More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2010 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  93.24 
 
 
562 aa  1082    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2236  arginyl-tRNA synthetase  95.15 
 
 
433 aa  852    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000339277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  93.24 
 
 
562 aa  1085    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  94.13 
 
 
562 aa  1093    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  91.99 
 
 
562 aa  1070    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  93.42 
 
 
562 aa  1087    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1620  arginyl-tRNA synthetase  82.92 
 
 
562 aa  961    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010963  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  94.13 
 
 
562 aa  1093    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
562 aa  1151    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  93.77 
 
 
562 aa  1096    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  93.59 
 
 
562 aa  1066    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0466  arginyl-tRNA synthetase  57.43 
 
 
564 aa  642    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.795792  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  54.96 
 
 
563 aa  644    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  55.39 
 
 
563 aa  629  1e-179  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1215  arginyl-tRNA synthetase  54.03 
 
 
563 aa  627  1e-178  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 
564 aa  622  1e-177  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  52.78 
 
 
566 aa  583  1.0000000000000001e-165  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 
566 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0899  arginyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 
566 aa  565  1e-160  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0249713  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1270  arginyl-tRNA synthetase  51.12 
 
 
562 aa  562  1.0000000000000001e-159  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000463651  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 
565 aa  552  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 
565 aa  550  1e-155  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 
565 aa  535  1e-150  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1535  arginyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 
624 aa  524  1e-147  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
565 aa  485  1e-135  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3474  arginyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 
580 aa  444  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387689  normal  0.108328 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  36.39 
 
 
640 aa  372  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0333  arginyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 
572 aa  370  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38727  arginyl-tRNA synthetase  36.6 
 
 
603 aa  368  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.908762 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1309  arginyl-tRNA synthetase  36.39 
 
 
613 aa  360  5e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.925397  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 
571 aa  355  2e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 
574 aa  354  2.9999999999999997e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4135  arginyl-tRNA synthetase  36.92 
 
 
591 aa  343  4e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2169  arginyl-tRNA synthetase  33.99 
 
 
585 aa  326  7e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06368  arginyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G14030)  32.99 
 
 
650 aa  315  1.9999999999999998e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.908063  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3319  arginyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 
575 aa  297  3e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4134  arginyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
577 aa  296  5e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440291  hitchhiker  0.000000042149 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01310  arginine-tRNA ligase, putative  32.83 
 
 
622 aa  295  1e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0173932  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5139  arginyl-tRNA synthetase  34.99 
 
 
578 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424681  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4133  arginyl-tRNA synthetase  32.87 
 
 
576 aa  294  3e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2791  arginyl-tRNA synthetase  33.7 
 
 
576 aa  291  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.263184 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2155  arginyl-tRNA synthetase  34.36 
 
 
576 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0808745  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0378  arginyl-tRNA synthetase  33.75 
 
 
581 aa  291  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2434  arginyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 
576 aa  291  2e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.035286 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0533  arginyl-tRNA synthetase  34.29 
 
 
581 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.142076  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5089  arginyl-tRNA synthetase  34.44 
 
 
578 aa  289  7e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257691  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02786  arginyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 
576 aa  289  8e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02161  arginyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 
602 aa  289  9e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2043  arginyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 
576 aa  289  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4962  arginyl-tRNA synthetase  34.44 
 
 
578 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02621  arginyl-tRNA synthetase  33.86 
 
 
607 aa  288  2e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0249545  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2173  arginyl-tRNA synthetase  34.05 
 
 
576 aa  288  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2084  arginyl-tRNA synthetase  32.71 
 
 
576 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1807  arginyl-tRNA synthetase  32.71 
 
 
576 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.426497  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  31.77 
 
 
590 aa  287  5e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0376  arginyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 
578 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2379  arginyl-tRNA synthetase  34.23 
 
 
579 aa  286  5.999999999999999e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222047  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4427  arginyl-tRNA synthetase  34.16 
 
 
581 aa  286  7e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5138  arginyl-tRNA synthetase  33.75 
 
 
578 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.447973  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4123  arginyl-tRNA synthetase  33.63 
 
 
581 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27471  arginyl-tRNA synthetase  34.92 
 
 
603 aa  284  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.471612 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02051  arginyl-tRNA synthetase  33.51 
 
 
603 aa  283  4.0000000000000003e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1554  arginyl-tRNA synthetase  33.63 
 
 
607 aa  283  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36013  predicted protein  33.45 
 
 
573 aa  283  5.000000000000001e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1577  arginyl-tRNA synthetase  33.22 
 
 
590 aa  283  6.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0397  arginyl-tRNA synthetase  33.99 
 
 
579 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004100  arginyl-tRNA synthetase  32.97 
 
 
577 aa  282  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000862961  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0550  arginyl-tRNA synthetase  33.51 
 
 
581 aa  281  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259334  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0006  arginyl-tRNA synthetase  33.75 
 
 
582 aa  281  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3845  arginyl-tRNA synthetase  33.51 
 
 
581 aa  280  5e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02051  arginyl-tRNA synthetase  33.88 
 
 
604 aa  280  5e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0474  arginyl-tRNA synthetase  33.51 
 
 
581 aa  280  6e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0542  arginyl-tRNA synthetase  32.94 
 
 
585 aa  280  6e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.475442  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0498  arginyl-tRNA synthetase  33.51 
 
 
581 aa  280  6e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0495  arginyl-tRNA synthetase  33.51 
 
 
581 aa  280  6e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0525  arginyl-tRNA synthetase  33.11 
 
 
585 aa  280  7e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0399  arginyl-tRNA synthetase  34.44 
 
 
578 aa  280  7e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3985  arginyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 
585 aa  280  7e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2108  arginyl-tRNA synthetase  33.27 
 
 
577 aa  278  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3671  arginyl-tRNA synthetase  31.92 
 
 
585 aa  279  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1310  arginyl-tRNA synthetase  33.27 
 
 
577 aa  279  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.363287 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3779  arginyl-tRNA synthetase  33.99 
 
 
581 aa  278  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.580214  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3496  arginyl-tRNA synthetase  32.62 
 
 
581 aa  277  3e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0443  arginyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
581 aa  277  3e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0456  arginyl-tRNA synthetase  32.62 
 
 
581 aa  277  4e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01847  arginyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 
577 aa  276  5e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1764  arginyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 
577 aa  276  5e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2613  arginyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 
577 aa  276  5e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253751 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3762  arginyl-tRNA synthetase  32.44 
 
 
581 aa  277  5e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0761225  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01836  hypothetical protein  33.09 
 
 
577 aa  276  5e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1971  arginyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 
577 aa  276  6e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3561  arginyl-tRNA synthetase  34.16 
 
 
588 aa  276  6e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.515123 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3673  arginyl-tRNA synthetase  32.62 
 
 
581 aa  276  6e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2566  arginyl-tRNA synthetase  36.12 
 
 
590 aa  276  9e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1756  arginyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 
577 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2169  arginyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 
577 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3956  arginyl-tRNA synthetase  34.32 
 
 
574 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02071  arginyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
604 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0189  arginyl-tRNA synthetase  33.39 
 
 
604 aa  275  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.177771  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2064  arginyl-tRNA synthetase  32.91 
 
 
577 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.10003 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>