More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1846 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1846  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
625 aa  1246    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1715  arginyl-tRNA synthetase  58.81 
 
 
619 aa  764    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0564  arginyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 
635 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1017  arginyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
630 aa  372  1e-101  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.341311 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0586  arginyl-tRNA synthetase  36.39 
 
 
632 aa  335  2e-90  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000562405 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1577  arginyl-tRNA synthetase  36.54 
 
 
635 aa  333  5e-90  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502048  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1756  arginyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 
630 aa  327  6e-88  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0324309  hitchhiker  0.00414873 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0441  arginyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 
629 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24923  predicted protein  29.5 
 
 
652 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.321104  normal  0.342415 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0271  arginyl-tRNA synthetase  30.44 
 
 
558 aa  231  3e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0216  arginyl-tRNA synthetase  29 
 
 
558 aa  226  1e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0288  arginyl-tRNA synthetase  31.57 
 
 
559 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.124809 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2213  arginyl-tRNA synthetase  28.55 
 
 
555 aa  221  3e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0568  arginyl-tRNA synthetase  28.22 
 
 
566 aa  219  2e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.078202  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0268  arginyl-tRNA synthetase  27.77 
 
 
566 aa  217  5e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.107833  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1633  arginyl-tRNA synthetase  27.68 
 
 
566 aa  216  8e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1102  arginyl-tRNA synthetase  28.39 
 
 
574 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2837  arginyl-tRNA synthetase  30.3 
 
 
555 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0222286 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0350  arginyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 
569 aa  209  2e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1008  arginyl-tRNA synthetase  28.37 
 
 
569 aa  206  9e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1291  arginyl-tRNA synthetase  28.25 
 
 
591 aa  206  1e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.456077  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1508  arginyl-tRNA synthetase  28.74 
 
 
558 aa  205  2e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.818041  normal  0.873479 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0562  arginyl-tRNA synthetase  29.61 
 
 
550 aa  204  4e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2012  arginyl-tRNA synthetase  27.32 
 
 
583 aa  203  8e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.750372  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1739  arginyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 
567 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0329  arginyl-tRNA synthetase  26.25 
 
 
613 aa  186  8e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1036  arginyl-tRNA synthetase  26.09 
 
 
628 aa  186  9e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475054 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  24.88 
 
 
566 aa  186  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  24.57 
 
 
565 aa  182  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  24.57 
 
 
565 aa  182  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  27.14 
 
 
590 aa  181  2.9999999999999997e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0899  arginyl-tRNA synthetase  26.82 
 
 
566 aa  178  2e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0249713  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2451  arginyl-tRNA synthetase  26.2 
 
 
612 aa  178  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  24.22 
 
 
565 aa  176  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  25.52 
 
 
565 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  25.16 
 
 
564 aa  175  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0466  arginyl-tRNA synthetase  24.41 
 
 
564 aa  175  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.795792  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  24.68 
 
 
562 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  24.31 
 
 
562 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  24.47 
 
 
562 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  24.41 
 
 
562 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  24.8 
 
 
566 aa  172  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  24.4 
 
 
562 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1620  arginyl-tRNA synthetase  24.92 
 
 
562 aa  172  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  24.35 
 
 
562 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  24.35 
 
 
562 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  24.68 
 
 
563 aa  172  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  24.13 
 
 
562 aa  171  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  23.95 
 
 
562 aa  167  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  24.02 
 
 
563 aa  167  5.9999999999999996e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0186  arginyl-tRNA synthetase  25.89 
 
 
597 aa  165  2.0000000000000002e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0607  arginyl-tRNA synthetase  26.47 
 
 
585 aa  165  2.0000000000000002e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.872641  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1215  arginyl-tRNA synthetase  22.78 
 
 
563 aa  165  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0686  arginyl-tRNA synthetase  26.5 
 
 
628 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1577  arginyl-tRNA synthetase  25.7 
 
 
621 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.879493  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1270  arginyl-tRNA synthetase  24.22 
 
 
562 aa  161  3e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000463651  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0039  arginyl-tRNA synthetase  25.34 
 
 
599 aa  161  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285018  normal  0.0776701 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2318  arginyl-tRNA synthetase  27.53 
 
 
593 aa  160  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.291854 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0599  arginyl-tRNA synthetase  26.95 
 
 
596 aa  159  1e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0438  arginyl-tRNA synthetase  26.38 
 
 
601 aa  158  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  25.09 
 
 
571 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06368  arginyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G14030)  25.71 
 
 
650 aa  157  6e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.908063  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4490  arginyl-tRNA synthetase  25.65 
 
 
561 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.703488 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6433  arginyl-tRNA synthetase  25.33 
 
 
642 aa  154  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.490682  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0251  arginyl-tRNA synthetase  26.26 
 
 
592 aa  152  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2678  arginyl-tRNA synthetase  24.12 
 
 
592 aa  150  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0267  arginyl-tRNA synthetase  24.35 
 
 
597 aa  149  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  23.29 
 
 
574 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  25.51 
 
 
589 aa  147  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  25.51 
 
 
589 aa  147  5e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38727  arginyl-tRNA synthetase  24.92 
 
 
603 aa  147  5e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.908762 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4135  arginyl-tRNA synthetase  24.37 
 
 
591 aa  146  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05910  arginyl-tRNA synthetase  25.64 
 
 
592 aa  146  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3171  arginyl-tRNA synthetase  27.69 
 
 
595 aa  145  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2084  arginyl-tRNA synthetase  24.76 
 
 
576 aa  144  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2109  arginyl-tRNA synthetase  24.52 
 
 
592 aa  144  4e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.513959  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1807  arginyl-tRNA synthetase  24.76 
 
 
576 aa  144  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.426497  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2032  arginyl-tRNA synthetase  24.92 
 
 
647 aa  144  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0077  arginyl-tRNA synthetase  24.52 
 
 
586 aa  144  6e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2236  arginyl-tRNA synthetase  24.75 
 
 
433 aa  143  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000339277  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2173  arginyl-tRNA synthetase  24.37 
 
 
576 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  26.22 
 
 
556 aa  141  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  24.64 
 
 
551 aa  141  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0443  arginyl-tRNA synthetase  24.67 
 
 
581 aa  142  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1661  arginyl-tRNA synthetase  24.49 
 
 
599 aa  141  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0498  arginyl-tRNA synthetase  23.71 
 
 
581 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0474  arginyl-tRNA synthetase  23.71 
 
 
581 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0495  arginyl-tRNA synthetase  23.71 
 
 
581 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3845  arginyl-tRNA synthetase  23.71 
 
 
581 aa  140  7e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1420  arginyl-tRNA synthetase  27.39 
 
 
600 aa  140  8.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.435817  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0332  arginyl-tRNA synthetase  25.25 
 
 
567 aa  140  8.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.960888  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1309  arginyl-tRNA synthetase  23.33 
 
 
613 aa  140  8.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.925397  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0343  arginyl-tRNA synthetase  25.38 
 
 
577 aa  139  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.401675  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2110  arginyl-tRNA synthetase  23.82 
 
 
577 aa  139  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.102153  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0378  arginyl-tRNA synthetase  23.8 
 
 
581 aa  139  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0333  arginyl-tRNA synthetase  23.49 
 
 
572 aa  139  2e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0550  arginyl-tRNA synthetase  23.38 
 
 
581 aa  138  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259334  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0414  arginyl-tRNA synthetase  25.66 
 
 
569 aa  139  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.872884  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  23.75 
 
 
640 aa  139  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1723  arginyl-tRNA synthetase  23.87 
 
 
546 aa  139  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>