More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG2103 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
563 aa  1161    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  66.78 
 
 
564 aa  791    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0466  arginyl-tRNA synthetase  59.6 
 
 
564 aa  671    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.795792  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1215  arginyl-tRNA synthetase  58.42 
 
 
563 aa  667    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  81.88 
 
 
563 aa  966    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  55.39 
 
 
562 aa  629  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  54.26 
 
 
562 aa  627  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  54.43 
 
 
562 aa  626  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  54.26 
 
 
562 aa  626  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  54.26 
 
 
562 aa  627  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  54.26 
 
 
562 aa  622  1e-177  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 
562 aa  620  1e-176  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 
562 aa  620  1e-176  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 
562 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1620  arginyl-tRNA synthetase  55.64 
 
 
562 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010963  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1270  arginyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 
562 aa  588  1e-167  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000463651  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0899  arginyl-tRNA synthetase  50.18 
 
 
566 aa  580  1e-164  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0249713  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 
566 aa  568  1e-160  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 
565 aa  568  1e-160  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 
565 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 
566 aa  508  9.999999999999999e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 
565 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2236  arginyl-tRNA synthetase  56.09 
 
 
433 aa  503  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000339277  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 
565 aa  492  9.999999999999999e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1535  arginyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 
624 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3474  arginyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 
580 aa  423  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387689  normal  0.108328 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38727  arginyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 
603 aa  372  1e-102  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.908762 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 
571 aa  367  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0333  arginyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 
572 aa  359  7e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 
574 aa  356  5.999999999999999e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
640 aa  355  7.999999999999999e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1309  arginyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 
613 aa  347  2e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.925397  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4135  arginyl-tRNA synthetase  35.75 
 
 
591 aa  328  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2169  arginyl-tRNA synthetase  32.6 
 
 
585 aa  324  3e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06368  arginyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G14030)  32.79 
 
 
650 aa  318  2e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.908063  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2379  arginyl-tRNA synthetase  35.13 
 
 
579 aa  303  7.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222047  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01310  arginine-tRNA ligase, putative  34.67 
 
 
622 aa  302  1e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0173932  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1577  arginyl-tRNA synthetase  34.94 
 
 
590 aa  300  4e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02051  arginyl-tRNA synthetase  32.67 
 
 
603 aa  300  5e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3671  arginyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 
585 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0269  arginyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 
576 aa  295  2e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1554  arginyl-tRNA synthetase  33.67 
 
 
607 aa  290  5.0000000000000004e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 
590 aa  288  1e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02621  arginyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
607 aa  287  4e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0249545  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2173  arginyl-tRNA synthetase  32.71 
 
 
576 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4427  arginyl-tRNA synthetase  31.69 
 
 
581 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3956  arginyl-tRNA synthetase  35.12 
 
 
574 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3561  arginyl-tRNA synthetase  33.74 
 
 
588 aa  283  6.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.515123 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0443  arginyl-tRNA synthetase  33.16 
 
 
581 aa  282  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27471  arginyl-tRNA synthetase  33.81 
 
 
603 aa  282  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.471612 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3357  arginyl-tRNA synthetase  33.45 
 
 
581 aa  281  2e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02161  arginyl-tRNA synthetase  32.85 
 
 
602 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8944  Arginine--tRNA ligase  34.85 
 
 
584 aa  281  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0533  arginyl-tRNA synthetase  32.49 
 
 
581 aa  280  4e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.142076  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2791  arginyl-tRNA synthetase  34.13 
 
 
576 aa  280  4e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.263184 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0955  arginyl-tRNA synthetase  34.39 
 
 
577 aa  280  4e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1756  arginyl-tRNA synthetase  33.45 
 
 
577 aa  280  5e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02071  arginyl-tRNA synthetase  32.55 
 
 
604 aa  280  5e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01847  arginyl-tRNA synthetase  33.45 
 
 
577 aa  280  6e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1764  arginyl-tRNA synthetase  33.45 
 
 
577 aa  280  6e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01836  hypothetical protein  33.45 
 
 
577 aa  280  6e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5138  arginyl-tRNA synthetase  32.31 
 
 
578 aa  280  7e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.447973  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02786  arginyl-tRNA synthetase  32.47 
 
 
576 aa  280  7e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5089  arginyl-tRNA synthetase  32.34 
 
 
578 aa  279  8e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257691  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2169  arginyl-tRNA synthetase  33.27 
 
 
577 aa  279  8e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5139  arginyl-tRNA synthetase  32.78 
 
 
578 aa  279  8e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424681  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2613  arginyl-tRNA synthetase  33.45 
 
 
577 aa  279  8e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253751 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1310  arginyl-tRNA synthetase  33.45 
 
 
577 aa  279  9e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.363287 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4123  arginyl-tRNA synthetase  31.22 
 
 
581 aa  279  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2124  arginyl-tRNA synthetase  32.98 
 
 
577 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  hitchhiker  0.0000003636 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0378  arginyl-tRNA synthetase  30.53 
 
 
581 aa  278  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2069  arginyl-tRNA synthetase  32.98 
 
 
577 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205082 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1971  arginyl-tRNA synthetase  33.45 
 
 
577 aa  279  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3673  arginyl-tRNA synthetase  31.05 
 
 
581 aa  279  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2134  arginyl-tRNA synthetase  32.65 
 
 
590 aa  278  2e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2108  arginyl-tRNA synthetase  33.45 
 
 
577 aa  278  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2442  arginyl-tRNA synthetase  32.51 
 
 
577 aa  278  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1807  arginyl-tRNA synthetase  32.78 
 
 
576 aa  278  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.426497  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0456  arginyl-tRNA synthetase  31.05 
 
 
581 aa  278  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4962  arginyl-tRNA synthetase  32.16 
 
 
578 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3496  arginyl-tRNA synthetase  31.05 
 
 
581 aa  278  3e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1337  arginyl-tRNA synthetase  32.45 
 
 
577 aa  277  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014051 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2064  arginyl-tRNA synthetase  32.8 
 
 
577 aa  277  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.10003 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1213  arginyl-tRNA synthetase  32.8 
 
 
577 aa  277  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2043  arginyl-tRNA synthetase  33.64 
 
 
576 aa  277  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0189  arginyl-tRNA synthetase  32.44 
 
 
604 aa  276  9e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.177771  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0550  arginyl-tRNA synthetase  31.05 
 
 
581 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259334  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0276  arginyl-tRNA synthetase  32.72 
 
 
578 aa  275  2.0000000000000002e-72  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2084  arginyl-tRNA synthetase  32.59 
 
 
576 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2434  arginyl-tRNA synthetase  33.21 
 
 
576 aa  274  3e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.035286 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02051  arginyl-tRNA synthetase  32.19 
 
 
604 aa  274  3e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0399  arginyl-tRNA synthetase  32.22 
 
 
578 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2155  arginyl-tRNA synthetase  33.39 
 
 
576 aa  274  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0808745  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3845  arginyl-tRNA synthetase  31.51 
 
 
581 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3762  arginyl-tRNA synthetase  31.7 
 
 
581 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0761225  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1359  arginyl-tRNA synthetase  32.64 
 
 
578 aa  273  6e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0376  arginyl-tRNA synthetase  31.63 
 
 
578 aa  273  7e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2566  arginyl-tRNA synthetase  34.52 
 
 
590 aa  272  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0474  arginyl-tRNA synthetase  31.34 
 
 
581 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2060  arginyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
585 aa  271  2e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.571937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>