More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0271 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2213  arginyl-tRNA synthetase  67.82 
 
 		 555 aa  778    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0288  arginyl-tRNA synthetase  65.3 
 
 		 559 aa  734    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.124809 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2837  arginyl-tRNA synthetase  62.37 
 
 		 555 aa  724    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0222286 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0271  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 558 aa  1154    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1508  arginyl-tRNA synthetase  60.47 
 
 		 558 aa  689    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.818041  normal  0.873479 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0216  arginyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 		 558 aa  538  9.999999999999999e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1008  arginyl-tRNA synthetase  50.46 
 
 		 569 aa  514  1e-144  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1739  arginyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 567 aa  504  1e-141  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1102  arginyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 		 574 aa  409  1e-113  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0568  arginyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 566 aa  394  1e-108  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.078202  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0350  arginyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 		 569 aa  394  1e-108  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1633  arginyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 		 566 aa  385  1e-106  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0268  arginyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 566 aa  382  1e-105  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.107833  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3171  arginyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 595 aa  381  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2012  arginyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 583 aa  371  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.750372  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1291  arginyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 		 591 aa  365  1e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.456077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1420  arginyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 		 600 aa  361  2e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.435817  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0562  arginyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 		 550 aa  343  5e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0169  arginyl-tRNA synthetase  36.62 
 
 		 602 aa  336  5.999999999999999e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0564  arginyl-tRNA synthetase  32.02 
 
 		 635 aa  262  1e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1715  arginyl-tRNA synthetase  31.26 
 
 		 619 aa  248  1e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0438  arginyl-tRNA synthetase  31.39 
 
 		 601 aa  244  3e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1017  arginyl-tRNA synthetase  32.28 
 
 		 630 aa  242  1e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.341311 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2451  arginyl-tRNA synthetase  30.14 
 
 		 612 aa  240  5e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0329  arginyl-tRNA synthetase  31.66 
 
 		 613 aa  238  2e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1036  arginyl-tRNA synthetase  30.51 
 
 		 628 aa  234  3e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475054 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1577  arginyl-tRNA synthetase  31.17 
 
 		 635 aa  233  5e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502048  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1846  arginyl-tRNA synthetase  30.44 
 
 		 625 aa  231  2e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0586  arginyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 		 632 aa  229  1e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000562405 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  29.83 
 
 		 566 aa  226  7e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1756  arginyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 		 630 aa  226  1e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0324309  hitchhiker  0.00414873 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0186  arginyl-tRNA synthetase  30.37 
 
 		 597 aa  223  6e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0686  arginyl-tRNA synthetase  29.65 
 
 		 628 aa  219  1e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  30.05 
 
 		 562 aa  215  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  30.48 
 
 		 565 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0441  arginyl-tRNA synthetase  30.43 
 
 		 629 aa  215  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  27.94 
 
 		 563 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  30.48 
 
 		 565 aa  213  7.999999999999999e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0039  arginyl-tRNA synthetase  30.16 
 
 		 599 aa  207  6e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285018  normal  0.0776701 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  28.47 
 
 		 590 aa  204  3e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2318  arginyl-tRNA synthetase  27.81 
 
 		 593 aa  204  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.291854 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0109  arginyl-tRNA synthetase  30.05 
 
 		 562 aa  203  6e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0124  arginyl-tRNA synthetase  30.2 
 
 		 562 aa  202  9e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  29.78 
 
 		 568 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0096  arginyl-tRNA synthetase  29.2 
 
 		 602 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2304  arginyl-tRNA synthetase  29.5 
 
 		 561 aa  199  9e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0307018  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0267  arginyl-tRNA synthetase  27.3 
 
 		 597 aa  199  1.0000000000000001e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  30.02 
 
 		 562 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  30.02 
 
 		 562 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  30.02 
 
 		 562 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0405  arginyl-tRNA synthetase  29.23 
 
 		 542 aa  198  2.0000000000000003e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  29.68 
 
 		 562 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  28.49 
 
 		 551 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  29.52 
 
 		 553 aa  197  3e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0410  arginyl-tRNA synthetase  31.93 
 
 		 594 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0084  arginyl-tRNA synthetase  31.93 
 
 		 594 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.72933  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1997  arginyl-tRNA synthetase  31.93 
 
 		 594 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0592  arginyl-tRNA synthetase  31.93 
 
 		 594 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597736  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0430  arginyl-tRNA synthetase  31.93 
 
 		 594 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2291  arginyl-tRNA synthetase  31.93 
 
 		 594 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3099  arginyl-tRNA synthetase  31.93 
 
 		 594 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  29.06 
 
 		 562 aa  198  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0820  arginyl-tRNA synthetase  29.91 
 
 		 561 aa  197  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0474084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  29.59 
 
 		 562 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  30.12 
 
 		 584 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  28.26 
 
 		 556 aa  197  6e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  29.66 
 
 		 562 aa  196  7e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  29.84 
 
 		 562 aa  196  9e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0127  arginyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 595 aa  196  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  27.24 
 
 		 566 aa  195  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  27.98 
 
 		 589 aa  195  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  28.67 
 
 		 589 aa  195  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0077  arginyl-tRNA synthetase  28.83 
 
 		 586 aa  195  2e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1659  arginyl-tRNA synthetase  31.1 
 
 		 543 aa  195  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.826444  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02918  arginyl-tRNA synthetase  30.92 
 
 		 562 aa  195  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  25.83 
 
 		 564 aa  195  2e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2109  arginyl-tRNA synthetase  28.83 
 
 		 592 aa  194  3e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.513959  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2169  arginyl-tRNA synthetase  26.87 
 
 		 585 aa  194  3e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1686  arginyl-tRNA synthetase  28.88 
 
 		 575 aa  194  4e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  28.93 
 
 		 556 aa  194  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0355  arginyl-tRNA synthetase  30.86 
 
 		 594 aa  193  7e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  28.7 
 
 		 556 aa  193  8e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  28.88 
 
 		 556 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  28.7 
 
 		 556 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  28.7 
 
 		 556 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  28.7 
 
 		 556 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  29.42 
 
 		 554 aa  192  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  30.17 
 
 		 570 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  29.15 
 
 		 553 aa  192  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  29.15 
 
 		 553 aa  192  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0188  arginyl-tRNA synthetase  29.48 
 
 		 594 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  27.88 
 
 		 563 aa  191  2e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2678  arginyl-tRNA synthetase  27.83 
 
 		 592 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  28.7 
 
 		 556 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  28.7 
 
 		 556 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  28.7 
 
 		 556 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1434  arginyl-tRNA synthetase  30.26 
 
 		 569 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0988806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  28.49 
 
 		 559 aa  191  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  28.7 
 
 		 556 aa  190  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 		 562 aa  189  9e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>