More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0568 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0350  arginyl-tRNA synthetase  79.96 
 
 		 569 aa  898    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0268  arginyl-tRNA synthetase  96.64 
 
 		 566 aa  1084    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.107833  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1102  arginyl-tRNA synthetase  65.68 
 
 		 574 aa  758    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1633  arginyl-tRNA synthetase  97 
 
 		 566 aa  1098    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0568  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 566 aa  1150    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.078202  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1008  arginyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 		 569 aa  463  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0216  arginyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 558 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2213  arginyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 555 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1739  arginyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 		 567 aa  429  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2837  arginyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 		 555 aa  427  1e-118  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0222286 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1508  arginyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 558 aa  419  1e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.818041  normal  0.873479 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0271  arginyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 558 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0288  arginyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 559 aa  390  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.124809 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0562  arginyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 550 aa  373  1e-102  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1291  arginyl-tRNA synthetase  37.44 
 
 		 591 aa  362  1e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.456077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3171  arginyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 		 595 aa  358  9.999999999999999e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2012  arginyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 		 583 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.750372  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0169  arginyl-tRNA synthetase  34.67 
 
 		 602 aa  339  7e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1420  arginyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 		 600 aa  326  6e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.435817  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0438  arginyl-tRNA synthetase  33.9 
 
 		 601 aa  277  3e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0564  arginyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 		 635 aa  267  5e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1036  arginyl-tRNA synthetase  29.95 
 
 		 628 aa  259  9e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475054 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  30.48 
 
 		 590 aa  241  2e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  32.37 
 
 		 565 aa  236  9e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2451  arginyl-tRNA synthetase  29.31 
 
 		 612 aa  235  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0441  arginyl-tRNA synthetase  31.01 
 
 		 629 aa  229  7e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1715  arginyl-tRNA synthetase  28.11 
 
 		 619 aa  228  3e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  31.66 
 
 		 562 aa  227  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  31.84 
 
 		 562 aa  227  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1017  arginyl-tRNA synthetase  29.72 
 
 		 630 aa  226  6e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.341311 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  31.66 
 
 		 562 aa  226  8e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  31.66 
 
 		 562 aa  226  8e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  31.31 
 
 		 562 aa  226  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 		 562 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0329  arginyl-tRNA synthetase  30.5 
 
 		 613 aa  225  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  29.17 
 
 		 565 aa  224  3e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  29.17 
 
 		 565 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1846  arginyl-tRNA synthetase  28.55 
 
 		 625 aa  223  6e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  31.13 
 
 		 562 aa  223  6e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  29.64 
 
 		 563 aa  222  1.9999999999999999e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  31.31 
 
 		 562 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  29.41 
 
 		 566 aa  221  3e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  31.15 
 
 		 562 aa  220  5e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  28.84 
 
 		 566 aa  219  7.999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  29.51 
 
 		 589 aa  219  8.999999999999998e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0632  arginyl-tRNA synthetase  30.61 
 
 		 564 aa  216  8e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  29.01 
 
 		 589 aa  216  9e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0039  arginyl-tRNA synthetase  27.81 
 
 		 599 aa  216  9e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285018  normal  0.0776701 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  28.64 
 
 		 563 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0586  arginyl-tRNA synthetase  31.31 
 
 		 632 aa  212  1e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000562405 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0285  arginyl-tRNA synthetase  31.76 
 
 		 564 aa  212  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0318968  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  27.73 
 
 		 565 aa  212  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1577  arginyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 		 635 aa  211  3e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  28.93 
 
 		 551 aa  211  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1756  arginyl-tRNA synthetase  29.73 
 
 		 630 aa  210  5e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0324309  hitchhiker  0.00414873 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  28.55 
 
 		 564 aa  209  1e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1577  arginyl-tRNA synthetase  28.3 
 
 		 621 aa  209  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.879493  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_002950  PG0267  arginyl-tRNA synthetase  30.67 
 
 		 597 aa  207  3e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1935  arginyl-tRNA synthetase  30.85 
 
 		 564 aa  206  8e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000950947  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  28.45 
 
 		 551 aa  205  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  28.99 
 
 		 584 aa  206  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2318  arginyl-tRNA synthetase  28.74 
 
 		 593 aa  204  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.291854 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0186  arginyl-tRNA synthetase  27.87 
 
 		 597 aa  202  9e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  29.97 
 
 		 557 aa  203  9e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05910  arginyl-tRNA synthetase  28.04 
 
 		 592 aa  202  9.999999999999999e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1723  arginyl-tRNA synthetase  28.38 
 
 		 546 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  29.34 
 
 		 568 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2678  arginyl-tRNA synthetase  28.18 
 
 		 592 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1650  arginyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 		 546 aa  201  3e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  29.23 
 
 		 556 aa  200  5e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  29.23 
 
 		 561 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  29.14 
 
 		 556 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  28.45 
 
 		 556 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 		 556 aa  197  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1659  arginyl-tRNA synthetase  28.01 
 
 		 543 aa  197  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.826444  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 		 556 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 		 556 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  29.35 
 
 		 553 aa  197  5.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  29.35 
 
 		 553 aa  197  5.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 		 556 aa  197  6e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  28.15 
 
 		 553 aa  196  7e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1620  arginyl-tRNA synthetase  30 
 
 		 562 aa  196  7e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010963  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 		 556 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 		 556 aa  196  9e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  28.42 
 
 		 586 aa  196  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  28.52 
 
 		 556 aa  195  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  28.7 
 
 		 556 aa  195  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  28.45 
 
 		 556 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0251  arginyl-tRNA synthetase  28.98 
 
 		 592 aa  194  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  28.45 
 
 		 556 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0109  arginyl-tRNA synthetase  26.7 
 
 		 562 aa  194  3e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0405  arginyl-tRNA synthetase  29.12 
 
 		 542 aa  194  4e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0124  arginyl-tRNA synthetase  26.7 
 
 		 562 aa  194  4e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0607  arginyl-tRNA synthetase  30.16 
 
 		 585 aa  194  4e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.872641  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1215  arginyl-tRNA synthetase  27.68 
 
 		 563 aa  194  5e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2304  arginyl-tRNA synthetase  28.27 
 
 		 561 aa  192  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0307018  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1434  arginyl-tRNA synthetase  27.95 
 
 		 569 aa  192  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0988806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0198  arginyl-tRNA synthetase  29.68 
 
 		 592 aa  192  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  27.02 
 
 		 554 aa  192  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  27.95 
 
 		 559 aa  191  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>