More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_08210 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
566 aa  1159    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  56.54 
 
 
565 aa  652    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  53.62 
 
 
565 aa  645    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  53.79 
 
 
565 aa  649    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 
562 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1620  arginyl-tRNA synthetase  51.64 
 
 
562 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010963  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 
564 aa  578  1.0000000000000001e-163  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 
562 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 
562 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 
562 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 
562 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 
563 aa  572  1.0000000000000001e-162  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 
562 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 
562 aa  569  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 
562 aa  569  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 
566 aa  569  1e-161  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1535  arginyl-tRNA synthetase  50 
 
 
624 aa  571  1e-161  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 
563 aa  568  1e-160  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 
562 aa  558  1e-157  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0466  arginyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 
564 aa  548  1e-155  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.795792  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1215  arginyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 
563 aa  538  9.999999999999999e-153  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 
565 aa  536  1e-151  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0899  arginyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 
566 aa  505  1e-141  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0249713  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1270  arginyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 
562 aa  500  1e-140  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000463651  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2236  arginyl-tRNA synthetase  50.46 
 
 
433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000339277  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3474  arginyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 
580 aa  437  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387689  normal  0.108328 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0333  arginyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 
572 aa  403  1e-111  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38727  arginyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 
603 aa  405  1e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.908762 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 
574 aa  398  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 
640 aa  395  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1309  arginyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 
613 aa  384  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.925397  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  36.85 
 
 
571 aa  373  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4135  arginyl-tRNA synthetase  37.03 
 
 
591 aa  368  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06368  arginyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G14030)  33.76 
 
 
650 aa  345  1e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.908063  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2169  arginyl-tRNA synthetase  33.77 
 
 
585 aa  336  5.999999999999999e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  32.88 
 
 
590 aa  311  2e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3671  arginyl-tRNA synthetase  32.85 
 
 
585 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004100  arginyl-tRNA synthetase  32.85 
 
 
577 aa  301  3e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000862961  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0955  arginyl-tRNA synthetase  34.28 
 
 
577 aa  300  4e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01310  arginine-tRNA ligase, putative  31.95 
 
 
622 aa  300  7e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0173932  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2791  arginyl-tRNA synthetase  31.49 
 
 
576 aa  299  7e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.263184 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2173  arginyl-tRNA synthetase  31.96 
 
 
576 aa  300  7e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1577  arginyl-tRNA synthetase  32.91 
 
 
590 aa  297  3e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01368  arginyl-tRNA synthetase  32.61 
 
 
577 aa  296  5e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3238  arginyl-tRNA synthetase  31.75 
 
 
585 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4133  arginyl-tRNA synthetase  33.46 
 
 
576 aa  294  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02786  arginyl-tRNA synthetase  33.16 
 
 
576 aa  295  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1971  arginyl-tRNA synthetase  32.72 
 
 
577 aa  293  8e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2169  arginyl-tRNA synthetase  32.72 
 
 
577 aa  293  8e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1756  arginyl-tRNA synthetase  32.72 
 
 
577 aa  292  9e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2434  arginyl-tRNA synthetase  31.03 
 
 
576 aa  292  9e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.035286 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01847  arginyl-tRNA synthetase  32.72 
 
 
577 aa  292  1e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1764  arginyl-tRNA synthetase  32.72 
 
 
577 aa  292  1e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01836  hypothetical protein  32.72 
 
 
577 aa  292  1e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2613  arginyl-tRNA synthetase  32.72 
 
 
577 aa  292  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253751 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1807  arginyl-tRNA synthetase  32.26 
 
 
576 aa  292  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.426497  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2155  arginyl-tRNA synthetase  31.03 
 
 
576 aa  292  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0808745  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2043  arginyl-tRNA synthetase  31.03 
 
 
576 aa  292  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1310  arginyl-tRNA synthetase  32.54 
 
 
577 aa  291  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.363287 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2084  arginyl-tRNA synthetase  32.26 
 
 
576 aa  291  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0443  arginyl-tRNA synthetase  33.15 
 
 
581 aa  290  4e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2442  arginyl-tRNA synthetase  32.54 
 
 
577 aa  290  4e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1661  arginyl-tRNA synthetase  32.31 
 
 
599 aa  290  5.0000000000000004e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0006  arginyl-tRNA synthetase  32.01 
 
 
582 aa  290  5.0000000000000004e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3985  arginyl-tRNA synthetase  33.81 
 
 
585 aa  290  6e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2110  arginyl-tRNA synthetase  32 
 
 
577 aa  289  1e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.102153  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0438  arginyl-tRNA synthetase  31.74 
 
 
601 aa  288  1e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1213  arginyl-tRNA synthetase  31.88 
 
 
577 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1337  arginyl-tRNA synthetase  31.88 
 
 
577 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014051 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2064  arginyl-tRNA synthetase  31.88 
 
 
577 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.10003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2124  arginyl-tRNA synthetase  31.88 
 
 
577 aa  288  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  hitchhiker  0.0000003636 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3561  arginyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 
588 aa  288  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.515123 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2379  arginyl-tRNA synthetase  32.2 
 
 
579 aa  288  2.9999999999999996e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222047  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2069  arginyl-tRNA synthetase  31.88 
 
 
577 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205082 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2705  arginyl-tRNA synthetase  33.4 
 
 
598 aa  287  4e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4123  arginyl-tRNA synthetase  32.91 
 
 
581 aa  286  5e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4134  arginyl-tRNA synthetase  31.83 
 
 
577 aa  286  5e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440291  hitchhiker  0.000000042149 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2108  arginyl-tRNA synthetase  32.36 
 
 
577 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5138  arginyl-tRNA synthetase  32.64 
 
 
578 aa  286  7e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.447973  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3357  arginyl-tRNA synthetase  32.97 
 
 
581 aa  286  7e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3845  arginyl-tRNA synthetase  32.79 
 
 
581 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0474  arginyl-tRNA synthetase  32.79 
 
 
581 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0498  arginyl-tRNA synthetase  32.79 
 
 
581 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0495  arginyl-tRNA synthetase  32.79 
 
 
581 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2270  arginyl-tRNA synthetase  30.78 
 
 
576 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3762  arginyl-tRNA synthetase  32.35 
 
 
581 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0761225  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1359  arginyl-tRNA synthetase  34 
 
 
578 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3496  arginyl-tRNA synthetase  32.25 
 
 
581 aa  282  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0456  arginyl-tRNA synthetase  32.25 
 
 
581 aa  282  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3673  arginyl-tRNA synthetase  32.25 
 
 
581 aa  282  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4427  arginyl-tRNA synthetase  31.32 
 
 
581 aa  281  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0397  arginyl-tRNA synthetase  32.2 
 
 
579 aa  280  4e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0542  arginyl-tRNA synthetase  31.01 
 
 
585 aa  280  6e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.475442  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0525  arginyl-tRNA synthetase  31.18 
 
 
585 aa  279  9e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0550  arginyl-tRNA synthetase  32.43 
 
 
581 aa  279  9e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259334  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0739  arginyl-tRNA synthetase  33.04 
 
 
563 aa  278  2e-73  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0533  arginyl-tRNA synthetase  31.7 
 
 
581 aa  278  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.142076  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5089  arginyl-tRNA synthetase  31.71 
 
 
578 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257691  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0378  arginyl-tRNA synthetase  31.64 
 
 
581 aa  277  3e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45360  arginyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 
579 aa  278  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>