More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1017 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1017  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 630 aa  1286    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.341311 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1577  arginyl-tRNA synthetase  46.69 
 
 		 635 aa  541  1e-153  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0586  arginyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 		 632 aa  532  1e-150  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000562405 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1756  arginyl-tRNA synthetase  46 
 
 		 630 aa  529  1e-149  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0324309  hitchhiker  0.00414873 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0441  arginyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 		 629 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0564  arginyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 635 aa  435  1e-120  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1846  arginyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 		 625 aa  372  1e-101  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1715  arginyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 		 619 aa  359  9.999999999999999e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0216  arginyl-tRNA synthetase  33.27 
 
 		 558 aa  244  5e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0271  arginyl-tRNA synthetase  32.28 
 
 		 558 aa  242  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1102  arginyl-tRNA synthetase  30.33 
 
 		 574 aa  238  2e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2213  arginyl-tRNA synthetase  31.96 
 
 		 555 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1291  arginyl-tRNA synthetase  29.35 
 
 		 591 aa  233  6e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.456077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2837  arginyl-tRNA synthetase  31.18 
 
 		 555 aa  226  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0222286 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1508  arginyl-tRNA synthetase  31.35 
 
 		 558 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.818041  normal  0.873479 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0268  arginyl-tRNA synthetase  30.07 
 
 		 566 aa  223  8e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.107833  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0568  arginyl-tRNA synthetase  29.72 
 
 		 566 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.078202  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1633  arginyl-tRNA synthetase  30.32 
 
 		 566 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0288  arginyl-tRNA synthetase  31.66 
 
 		 559 aa  218  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.124809 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1739  arginyl-tRNA synthetase  31.13 
 
 		 567 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0267  arginyl-tRNA synthetase  28.1 
 
 		 597 aa  207  4e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0350  arginyl-tRNA synthetase  29.22 
 
 		 569 aa  206  1e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0562  arginyl-tRNA synthetase  28.38 
 
 		 550 aa  206  1e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1008  arginyl-tRNA synthetase  29.5 
 
 		 569 aa  205  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2012  arginyl-tRNA synthetase  30.04 
 
 		 583 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.750372  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05910  arginyl-tRNA synthetase  27.78 
 
 		 592 aa  198  3e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0186  arginyl-tRNA synthetase  28.22 
 
 		 597 aa  197  4.0000000000000005e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  25.12 
 
 		 565 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0251  arginyl-tRNA synthetase  29.3 
 
 		 592 aa  184  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  27.23 
 
 		 590 aa  184  4.0000000000000006e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1577  arginyl-tRNA synthetase  27.67 
 
 		 621 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.879493  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0438  arginyl-tRNA synthetase  28.52 
 
 		 601 aa  181  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2678  arginyl-tRNA synthetase  26.71 
 
 		 592 aa  181  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  25.62 
 
 		 566 aa  179  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0039  arginyl-tRNA synthetase  26.38 
 
 		 599 aa  178  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285018  normal  0.0776701 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3171  arginyl-tRNA synthetase  32.73 
 
 		 595 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  26.18 
 
 		 566 aa  174  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2318  arginyl-tRNA synthetase  26.71 
 
 		 593 aa  173  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.291854 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2451  arginyl-tRNA synthetase  27 
 
 		 612 aa  172  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0329  arginyl-tRNA synthetase  26.69 
 
 		 613 aa  170  8e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24923  predicted protein  26.95 
 
 		 652 aa  170  9e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.321104  normal  0.342415 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1036  arginyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 628 aa  167  6.9999999999999995e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475054 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  25.04 
 
 		 565 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  25.04 
 
 		 565 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  25.24 
 
 		 571 aa  162  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  27.1 
 
 		 564 aa  159  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6433  arginyl-tRNA synthetase  25.87 
 
 		 642 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.490682  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06368  arginyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G14030)  28.44 
 
 		 650 aa  157  8e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.908063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1420  arginyl-tRNA synthetase  29.49 
 
 		 600 aa  156  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.435817  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  24.79 
 
 		 574 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1807  arginyl-tRNA synthetase  26.22 
 
 		 576 aa  154  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.426497  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2084  arginyl-tRNA synthetase  26.4 
 
