More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1915 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  53.62 
 
 		 566 aa  645    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 565 aa  1155    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  99.47 
 
 		 565 aa  1148    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  51.33 
 
 		 565 aa  581  1e-164  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 		 565 aa  580  1e-164  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 564 aa  574  1.0000000000000001e-162  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  49.82 
 
 		 563 aa  568  1e-160  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 		 563 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1535  arginyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 624 aa  562  1.0000000000000001e-159  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 566 aa  559  1e-158  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1620  arginyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 		 562 aa  551  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010963  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 		 562 aa  550  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 		 562 aa  550  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 		 562 aa  543  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 562 aa  545  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 562 aa  542  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 562 aa  545  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 		 562 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 		 562 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0466  arginyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 		 564 aa  539  9.999999999999999e-153  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.795792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 		 562 aa  531  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1215  arginyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 		 563 aa  523  1e-147  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1270  arginyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 		 562 aa  495  1e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000463651  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0899  arginyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 566 aa  489  1e-137  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0249713  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3474  arginyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 580 aa  455  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387689  normal  0.108328 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2236  arginyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 433 aa  442  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000339277  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 		 571 aa  397  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0333  arginyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 		 572 aa  389  1e-107  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 		 574 aa  384  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1309  arginyl-tRNA synthetase  38.47 
 
 		 613 aa  373  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.925397  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 		 640 aa  370  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2169  arginyl-tRNA synthetase  36.72 
 
 		 585 aa  360  5e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38727  arginyl-tRNA synthetase  36.05 
 
 		 603 aa  345  1e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.908762 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4135  arginyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 		 591 aa  337  5e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06368  arginyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G14030)  33.49 
 
 		 650 aa  336  7.999999999999999e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.908063  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  35.78 
 
 		 590 aa  333  5e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0378  arginyl-tRNA synthetase  36.48 
 
 		 581 aa  319  9e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3671  arginyl-tRNA synthetase  36.2 
 
 		 585 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0533  arginyl-tRNA synthetase  35.75 
 
 		 581 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.142076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4427  arginyl-tRNA synthetase  36 
 
 		 581 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1577  arginyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 		 590 aa  310  5.9999999999999995e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3319  arginyl-tRNA synthetase  36.8 
 
 		 575 aa  310  5.9999999999999995e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1807  arginyl-tRNA synthetase  33.45 
 
 		 576 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.426497  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4134  arginyl-tRNA synthetase  33.45 
 
 		 577 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440291  hitchhiker  0.000000042149 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2084  arginyl-tRNA synthetase  33.28 
 
 		 576 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004100  arginyl-tRNA synthetase  35.2 
 
 		 577 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000862961  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3779  arginyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 		 581 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.580214  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0443  arginyl-tRNA synthetase  35.69 
 
 		 581 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5138  arginyl-tRNA synthetase  35.95 
 
 		 578 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.447973  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2566  arginyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 		 590 aa  303  8.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02786  arginyl-tRNA synthetase  35.42 
 
 		 576 aa  302  1e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4123  arginyl-tRNA synthetase  34.85 
 
 		 581 aa  301  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2169  arginyl-tRNA synthetase  33.56 
 
 		 577 aa  301  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1310  arginyl-tRNA synthetase  33.39 
 
 		 577 aa  301  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363287 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3496  arginyl-tRNA synthetase  34.66 
 
 		 581 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01847  arginyl-tRNA synthetase  33.39 
 
 		 577 aa  300  3e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1764  arginyl-tRNA synthetase  33.39 
 
 		 577 aa  300  3e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1756  arginyl-tRNA synthetase  33.39 
 
 		 577 aa  300  3e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0399  arginyl-tRNA synthetase  35.7 
 
 		 578 aa  300  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1971  arginyl-tRNA synthetase  33.39 
 
 		 577 aa  301  3e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01836  hypothetical protein  33.39 
 
 		 577 aa  300  3e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0456  arginyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 		 581 aa  301  3e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2613  arginyl-tRNA synthetase  33.39 
 
 		 577 aa  300  3e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253751 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3673  arginyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 		 581 aa  301  3e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2379  arginyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 		 579 aa  299  9e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222047  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2705  arginyl-tRNA synthetase  36.5 
 
 		 598 aa  298  1e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3357  arginyl-tRNA synthetase  34.9 
 
 		 581 aa  298  2e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3238  arginyl-tRNA synthetase  36.64 
 
 		 585 aa  297  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0955  arginyl-tRNA synthetase  34.75 
 
 		 577 aa  297  3e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2108  arginyl-tRNA synthetase  33.22 
 
 		 577 aa  297  4e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2155  arginyl-tRNA synthetase  33.39 
 
 		 576 aa  297  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0808745  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2173  arginyl-tRNA synthetase  31.62 
 
 		 576 aa  296  5e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2434  arginyl-tRNA synthetase  33.39 
 
 		 576 aa  296  5e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.035286 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2043  arginyl-tRNA synthetase  33.39 
 
 		 576 aa  296  6e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2124  arginyl-tRNA synthetase  32.88 
 
 		 577 aa  296  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  hitchhiker  0.0000003636 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2069  arginyl-tRNA synthetase  32.88 
 
 		 577 aa  296  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205082 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0535  arginyl-tRNA synthetase  35.89 
 
 		 579 aa  296  9e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.607806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1337  arginyl-tRNA synthetase  32.37 
 
 		 577 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4133  arginyl-tRNA synthetase  33.39 
 
 		 576 aa  295  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2064  arginyl-tRNA synthetase  32.37 
 
 		 577 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.10003 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1213  arginyl-tRNA synthetase  32.37 
 
 		 577 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01310  arginine-tRNA ligase, putative  37.11 
 
 		 622 aa  294  3e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0173932  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0397  arginyl-tRNA synthetase  35.77 
 
 		 579 aa  294  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3845  arginyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 		 581 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36013  predicted protein  34.09 
 
 		 573 aa  294  3e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0474  arginyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 		 581 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0498  arginyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 		 581 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0495  arginyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 		 581 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0550  arginyl-tRNA synthetase  34.85 
 
 		 581 aa  293  5e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259334  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3762  arginyl-tRNA synthetase  34.92 
 
 		 581 aa  293  7e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0761225  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0607  arginyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 585 aa  293  8e-78  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.872641  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3561  arginyl-tRNA synthetase  35.25 
 
 		 588 aa  291  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515123 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5139  arginyl-tRNA synthetase  36.52 
 
 		 578 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3985  arginyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 		 585 aa  290  3e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01368  arginyl-tRNA synthetase  33.93 
 
 		 577 aa  290  4e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02051  arginyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 		 603 aa  290  4e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1110  arginyl-tRNA synthetase  33.79 
 
 		 582 aa  289  9e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2110  arginyl-tRNA synthetase  34.05 
 
 		 577 aa  288  1e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.102153  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3956  arginyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 574 aa  288  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4962  arginyl-tRNA synthetase  35.89 
 
 		 578 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>