More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0599 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0251  arginyl-tRNA synthetase  53.59 
 
 
592 aa  655    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2678  arginyl-tRNA synthetase  57.21 
 
 
592 aa  714    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05910  arginyl-tRNA synthetase  53.1 
 
 
592 aa  665    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0186  arginyl-tRNA synthetase  53.26 
 
 
597 aa  660    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2318  arginyl-tRNA synthetase  56.78 
 
 
593 aa  686    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.291854 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1577  arginyl-tRNA synthetase  57.17 
 
 
621 aa  719    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.879493  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0599  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
596 aa  1233    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0039  arginyl-tRNA synthetase  53.07 
 
 
599 aa  666    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285018  normal  0.0776701 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6433  arginyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 
642 aa  624  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.490682  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0267  arginyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 
597 aa  618  1e-176  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
590 aa  457  1e-127  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0607  arginyl-tRNA synthetase  36.74 
 
 
585 aa  367  1e-100  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.872641  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  29.38 
 
 
566 aa  238  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0438  arginyl-tRNA synthetase  30.42 
 
 
601 aa  233  6e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  26.74 
 
 
565 aa  231  4e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 
564 aa  230  5e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  27.96 
 
 
565 aa  229  1e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  26.74 
 
 
565 aa  229  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  28.2 
 
 
565 aa  228  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1535  arginyl-tRNA synthetase  27.48 
 
 
624 aa  228  3e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0466  arginyl-tRNA synthetase  27.56 
 
 
564 aa  227  4e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.795792  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  27.06 
 
 
562 aa  226  7e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  27.59 
 
 
562 aa  226  8e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 
562 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  28.01 
 
 
640 aa  221  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  28.37 
 
 
563 aa  220  6e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  28.3 
 
 
562 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0899  arginyl-tRNA synthetase  28.01 
 
 
566 aa  218  2e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0249713  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  27.72 
 
 
562 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  27.95 
 
 
562 aa  217  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  27.95 
 
 
562 aa  217  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  26.4 
 
 
566 aa  217  5e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  27.26 
 
 
562 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  26.93 
 
 
563 aa  211  4e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  26.05 
 
 
571 aa  211  4e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  27.23 
 
 
562 aa  210  5e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  25.3 
 
 
574 aa  210  6e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0562  arginyl-tRNA synthetase  28.3 
 
 
550 aa  207  4e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1620  arginyl-tRNA synthetase  26.85 
 
 
562 aa  206  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010963  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1215  arginyl-tRNA synthetase  27.59 
 
 
563 aa  205  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1309  arginyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 
613 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.925397  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1270  arginyl-tRNA synthetase  25.43 
 
 
562 aa  202  9.999999999999999e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000463651  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4135  arginyl-tRNA synthetase  26.02 
 
 
591 aa  201  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0333  arginyl-tRNA synthetase  26.54 
 
 
572 aa  196  9e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2705  arginyl-tRNA synthetase  28.26 
 
 
598 aa  191  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1102  arginyl-tRNA synthetase  27.39 
 
 
574 aa  190  5e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0564  arginyl-tRNA synthetase  26.86 
 
 
635 aa  189  1e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38727  arginyl-tRNA synthetase  26.98 
 
 
603 aa  188  3e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.908762 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2236  arginyl-tRNA synthetase  26.77 
 
 
433 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000339277  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0268  arginyl-tRNA synthetase  27.02 
 
 
566 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.107833  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1633  arginyl-tRNA synthetase  26.8 
 
 
566 aa  182  1e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0568  arginyl-tRNA synthetase  26.8 
 
 
566 aa  181  4.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.078202  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1274  arginyl-tRNA synthetase  26.86 
 
 
594 aa  179  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000144018  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01310  arginine-tRNA ligase, putative  27.64 
 
 
622 aa  179  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0173932  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1008  arginyl-tRNA synthetase  27.36 
 
 
569 aa  178  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0169  arginyl-tRNA synthetase  24.03 
 
