More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4133 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4133  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 576 aa  1190    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4135  arginyl-tRNA synthetase  60.3 
 
 		 591 aa  719    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 574 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 640 aa  492  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1309  arginyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 613 aa  484  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.925397  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  35.06 
 
 		 566 aa  323  5e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1535  arginyl-tRNA synthetase  31.73 
 
 		 624 aa  297  3e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  33.68 
 
 		 562 aa  297  4e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  33.46 
 
 		 566 aa  294  2e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  33.62 
 
 		 562 aa  295  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  33.79 
 
 		 562 aa  295  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  33.62 
 
 		 562 aa  295  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  33.79 
 
 		 562 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  33.39 
 
 		 565 aa  295  2e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  32.87 
 
 		 562 aa  294  3e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 562 aa  293  4e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 562 aa  293  5e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  33.39 
 
 		 565 aa  293  7e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  32.87 
 
 		 562 aa  290  7e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1620  arginyl-tRNA synthetase  33.91 
 
 		 562 aa  276  8e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010963  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  32.98 
 
 		 565 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  32.66 
 
 		 571 aa  273  6e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1661  arginyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 		 599 aa  272  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  32.44 
 
 		 564 aa  269  1e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  32.74 
 
 		 563 aa  268  2.9999999999999995e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004100  arginyl-tRNA synthetase  33.58 
 
 		 577 aa  266  8e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000862961  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01368  arginyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 		 577 aa  266  8e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0443  arginyl-tRNA synthetase  31.95 
 
 		 581 aa  263  4e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3762  arginyl-tRNA synthetase  32.35 
 
 		 581 aa  263  8e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0761225  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1337  arginyl-tRNA synthetase  32.16 
 
 		 577 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014051 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2155  arginyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 		 576 aa  262  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0808745  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3357  arginyl-tRNA synthetase  32.43 
 
 		 581 aa  261  4e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2064  arginyl-tRNA synthetase  32.16 
 
 		 577 aa  260  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.10003 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1213  arginyl-tRNA synthetase  32.16 
 
 		 577 aa  260  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2110  arginyl-tRNA synthetase  31.98 
 
 		 577 aa  260  6e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.102153  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2069  arginyl-tRNA synthetase  32.16 
 
 		 577 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205082 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2124  arginyl-tRNA synthetase  32.16 
 
 		 577 aa  259  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  hitchhiker  0.0000003636 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0456  arginyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 		 581 aa  259  7e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3673  arginyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 		 581 aa  259  7e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0498  arginyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 		 581 aa  259  8e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0495  arginyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 		 581 aa  259  8e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0474  arginyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 		 581 aa  259  8e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2705  arginyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 		 598 aa  259  8e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3845  arginyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 		 581 aa  259  9e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3496  arginyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 		 581 aa  259  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2043  arginyl-tRNA synthetase  32.79 
 
 		 576 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2434  arginyl-tRNA synthetase  32.56 
 
 		 576 aa  258  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.035286 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45360  arginyl-tRNA synthetase  32.98 
 
 		 579 aa  258  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621239  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3779  arginyl-tRNA synthetase  32.2 
 
 		 581 aa  257  3e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.580214  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0550  arginyl-tRNA synthetase  32.38 
 
 		 581 aa  258  3e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259334  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2791  arginyl-tRNA synthetase  32.59 
 
 		 576 aa  257  5e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.263184 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1807  arginyl-tRNA synthetase  32.5 
 
 		 576 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.426497  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2084  arginyl-tRNA synthetase  32.68 
 
 		 576 aa  254  3e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4123  arginyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 		 581 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3474  arginyl-tRNA synthetase  33.63 
 
 		 580 aa  254  4.0000000000000004e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387689  normal  0.108328 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  32.08 
 
 		 565 aa  253  7e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2169  arginyl-tRNA synthetase  31.98 
 
 		 577 aa  253  8.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2173  arginyl-tRNA synthetase  32.11 
 
 		 576 aa  252  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2379  arginyl-tRNA synthetase  32.76 
 
 		 579 aa  253  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222047  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0899  arginyl-tRNA synthetase  32.06 
 
 		 566 aa  252  1e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0249713  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0466  arginyl-tRNA synthetase  30 
 
 		 564 aa  253  1e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.795792  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01847  arginyl-tRNA synthetase  31.79 
 
 		 577 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1764  arginyl-tRNA synthetase  31.79 
 
 		 577 aa  251  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1756  arginyl-tRNA synthetase  31.79 
 
 		 577 aa  251  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01836  hypothetical protein  31.79 
 
 		 577 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2613  arginyl-tRNA synthetase  31.79 
 
 		 577 aa  251  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253751 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2108  arginyl-tRNA synthetase  31.61 
 
 		 577 aa  251  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  32.21 
 
 		 563 aa  251  3e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0006  arginyl-tRNA synthetase  32.94 
 
 		 582 aa  251  3e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1310  arginyl-tRNA synthetase  31.79 
 
 		 577 aa  251  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363287 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2442  arginyl-tRNA synthetase  31.73 
 
 		 577 aa  251  4e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0535  arginyl-tRNA synthetase  32.15 
 
 		 579 aa  250  6e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.607806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1971  arginyl-tRNA synthetase  31.79 
 
 		 577 aa  249  8e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4134  arginyl-tRNA synthetase  30.57 
 
 		 577 aa  249  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440291  hitchhiker  0.000000042149 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4427  arginyl-tRNA synthetase  31.29 
 
 		 581 aa  248  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0378  arginyl-tRNA synthetase  32.15 
 
 		 581 aa  247  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2270  arginyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 		 576 aa  247  4e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4962  arginyl-tRNA synthetase  30.74 
 
 		 578 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0333  arginyl-tRNA synthetase  30.5 
 
 		 572 aa  246  8e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5089  arginyl-tRNA synthetase  30.04 
 
 		 578 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0533  arginyl-tRNA synthetase  31.85 
 
 		 581 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.142076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5139  arginyl-tRNA synthetase  30.04 
 
 		 578 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02786  arginyl-tRNA synthetase  30.54 
 
 		 576 aa  238  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2169  arginyl-tRNA synthetase  30.1 
 
 		 585 aa  238  2e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1215  arginyl-tRNA synthetase  31.05 
 
 		 563 aa  238  2e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0376  arginyl-tRNA synthetase  30.16 
 
 		 578 aa  238  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0955  arginyl-tRNA synthetase  29.71 
 
 		 577 aa  237  4e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66750  arginyl-tRNA synthetase  31.63 
 
 		 587 aa  237  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1110  arginyl-tRNA synthetase  30.09 
 
 		 582 aa  236  7e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0276  arginyl-tRNA synthetase  33.19 
 
 		 578 aa  235  2.0000000000000002e-60  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5788  arginyl-tRNA synthetase  31.25 
 
 		 587 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5138  arginyl-tRNA synthetase  30.57 
 
 		 578 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.447973  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0397  arginyl-tRNA synthetase  30.17 
 
 		 579 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1359  arginyl-tRNA synthetase  32.5 
 
 		 578 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0146  arginyl-tRNA synthetase  31.2 
 
 		 572 aa  229  8e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38727  arginyl-tRNA synthetase  29.39 
 
 		 603 aa  229  8e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.908762 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0269  arginyl-tRNA synthetase  32.25 
 
 		 576 aa  229  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3319  arginyl-tRNA synthetase  31.43 
 
 		 575 aa  228  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0525  arginyl-tRNA synthetase  30.9 
 
 		 585 aa  227  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0542  arginyl-tRNA synthetase  30.63 
 
 		 585 aa  227  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.475442  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>