e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  29.2 
 
 		 563 aa  207  6e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2169  arginyl-tRNA synthetase  30.05 
 
 		 585 aa  206  7e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  28.98 
 
 		 562 aa  206  9e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  28.24 
 
 		 556 aa  206  9e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1723  arginyl-tRNA synthetase  27.95 
 
 		 546 aa  204  3e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05910  arginyl-tRNA synthetase  28.63 
 
 		 592 aa  204  3e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0648  arginyl-tRNA synthetase  30.26 
 
 		 559 aa  204  3e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0541152  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2451  arginyl-tRNA synthetase  28.79 
 
 		 612 aa  204  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  29.3 
 
 		 570 aa  204  4e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0039  arginyl-tRNA synthetase  30.08 
 
 		 599 aa  204  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285018  normal  0.0776701 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  28.7 
 
 		 562 aa  203  8e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  28.7 
 
 		 562 aa  203  8e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  28.49 
 
 		 562 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3183  arginyl-tRNA synthetase  30.39 
 
 		 561 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000169325  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  28.6 
 
 		 562 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0529  arginyl-tRNA synthetase  29.61 
 
 		 614 aa  201  1.9999999999999998e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000661895 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  29.65 
 
 		 562 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0285  arginyl-tRNA synthetase  28.15 
 
 		 564 aa  202  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0318968  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  30.16 
 
 		 584 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0050  arginyl-tRNA synthetase  29.3 
 
 		 564 aa  201  3e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0466  arginyl-tRNA synthetase  28.38 
 
 		 564 aa  201  3.9999999999999996e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.795792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  30.7 
 
 		 557 aa  200  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1053  arginyl-tRNA synthetase  27.57 
 
 		 556 aa  200  7e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1654  arginyl-tRNA synthetase  26.76 
 
 		 549 aa  199  1.0000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0671403  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  28.43 
 
 		 556 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0186  arginyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 		 597 aa  198  2.0000000000000003e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0704  arginyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 		 575 aa  198  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281403 
 
 
-
 
NC_002936  DET1270  arginyl-tRNA synthetase  27.41 
 
 		 556 aa  197  3e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0106385  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  29.28 
 
 		 589 aa  197  3e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  29.08 
 
 		 589 aa  197  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>