More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1739 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1008  arginyl-tRNA synthetase  67.84 
 
 
569 aa  805    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1739  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
567 aa  1165    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0216  arginyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 
558 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2213  arginyl-tRNA synthetase  52.3 
 
 
555 aa  551  1e-155  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2837  arginyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 
555 aa  514  1e-144  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0222286 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0271  arginyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 
558 aa  504  1e-141  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0288  arginyl-tRNA synthetase  49.82 
 
 
559 aa  504  1e-141  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.124809 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1508  arginyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 
558 aa  498  1e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.818041  normal  0.873479 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1102  arginyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 
574 aa  442  1e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0568  arginyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 
566 aa  430  1e-119  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.078202  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0268  arginyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 
566 aa  431  1e-119  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.107833  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1633  arginyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 
566 aa  431  1e-119  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0350  arginyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 
569 aa  427  1e-118  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2012  arginyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 
583 aa  411  1e-113  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.750372  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3171  arginyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 
595 aa  395  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0169  arginyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 
602 aa  385  1e-106  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1291  arginyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 
591 aa  385  1e-105  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.456077  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1420  arginyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 
600 aa  377  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.435817  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0562  arginyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 
550 aa  341  2e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0564  arginyl-tRNA synthetase  33.59 
 
 
635 aa  278  1e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0438  arginyl-tRNA synthetase  30.85 
 
 
601 aa  258  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  32.93 
 
 
589 aa  254  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 
589 aa  254  3e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  30.29 
 
 
551 aa  240  4e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  30.78 
 
 
551 aa  240  4e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0743  arginyl-tRNA synthetase  32.19 
 
 
550 aa  239  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  29.32 
 
 
566 aa  238  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  30.78 
 
 
565 aa  234  3e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  30.13 
 
 
586 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2451  arginyl-tRNA synthetase  29.86 
 
 
612 aa  232  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0441  arginyl-tRNA synthetase  30.65 
 
 
629 aa  232  1e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0586  arginyl-tRNA synthetase  31.17 
 
 
632 aa  230  4e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000562405 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0686  arginyl-tRNA synthetase  29.13 
 
 
628 aa  230  5e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  30.78 
 
 
565 aa  230  6e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0188  arginyl-tRNA synthetase  30.97 
 
 
594 aa  229  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.826253  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  30.45 
 
 
553 aa  228  3e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01700  arginyl-tRNA synthetase  29.84 
 
 
583 aa  227  4e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000411406  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1715  arginyl-tRNA synthetase  30.45 
 
 
619 aa  226  6e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1654  arginyl-tRNA synthetase  30.19 
 
 
549 aa  226  7e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0671403  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  30.22 
 
 
551 aa  225  1e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  29.29 
 
 
553 aa  225  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  30.3 
 
 
590 aa  225  2e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  29.29 
 
 
553 aa  225  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1577  arginyl-tRNA synthetase  31.17 
 
 
635 aa  224  2e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502048  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1036  arginyl-tRNA synthetase  27.8 
 
 
628 aa  225  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475054 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  29.54 
 
 
551 aa  224  4e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  28.74 
 
 
551 aa  224  4e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1756  arginyl-tRNA synthetase  29.93 
 
 
630 aa  223  9e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0324309  hitchhiker  0.00414873 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  27.38 
 
 
566 aa  221  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  29.34 
 
 
559 aa  221  3e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0329  arginyl-tRNA synthetase  30.64 
 
 
613 aa  220  5e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  29.84 
 
 
559 aa  220  5e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  30.8 
 
 
564 aa  220  5e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  28.6 
 
 
554 aa  220  6e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  28.78 
 
 
554 aa  219  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0027  arginyl-tRNA synthetase  29.61 
 
 
585 aa  219  1e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0198  arginyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 
592 aa  219  1e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  29.62 
 
 
556 aa  219  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  30.27 
 
 
556 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  29.53 
 
 
556 aa  218  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  30.4 
 
 
556 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1017  arginyl-tRNA synthetase  31.13 
 
 
630 aa  218  2.9999999999999998e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.341311 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2304  arginyl-tRNA synthetase  29.84 
 
 
561 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0307018  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  30.27 
 
 
556 aa  217  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1137  arginyl-tRNA synthetase  30.46 
 
 
564 aa  217  4e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0701665  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  30.27 
 
 
556 aa  217  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0405  arginyl-tRNA synthetase  29.5 
 
 
542 aa  217  4e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0820  arginyl-tRNA synthetase  32.02 
 
 
561 aa  217  4e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0474084  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0473  arginyl-tRNA synthetase  29.75 
 
 
596 aa  216  8e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.274692 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  30.09 
 
 
556 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0355  arginyl-tRNA synthetase  31.67 
 
 
594 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  30.03 
 
 
584 aa  216  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  30.41 
 
 
640 aa  215  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_002936  DET1270  arginyl-tRNA synthetase  31.85 
 
 
556 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0106385  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0170  arginyl-tRNA synthetase  29.04 
 
 
579 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  30.09 
 
 
556 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  29.73 
 
 
556 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0385  arginyl-tRNA synthetase  32.14 
 
 
598 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603012  normal  0.077689 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  30.09 
 
 
556 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1486  arginyl-tRNA synthetase  29.71 
 
 
550 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  30.09 
 
 
556 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0349  arginyl-tRNA synthetase  29.04 
 
 
579 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.87333 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  30.99 
 
 
556 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4245  arginyl-tRNA synthetase  30.15 
 
 
596 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0632  arginyl-tRNA synthetase  31.33 
 
 
564 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0084  arginyl-tRNA synthetase  31.5 
 
 
594 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.72933  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0592  arginyl-tRNA synthetase  31.5 
 
 
594 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597736  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1997  arginyl-tRNA synthetase  31.5 
 
 
594 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2291  arginyl-tRNA synthetase  31.5 
 
 
594 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3099  arginyl-tRNA synthetase  31.5 
 
 
594 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0410  arginyl-tRNA synthetase  31.5 
 
 
594 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  29.98 
 
 
562 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0430  arginyl-tRNA synthetase  31.5 
 
 
594 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1053  arginyl-tRNA synthetase  31.32 
 
 
556 aa  213  7.999999999999999e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  29.95 
 
 
561 aa  213  9e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  29.87 
 
 
556 aa  213  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2678  arginyl-tRNA synthetase  30.57 
 
 
592 aa  212  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1723  arginyl-tRNA synthetase  28.34 
 
 
546 aa  213  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1650  arginyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
546 aa  212  2e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2456  arginyl-tRNA synthetase  29.9 
 
 
598 aa  211  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>