More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1535 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1535  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
624 aa  1277    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  50 
 
 
566 aa  572  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 
565 aa  562  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 
565 aa  561  1e-158  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 
565 aa  523  1e-147  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 
562 aa  523  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 
562 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 
562 aa  513  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 
562 aa  512  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 
562 aa  514  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 
562 aa  510  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 
562 aa  511  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 
562 aa  510  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 
564 aa  508  9.999999999999999e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 
566 aa  507  9.999999999999999e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
563 aa  504  1e-141  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1620  arginyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 
562 aa  498  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010963  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 
562 aa  497  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 
563 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0466  arginyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 
564 aa  489  1e-137  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.795792  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 
565 aa  476  1e-133  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1215  arginyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 
563 aa  465  9.999999999999999e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1270  arginyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 
562 aa  450  1e-125  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000463651  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2236  arginyl-tRNA synthetase  48.05 
 
 
433 aa  438  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000339277  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0899  arginyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 
566 aa  434  1e-120  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0249713  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3474  arginyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 
580 aa  421  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387689  normal  0.108328 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  35.2 
 
 
574 aa  382  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  34.92 
 
 
640 aa  375  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1309  arginyl-tRNA synthetase  35.84 
 
 
613 aa  377  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.925397  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0333  arginyl-tRNA synthetase  37.38 
 
 
572 aa  371  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  36.8 
 
 
571 aa  368  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4135  arginyl-tRNA synthetase  34.57 
 
 
591 aa  342  1e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2169  arginyl-tRNA synthetase  32.44 
 
 
585 aa  329  9e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38727  arginyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 
603 aa  310  4e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.908762 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1359  arginyl-tRNA synthetase  34.61 
 
 
578 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2791  arginyl-tRNA synthetase  33.88 
 
 
576 aa  303  8.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.263184 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4427  arginyl-tRNA synthetase  33.45 
 
 
581 aa  302  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2434  arginyl-tRNA synthetase  33.64 
 
 
576 aa  302  2e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.035286 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1577  arginyl-tRNA synthetase  34.28 
 
 
590 aa  300  6e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2043  arginyl-tRNA synthetase  33.27 
 
 
576 aa  300  7e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0443  arginyl-tRNA synthetase  34.32 
 
 
581 aa  300  7e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2155  arginyl-tRNA synthetase  33.27 
 
 
576 aa  299  8e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0808745  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02786  arginyl-tRNA synthetase  34.3 
 
 
576 aa  297  3e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4133  arginyl-tRNA synthetase  31.73 
 
 
576 aa  297  4e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1756  arginyl-tRNA synthetase  34.05 
 
 
577 aa  296  6e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004100  arginyl-tRNA synthetase  32.72 
 
 
577 aa  296  8e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000862961  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2173  arginyl-tRNA synthetase  33.39 
 
 
576 aa  296  8e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0533  arginyl-tRNA synthetase  33.82 
 
 
581 aa  295  1e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.142076  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2169  arginyl-tRNA synthetase  33.87 
 
 
577 aa  295  1e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01847  arginyl-tRNA synthetase  34.05 
 
 
577 aa  295  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1764  arginyl-tRNA synthetase  34.05 
 
 
577 aa  295  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01836  hypothetical protein  34.05 
 
 
577 aa  295  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2613  arginyl-tRNA synthetase  34.05 
 
 
577 aa  295  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253751 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3671  arginyl-tRNA synthetase  34.55 
 
 
585 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0378  arginyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 
581 aa  295  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2084  arginyl-tRNA synthetase  33.76 
 
 
576 aa  294  3e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1310  arginyl-tRNA synthetase  34.11 
 
 
577 aa  294  3e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.363287 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1971  arginyl-tRNA synthetase  34.05 
 
 
577 aa  294  4e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4134  arginyl-tRNA synthetase  31.33 
 
 
577 aa  293  6e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440291  hitchhiker  0.000000042149 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1807  arginyl-tRNA synthetase  33.94 
 
 
576 aa  293  7e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.426497  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45360  arginyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 
579 aa  293  7e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621239  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3956  arginyl-tRNA synthetase  35.09 
 
 
574 aa  293  7e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2442  arginyl-tRNA synthetase  33.99 
 
 
577 aa  293  8e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3357  arginyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 
581 aa  292  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3238  arginyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 
585 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2108  arginyl-tRNA synthetase  33.94 
 
 
577 aa  291  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0535  arginyl-tRNA synthetase  32.98 
 
 
579 aa  291  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.607806  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4123  arginyl-tRNA synthetase  33.88 
 
 
581 aa  290  7e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0276  arginyl-tRNA synthetase  33.76 
 
 
578 aa  290  8e-77  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2124  arginyl-tRNA synthetase  32.97 
 
 
577 aa  289  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  hitchhiker  0.0000003636 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01368  arginyl-tRNA synthetase  32.42 
 
 
577 aa  289  9e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1213  arginyl-tRNA synthetase  32.97 
 
 
577 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2064  arginyl-tRNA synthetase  32.97 
 
 
577 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.10003 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2069  arginyl-tRNA synthetase  32.97 
 
 
577 aa  289  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205082 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3845  arginyl-tRNA synthetase  33.21 
 
 
581 aa  289  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5089  arginyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 
578 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257691  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0474  arginyl-tRNA synthetase  33.21 
 
 
581 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5138  arginyl-tRNA synthetase  33.15 
 
 
578 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.447973  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0495  arginyl-tRNA synthetase  33.21 
 
 
581 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0498  arginyl-tRNA synthetase  33.21 
 
 
581 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2566  arginyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 
590 aa  288  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1337  arginyl-tRNA synthetase  32.97 
 
 
577 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4962  arginyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 
578 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2270  arginyl-tRNA synthetase  32.36 
 
 
576 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0550  arginyl-tRNA synthetase  33.27 
 
 
581 aa  287  4e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259334  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3496  arginyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 
581 aa  287  4e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0456  arginyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 
581 aa  287  4e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3673  arginyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 
581 aa  287  4e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2379  arginyl-tRNA synthetase  32.37 
 
 
579 aa  286  1.0000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222047  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3762  arginyl-tRNA synthetase  32.91 
 
 
581 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0761225  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3779  arginyl-tRNA synthetase  32.85 
 
 
581 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.580214  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0542  arginyl-tRNA synthetase  34.46 
 
 
585 aa  283  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.475442  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0525  arginyl-tRNA synthetase  34.28 
 
 
585 aa  283  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0397  arginyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 
579 aa  282  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0438  arginyl-tRNA synthetase  32.96 
 
 
601 aa  282  1e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2110  arginyl-tRNA synthetase  31.75 
 
 
577 aa  282  2e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.102153  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0399  arginyl-tRNA synthetase  32.35 
 
 
578 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5139  arginyl-tRNA synthetase  33.94 
 
 
578 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424681  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01310  arginine-tRNA ligase, putative  32.63 
 
 
622 aa  281  3e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0173932  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0006  arginyl-tRNA synthetase  33.64 
 
 
582 aa  281  3e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.653166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>