 		 576 aa  154  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0686  arginyl-tRNA synthetase  26.3 
 
 		 628 aa  154  5e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  25.04 
 
 		 565 aa  154  7e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  25.62 
 
 		 563 aa  153  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1535  arginyl-tRNA synthetase  24.48 
 
 		 624 aa  153  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0599  arginyl-tRNA synthetase  24.87 
 
 		 596 aa  152  3e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0607  arginyl-tRNA synthetase  24.23 
 
 		 585 aa  150  5e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.872641  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  24.96 
 
 		 563 aa  150  5e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0169  arginyl-tRNA synthetase  31.04 
 
 		 602 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  26.07 
 
 		 640 aa  149  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4135  arginyl-tRNA synthetase  25.36 
 
 		 591 aa  147  8.000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2791  arginyl-tRNA synthetase  25.35 
 
 		 576 aa  147  8.000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.263184 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1270  arginyl-tRNA synthetase  24.82 
 
 		 562 aa  144  4e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000463651  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1310  arginyl-tRNA synthetase  25.31 
 
 		 577 aa  144  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363287 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2613  arginyl-tRNA synthetase  24.91 
 
 		 577 aa  144  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253751 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1971  arginyl-tRNA synthetase  24.83 
 
 		 577 aa  143  8e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01847  arginyl-tRNA synthetase  24.91 
 
 		 577 aa  143  9e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1764  arginyl-tRNA synthetase  24.91 
 
 		 577 aa  143  9e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01368  arginyl-tRNA synthetase  25.87 
 
 		 577 aa  143  9e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01836  hypothetical protein  24.91 
 
 		 577 aa  143  9e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2173  arginyl-tRNA synthetase  24.59 
 
 		 576 aa  143  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02786  arginyl-tRNA synthetase  26.57 
 
 		 576 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2270  arginyl-tRNA synthetase  23.82 
 
 		 576 aa  142  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1756  arginyl-tRNA synthetase  24.74 
 
 		 577 aa  141  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1215  arginyl-tRNA synthetase  25.49 
 
 		 563 aa  141  3e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2169  arginyl-tRNA synthetase  24.74 
 
 		 577 aa  141  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0333  arginyl-tRNA synthetase  23.87 
 
 		 572 aa  142  3e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2108  arginyl-tRNA synthetase  25.13 
 
 		 577 aa  141  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1309  arginyl-tRNA synthetase  25.25 
 
 		 613 aa  140  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.925397  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004100  arginyl-tRNA synthetase  24.78 
 
 		 577 aa  140  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000862961  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2169  arginyl-tRNA synthetase  23.77 
 
 		 585 aa  137  6.0000000000000005e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2442  arginyl-tRNA synthetase  25.33 
 
 		 577 aa  134  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2379  arginyl-tRNA synthetase  24.61 
 
 		 579 aa  133  9e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222047  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1661  arginyl-tRNA synthetase  25.51 
 
 		 599 aa  133  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4134  arginyl-tRNA synthetase  23.72 
 
 		 577 aa  133  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440291  hitchhiker  0.000000042149 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38727  arginyl-tRNA synthetase  24.7 
 
 		 603 aa  132  1.0000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.908762 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3671  arginyl-tRNA synthetase  28.02 
 
 		 585 aa  132  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  23.57 
 
 		 562 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  23.57 
 
 		 562 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  23.46 
 
 		 562 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2434  arginyl-tRNA synthetase  27.09 
 
 		 576 aa  129  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.035286 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0466  arginyl-tRNA synthetase  27.96 
 
 		 564 aa  129  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.795792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2155  arginyl-tRNA synthetase  27.09 
 
 		 576 aa  128  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0808745  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  23.44 
 
 		 589 aa  127  5e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2043  arginyl-tRNA synthetase  27.09 
 
 		 576 aa  127  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1620  arginyl-tRNA synthetase  23.34 
 
 		 562 aa  127  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010963  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0899  arginyl-tRNA synthetase  27.35 
 
 		 566 aa  127  7e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0249713  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  23.68 
 
 		 562 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  23.14 
 
 		 589 aa  126  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>