More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0686 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0686  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 628 aa  1290    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2032  arginyl-tRNA synthetase  36.26 
 
 		 647 aa  360  6e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2451  arginyl-tRNA synthetase  33.23 
 
 		 612 aa  295  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1036  arginyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 		 628 aa  289  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475054 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0329  arginyl-tRNA synthetase  33.71 
 
 		 613 aa  270  8e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1739  arginyl-tRNA synthetase  29.13 
 
 		 567 aa  239  9e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1008  arginyl-tRNA synthetase  29 
 
 		 569 aa  229  9e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0216  arginyl-tRNA synthetase  28.68 
 
 		 558 aa  229  9e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2837  arginyl-tRNA synthetase  29.43 
 
 		 555 aa  228  3e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0222286 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0271  arginyl-tRNA synthetase  29.65 
 
 		 558 aa  224  4.9999999999999996e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2213  arginyl-tRNA synthetase  28.69 
 
 		 555 aa  221  5e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0562  arginyl-tRNA synthetase  29.91 
 
 		 550 aa  217  4e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0288  arginyl-tRNA synthetase  30.19 
 
 		 559 aa  217  5e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.124809 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3171  arginyl-tRNA synthetase  26.36 
 
 		 595 aa  211  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1102  arginyl-tRNA synthetase  29.95 
 
 		 574 aa  211  2e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1508  arginyl-tRNA synthetase  27.57 
 
 		 558 aa  209  8e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.818041  normal  0.873479 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1633  arginyl-tRNA synthetase  28.81 
 
 		 566 aa  209  9e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0350  arginyl-tRNA synthetase  29.36 
 
 		 569 aa  207  6e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2012  arginyl-tRNA synthetase  26.05 
 
 		 583 aa  205  2e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.750372  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0268  arginyl-tRNA synthetase  28.64 
 
 		 566 aa  204  5e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.107833  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0050  arginyl-tRNA synthetase  28.09 
 
 		 564 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1291  arginyl-tRNA synthetase  25.08 
 
 		 591 aa  197  3e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.456077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1420  arginyl-tRNA synthetase  26.13 
 
 		 600 aa  196  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.435817  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  27.52 
 
 		 570 aa  190  7e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0186  arginyl-tRNA synthetase  27.73 
 
 		 597 aa  187  7e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0039  arginyl-tRNA synthetase  27.19 
 
 		 599 aa  186  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285018  normal  0.0776701 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2181  arginyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 		 563 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.264732  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1715  arginyl-tRNA synthetase  27.6 
 
 		 619 aa  185  2.0000000000000003e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  27.35 
 
 		 556 aa  184  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0564  arginyl-tRNA synthetase  28.36 
 
 		 635 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2678  arginyl-tRNA synthetase  25.26 
 
 		 592 aa  183  8.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  27.29 
 
 		 556 aa  182  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  27.29 
 
 		 556 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  27.15 
 
 		 556 aa  182  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  27.29 
 
 		 556 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  27.29 
 
 		 556 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  27.12 
 
 		 556 aa  181  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0169  arginyl-tRNA synthetase  23.87 
 
 		 602 aa  180  5.999999999999999e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  27.12 
 
 		 556 aa  180  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  27.12 
 
 		 556 aa  179  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  26.38 
 
 		 557 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  26.08 
 
 		 562 aa  179  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0607  arginyl-tRNA synthetase  26.63 
 
 		 585 aa  178  2e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.872641  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  25.56 
 
 		 563 aa  179  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  26.08 
 
 		 562 aa  178  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1650  arginyl-tRNA synthetase  25.82 
 
 		 546 aa  177  5e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0438  arginyl-tRNA synthetase  27.7 
 
 		 601 aa  177  6e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  26.62 
 
 		 561 aa  177  7e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1577  arginyl-tRNA synthetase  25.58 
 
 		 621 aa  177  7e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.879493  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  26.51 
 
 		 556 aa  176  8e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  25.87 
 
 		 562 aa  176  9e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1723  arginyl-tRNA synthetase  25.43 
 
 		 546 aa  176  9e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0441  arginyl-tRNA synthetase  28.09 
 
 		 629 aa  176  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  25.58 
 
 		 562 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  25.75 
 
 		 566 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  25.16 
 
 		 565 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  25.91 
 
 		 562 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  25.91 
 
 		 562 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0599  arginyl-tRNA synthetase  25.11 
 
 		 596 aa  174  5e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  25.98 
 
 		 556 aa  174  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  25.16 
 
 		 565 aa  174  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  26.05 
 
 		 556 aa  174  5.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  25.58 
 
 		 562 aa  173  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  24.88 
 
 		 564 aa  172  1e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 551 aa  172  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0466  arginyl-tRNA synthetase  26.87 
 
 		 564 aa  172  2e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.795792  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  25.04 
 
 		 563 aa  171  4e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  25.62 
 
 		 562 aa  170  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2304  arginyl-tRNA synthetase  26.14 
 
 		 561 aa  169  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0307018  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  25.25 
 
 		 556 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1535  arginyl-tRNA synthetase  24.87 
 
 		 624 aa  169  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1846  arginyl-tRNA synthetase  26.5 
 
 		 625 aa  168  2e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1756  arginyl-tRNA synthetase  27.18 
 
 		 630 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0324309  hitchhiker  0.00414873 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0899  arginyl-tRNA synthetase  24.71 
 
 		 566 aa  167  5e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0249713  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0267  arginyl-tRNA synthetase  25.15 
 
 		 597 aa  167  5.9999999999999996e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1654  arginyl-tRNA synthetase  26.13 
 
 		 549 aa  166  9e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0671403  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  26.9 
 
 		 590 aa  166  1.0000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 553 aa  166  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  26.55 
 
 		 565 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05910  arginyl-tRNA synthetase  27.3 
 
 		 592 aa  165  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1434  arginyl-tRNA synthetase  26.56 
 
 		 569 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0988806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1270  arginyl-tRNA synthetase  24.23 
 
 		 562 aa  163  9e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000463651  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  25.2 
 
 		 554 aa  162  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004100  arginyl-tRNA synthetase  24.96 
 
 		 577 aa  162  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000862961  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1935  arginyl-tRNA synthetase  25.51 
 
 		 564 aa  161  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000950947  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2782  arginyl-tRNA synthetase  24.53 
 
 		 557 aa  161  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.535695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  25.25 
 
 		 562 aa  161  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  26.35 
 
 		 568 aa  161  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  25.24 
 
 		 566 aa  160  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3183  arginyl-tRNA synthetase  27.48 
 
 		 561 aa  160  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000169325  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  25.36 
 
 		 559 aa  160  6e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2270  arginyl-tRNA synthetase  24.42 
 
 		 576 aa  160  8e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  25.08 
 
 		 551 aa  159  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0251  arginyl-tRNA synthetase  26.75 
 
 		 592 aa  159  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0586  arginyl-tRNA synthetase  25.67 
 
 		 632 aa  158  3e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000562405 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  24.81 
 
 		 553 aa  157  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  24.81 
 
 		 553 aa  157  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1686  arginyl-tRNA synthetase  24.81 
 
 		 575 aa  157  6e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1620  arginyl-tRNA synthetase  25.8 
 
 		 562 aa  157  7e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010963  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  24.51 
 
 		 554 aa  156  9e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>