More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0169 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3171  arginyl-tRNA synthetase  72.8 
 
 		 595 aa  834    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1291  arginyl-tRNA synthetase  70.1 
 
 		 591 aa  791    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.456077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0169  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 602 aa  1200    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1420  arginyl-tRNA synthetase  70.53 
 
 		 600 aa  767    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.435817  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2012  arginyl-tRNA synthetase  69.6 
 
 		 583 aa  781    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.750372  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1008  arginyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 569 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1739  arginyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 		 567 aa  419  1e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2213  arginyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 		 555 aa  385  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0216  arginyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 		 558 aa  375  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2837  arginyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 		 555 aa  372  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0222286 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1508  arginyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 		 558 aa  364  2e-99  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.818041  normal  0.873479 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0271  arginyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 		 558 aa  360  3e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0568  arginyl-tRNA synthetase  34.99 
 
 		 566 aa  351  2e-95  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.078202  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1102  arginyl-tRNA synthetase  33.45 
 
 		 574 aa  350  6e-95  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1633  arginyl-tRNA synthetase  34.77 
 
 		 566 aa  348  1e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0268  arginyl-tRNA synthetase  34.11 
 
 		 566 aa  344  2e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.107833  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0288  arginyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 		 559 aa  341  2e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.124809 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0350  arginyl-tRNA synthetase  33.78 
 
 		 569 aa  333  6e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0562  arginyl-tRNA synthetase  35.52 
 
 		 550 aa  330  5.0000000000000004e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  29.54 
 
 		 566 aa  241  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  30.99 
 
 		 553 aa  238  3e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0564  arginyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 		 635 aa  238  3e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4135  arginyl-tRNA synthetase  32.12 
 
 		 591 aa  237  4e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  29.22 
 
 		 565 aa  234  3e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1577  arginyl-tRNA synthetase  28.9 
 
 		 621 aa  233  1e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.879493  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  29.05 
 
 		 565 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  29.53 
 
 		 553 aa  230  7e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  29.53 
 
 		 553 aa  230  7e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  27.56 
 
 		 566 aa  226  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2678  arginyl-tRNA synthetase  29.07 
 
 		 592 aa  225  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0438  arginyl-tRNA synthetase  30.43 
 
 		 601 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1577  arginyl-tRNA synthetase  29.78 
 
 		 635 aa  220  7e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  29.69 
 
 		 574 aa  219  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0329  arginyl-tRNA synthetase  28.77 
 
 		 613 aa  218  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  28.81 
 
 		 551 aa  217  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2451  arginyl-tRNA synthetase  29.41 
 
 		 612 aa  216  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2318  arginyl-tRNA synthetase  26.7 
 
 		 593 aa  216  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.291854 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1017  arginyl-tRNA synthetase  28.31 
 
 		 630 aa  214  2.9999999999999995e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.341311 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1715  arginyl-tRNA synthetase  29 
 
 		 619 aa  214  3.9999999999999995e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1036  arginyl-tRNA synthetase  28.13 
 
 		 628 aa  213  9e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475054 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0039  arginyl-tRNA synthetase  27.65 
 
 		 599 aa  213  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285018  normal  0.0776701 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1309  arginyl-tRNA synthetase  29.89 
 
 		 613 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.925397  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  29.89 
 
 		 551 aa  212  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1935  arginyl-tRNA synthetase  27.99 
 
 		 564 aa  211  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000950947  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  29.32 
 
 		 551 aa  211  4e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1270  arginyl-tRNA synthetase  29.1 
 
 		 562 aa  210  5e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000463651  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  27.64 
 
 		 556 aa  209  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0632  arginyl-tRNA synthetase  29.49 
 
 		 564 aa  209  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  27.48 
 
 		 556 aa  208  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  27.96 
 
 		 589 aa  209  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  27.64 
 
 		 556 aa  209  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  27.18 
 
 		 565 aa  208  2e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  27.64 
 
 		 556 aa  207  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  27.48 
 
 		 556 aa  207  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  27.48 
 
 		 556 aa  207  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  27.73 
 
 		 589 aa  207  6e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  30.4 
 
 		 640 aa  206  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  27.63 
 
 		 556 aa  206  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  27.63 
 
 		 556 aa  206  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  27.35 
 
 		 562 aa  205  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  27.32 
 
 		 556 aa  205  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  27.32 
 
 		 556 aa  205  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0586  arginyl-tRNA synthetase  27.32 
 
 		 632 aa  204  3e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000562405 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0529  arginyl-tRNA synthetase  29.74 
 
 		 614 aa  204  4e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000661895 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  27.78 
 
 		 562 aa  204  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  29.09 
 
 		 564 aa  203  8e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  28.69 
 
 		 562 aa  202  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0599  arginyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 596 aa  202  1.9999999999999998e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1846  arginyl-tRNA synthetase  25.55 
 
 		 625 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  27.96 
 
 		 562 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0686  arginyl-tRNA synthetase  24.51 
 
 		 628 aa  201  3e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0186  arginyl-tRNA synthetase  27.05 
 
 		 597 aa  201  3e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 		 570 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4155  arginyl-tRNA synthetase  33.22 
 
 		 553 aa  201  5e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.60572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  27.15 
 
 		 556 aa  200  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 559 aa  201  5e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  26.83 
 
 		 561 aa  200  6e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  25.79 
 
 		 571 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05910  arginyl-tRNA synthetase  26.6 
 
 		 592 aa  199  1.0000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  27.02 
 
 		 562 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  28.03 
 
 		 563 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0441  arginyl-tRNA synthetase  28.95 
 
 		 629 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  28.36 
 
 		 590 aa  198  3e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  26.69 
 
 		 562 aa  198  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  26.39 
 
 		 562 aa  197  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0285  arginyl-tRNA synthetase  26.42 
 
 		 564 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0318968  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4350  arginyl-tRNA synthetase  31.08 
 
 		 550 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301994 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  27.02 
 
 		 562 aa  197  6e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  27.02 
 
 		 562 aa  197  6e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2296  arginyl-tRNA synthetase  30.16 
 
 		 550 aa  197  6e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.847928 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  30.34 
 
 		 586 aa  196  7e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1756  arginyl-tRNA synthetase  27.81 
 
 		 630 aa  196  7e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0324309  hitchhiker  0.00414873 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  26.56 
 
 		 562 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  27.24 
 
 		 565 aa  196  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0109  arginyl-tRNA synthetase  28.36 
 
 		 562 aa  196  1e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  28.46 
 
 		 554 aa  195  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  27.33 
 
 		 563 aa  195  2e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004100  arginyl-tRNA synthetase  27.29 
 
 		 577 aa  195  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000862961  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0124  arginyl-tRNA synthetase  28.2 
 
 		 562 aa  195  2e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4133  arginyl-tRNA synthetase  27.44 
 
 		 576 aa  194  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>