 
602 aa  178  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2169  arginyl-tRNA synthetase  25.72 
 
 
585 aa  177  5e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0216  arginyl-tRNA synthetase  24.58 
 
 
558 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1291  arginyl-tRNA synthetase  26.6 
 
 
591 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.456077  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1420  arginyl-tRNA synthetase  24.8 
 
 
600 aa  172  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.435817  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1508  arginyl-tRNA synthetase  26.02 
 
 
558 aa  171  4e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.818041  normal  0.873479 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0271  arginyl-tRNA synthetase  25.3 
 
 
558 aa  171  5e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3474  arginyl-tRNA synthetase  26.67 
 
 
580 aa  171  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387689  normal  0.108328 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1715  arginyl-tRNA synthetase  25.86 
 
 
619 aa  170  6e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1739  arginyl-tRNA synthetase  25.34 
 
 
567 aa  169  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4133  arginyl-tRNA synthetase  25.5 
 
 
576 aa  168  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3171  arginyl-tRNA synthetase  24.56 
 
 
595 aa  168  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0288  arginyl-tRNA synthetase  25.85 
 
 
559 aa  169  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.124809 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3319  arginyl-tRNA synthetase  26.52 
 
 
575 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0329  arginyl-tRNA synthetase  27.17 
 
 
613 aa  166  8e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0153  arginyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 
572 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0686  arginyl-tRNA synthetase  25.11 
 
 
628 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8944  Arginine--tRNA ligase  26.37 
 
 
584 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2213  arginyl-tRNA synthetase  23.55 
 
 
555 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2837  arginyl-tRNA synthetase  24.64 
 
 
555 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0222286 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2791  arginyl-tRNA synthetase  24.39 
 
 
576 aa  164  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.263184 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4389  arginyl-tRNA synthetase  25.75 
 
 
613 aa  162  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2451  arginyl-tRNA synthetase  25.61 
 
 
612 aa  161  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2012  arginyl-tRNA synthetase  24.27 
 
 
583 aa  160  5e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.750372  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0350  arginyl-tRNA synthetase  26.26 
 
 
569 aa  160  5e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2379  arginyl-tRNA synthetase  26.51 
 
 
579 aa  159  9e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222047  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1846  arginyl-tRNA synthetase  26.95 
 
 
625 aa  159  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2155  arginyl-tRNA synthetase  24.22 
 
 
576 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0808745  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01368  arginyl-tRNA synthetase  24.39 
 
 
577 aa  159  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2434  arginyl-tRNA synthetase  24.38 
 
 
576 aa  159  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.035286 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004100  arginyl-tRNA synthetase  24.76 
 
 
577 aa  158  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000862961  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1337  arginyl-tRNA synthetase  26.39 
 
 
577 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014051 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3151  arginyl-tRNA synthetase  25.32 
 
 
585 aa  159  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2043  arginyl-tRNA synthetase  24.22 
 
 
576 aa  157  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06368  arginyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G14030)  26.06 
 
 
650 aa  157  5.0000000000000005e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.908063  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1213  arginyl-tRNA synthetase  26.2 
 
 
577 aa  157  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2064  arginyl-tRNA synthetase  26.2 
 
 
577 aa  157  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.10003 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3357  arginyl-tRNA synthetase  25.04 
 
 
581 aa  157  8e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0955  arginyl-tRNA synthetase  25.36 
 
 
577 aa  156  8e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01847  arginyl-tRNA synthetase  24.47 
 
 
577 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1756  arginyl-tRNA synthetase  24.71 
 
 
577 aa  155  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1807  arginyl-tRNA synthetase  24.22 
 
 
576 aa  156  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.426497  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0269  arginyl-tRNA synthetase  24.34 
 
 
576 aa  156  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2124  arginyl-tRNA synthetase  26.2 
 
 
577 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  hitchhiker  0.0000003636 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01836  hypothetical protein  24.47 
 
 
577 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>