More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2606 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
574 aa  1162    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  61.34 
 
 
640 aa  739    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1309  arginyl-tRNA synthetase  61.01 
 
 
613 aa  723    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.925397  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4135  arginyl-tRNA synthetase  54.21 
 
 
591 aa  634  1e-180  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4133  arginyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 
576 aa  516  1.0000000000000001e-145  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 
566 aa  399  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 
566 aa  398  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1535  arginyl-tRNA synthetase  35.2 
 
 
624 aa  382  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 
565 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 
565 aa  382  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 
564 aa  381  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 
571 aa  373  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0333  arginyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 
572 aa  372  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  37.25 
 
 
562 aa  365  1e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  37.23 
 
 
562 aa  365  2e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 
563 aa  362  8e-99  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 
565 aa  362  1e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3474  arginyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 
580 aa  359  8e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387689  normal  0.108328 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  36.87 
 
 
562 aa  359  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  36.87 
 
 
562 aa  359  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  36.54 
 
 
562 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2064  arginyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 
577 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.10003 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  36.69 
 
 
562 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1213  arginyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 
577 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2069  arginyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 
577 aa  357  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205082 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2124  arginyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 
577 aa  356  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  hitchhiker  0.0000003636 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 
563 aa  356  5.999999999999999e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 
562 aa  356  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1337  arginyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 
577 aa  355  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014051 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  37.21 
 
 
565 aa  355  2e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 
562 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2442  arginyl-tRNA synthetase  39.03 
 
 
577 aa  353  4e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  36.2 
 
 
562 aa  352  1e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004100  arginyl-tRNA synthetase  36.69 
 
 
577 aa  352  1e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000862961  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01847  arginyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 
577 aa  349  7e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1764  arginyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 
577 aa  349  7e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01836  hypothetical protein  38.18 
 
 
577 aa  349  7e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1310  arginyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 
577 aa  349  8e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.363287 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2613  arginyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 
577 aa  349  8e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253751 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1756  arginyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 
577 aa  348  1e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2169  arginyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 
577 aa  348  2e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01368  arginyl-tRNA synthetase  36.04 
 
 
577 aa  348  2e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1661  arginyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 
599 aa  347  3e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1971  arginyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 
577 aa  346  6e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2169  arginyl-tRNA synthetase  37.54 
 
 
585 aa  345  1e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2173  arginyl-tRNA synthetase  36.92 
 
 
576 aa  345  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2108  arginyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 
577 aa  342  8e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2270  arginyl-tRNA synthetase  36.62 
 
 
576 aa  342  8e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0955  arginyl-tRNA synthetase  36.3 
 
 
577 aa  342  1e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1620  arginyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 
562 aa  341  2e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010963  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1807  arginyl-tRNA synthetase  36.13 
 
 
576 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.426497  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2043  arginyl-tRNA synthetase  37.41 
 
 
576 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2434  arginyl-tRNA synthetase  37.22 
 
 
576 aa  338  1.9999999999999998e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.035286 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2379  arginyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 
579 aa  338  1.9999999999999998e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222047  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2705  arginyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 
598 aa  337  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2155  arginyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 
576 aa  337  2.9999999999999997e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0808745  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2110  arginyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 
577 aa  337  5e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.102153  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2084  arginyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 
576 aa  335  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3357  arginyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 
581 aa  335  1e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2791  arginyl-tRNA synthetase  36.3 
 
 
576 aa  334  3e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.263184 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0899  arginyl-tRNA synthetase  35.74 
 
 
566 aa  333  6e-90  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0249713  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1215  arginyl-tRNA synthetase  36.12 
 
 
563 aa  331  2e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0443  arginyl-tRNA synthetase  35.58 
 
 
581 aa  329  8e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3762  arginyl-tRNA synthetase  35.75 
 
 
581 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0761225  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0466  arginyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 
564 aa  327  4.0000000000000003e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.795792  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1577  arginyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 
590 aa  326  6e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5574  arginyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 
619 aa  325  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.469409  normal  0.593378 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4123  arginyl-tRNA synthetase  36.2 
 
 
581 aa  325  1e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45360  arginyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 
579 aa  324  3e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621239  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4134  arginyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 
577 aa  323  6e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440291  hitchhiker  0.000000042149 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0456  arginyl-tRNA synthetase  35.52 
 
 
581 aa  323  6e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3673  arginyl-tRNA synthetase  35.52 
 
 
581 aa  323  6e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2566  arginyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 
590 aa  323  7e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3496  arginyl-tRNA synthetase  35.52 
 
 
581 aa  323  8e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0550  arginyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 
581 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259334  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0498  arginyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 
581 aa  319  7e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0495  arginyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 
581 aa  319  7e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0474  arginyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 
581 aa  319  7e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3845  arginyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 
581 aa  319  7e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4427  arginyl-tRNA synthetase  34.46 
 
 
581 aa  318  1e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3779  arginyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 
581 aa  318  1e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.580214  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1270  arginyl-tRNA synthetase  35.27 
 
 
562 aa  319  1e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000463651  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0525  arginyl-tRNA synthetase  34.04 
 
 
585 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0542  arginyl-tRNA synthetase  33.86 
 
 
585 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.475442  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1359  arginyl-tRNA synthetase  35.5 
 
 
578 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0397  arginyl-tRNA synthetase  35.03 
 
 
579 aa  312  9e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0276  arginyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 
578 aa  312  1e-83  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02786  arginyl-tRNA synthetase  35.44 
 
 
576 aa  310  2.9999999999999997e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0533  arginyl-tRNA synthetase  33.78 
 
 
581 aa  310  5e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.142076  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0378  arginyl-tRNA synthetase  35.13 
 
 
581 aa  309  9e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0535  arginyl-tRNA synthetase  34.9 
 
 
579 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.607806  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5138  arginyl-tRNA synthetase  34.4 
 
 
578 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.447973  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0006  arginyl-tRNA synthetase  34.03 
 
 
582 aa  307  4.0000000000000004e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0269  arginyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 
576 aa  306  6e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3671  arginyl-tRNA synthetase  33.84 
 
 
585 aa  306  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1110  arginyl-tRNA synthetase  34.56 
 
 
582 aa  303  4.0000000000000003e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0630  arginyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 
593 aa  302  9e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3985  arginyl-tRNA synthetase  33.68 
 
 
585 aa  301  3e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36013  predicted protein  34.47 
 
 
573 aa  300  4e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3277  arginyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 
570 aa  300  4e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.431918  normal  0.529534 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>