More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3171 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0169  arginyl-tRNA synthetase  72.8 
 
 
602 aa  815    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3171  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
595 aa  1190    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1291  arginyl-tRNA synthetase  73.49 
 
 
591 aa  838    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.456077  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1420  arginyl-tRNA synthetase  85 
 
 
600 aa  935    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.435817  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2012  arginyl-tRNA synthetase  71.62 
 
 
583 aa  802    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.750372  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1008  arginyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 
569 aa  419  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1739  arginyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 
567 aa  409  1e-113  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2213  arginyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 
555 aa  397  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1508  arginyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 
558 aa  398  1e-109  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.818041  normal  0.873479 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2837  arginyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 
555 aa  393  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0222286 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0271  arginyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 
558 aa  389  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0216  arginyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 
558 aa  386  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1102  arginyl-tRNA synthetase  35.25 
 
 
574 aa  365  1e-100  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0288  arginyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 
559 aa  365  2e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.124809 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0568  arginyl-tRNA synthetase  36.66 
 
 
566 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.078202  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1633  arginyl-tRNA synthetase  36.32 
 
 
566 aa  353  5.9999999999999994e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0268  arginyl-tRNA synthetase  35.98 
 
 
566 aa  348  1e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.107833  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0562  arginyl-tRNA synthetase  36.87 
 
 
550 aa  337  2.9999999999999997e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0350  arginyl-tRNA synthetase  35.08 
 
 
569 aa  331  2e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0564  arginyl-tRNA synthetase  31.62 
 
 
635 aa  249  7e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  30.29 
 
 
566 aa  241  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0438  arginyl-tRNA synthetase  31.31 
 
 
601 aa  238  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4135  arginyl-tRNA synthetase  32.36 
 
 
591 aa  233  6e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  30.33 
 
 
562 aa  226  8e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  29.02 
 
 
553 aa  225  1e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1017  arginyl-tRNA synthetase  28.31 
 
 
630 aa  225  2e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.341311 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  29.69 
 
 
556 aa  224  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1577  arginyl-tRNA synthetase  31.36 
 
 
635 aa  224  4e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502048  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  30.24 
 
 
589 aa  224  4.9999999999999996e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  29.91 
 
 
562 aa  223  6e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  29.85 
 
 
556 aa  223  7e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  29.91 
 
 
562 aa  223  8e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  29.53 
 
 
556 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  29.74 
 
 
562 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  29.53 
 
 
556 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  30.08 
 
 
589 aa  223  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  29.53 
 
 
556 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1577  arginyl-tRNA synthetase  27.71 
 
 
621 aa  222  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.879493  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  29.53 
 
 
556 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  29.71 
 
 
553 aa  222  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  29.71 
 
 
553 aa  222  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  29.64 
 
 
565 aa  222  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0586  arginyl-tRNA synthetase  29.82 
 
 
632 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000562405 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0441  arginyl-tRNA synthetase  31.23 
 
 
629 aa  221  3e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  30.09 
 
 
562 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  29.53 
 
 
556 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  30.09 
 
 
562 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  29.53 
 
 
556 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  29.64 
 
 
562 aa  219  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2451  arginyl-tRNA synthetase  31.03 
 
 
612 aa  218  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1756  arginyl-tRNA synthetase  31.11 
 
 
630 aa  218  2e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0324309  hitchhiker  0.00414873 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  30.76 
 
 
574 aa  219  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  29.46 
 
 
565 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  29.49 
 
 
556 aa  218  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  29.64 
 
 
562 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  27.57 
 
 
566 aa  217  4e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  29.39 
 
 
562 aa  217  5e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0632  arginyl-tRNA synthetase  31.63 
 
 
564 aa  216  7e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0686  arginyl-tRNA synthetase  26.83 
 
 
628 aa  216  8e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  29.19 
 
 
590 aa  216  8e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  29.16 
 
 
556 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2678  arginyl-tRNA synthetase  28.4 
 
 
592 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1036  arginyl-tRNA synthetase  28.24 
 
 
628 aa  214  2.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475054 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2318  arginyl-tRNA synthetase  27.15 
 
 
593 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.291854 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  28.78 
 
 
570 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1715  arginyl-tRNA synthetase  29.56 
 
 
619 aa  212  1e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  28.55 
 
 
556 aa  212  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1935  arginyl-tRNA synthetase  28.76 
 
 
564 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000950947  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  29.51 
 
 
564 aa  212  2e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  28.17 
 
 
565 aa  211  3e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  30.61 
 
 
586 aa  211  3e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2487  arginyl-tRNA synthetase  27.57 
 
 
553 aa  208  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.619732  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  28.65 
 
 
563 aa  209  2e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  27.89 
 
 
563 aa  207  4e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0529  arginyl-tRNA synthetase  29.06 
 
 
614 aa  207  4e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000661895 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  29.64 
 
 
559 aa  207  6e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0039  arginyl-tRNA synthetase  28.85 
 
 
599 aa  206  8e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285018  normal  0.0776701 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1846  arginyl-tRNA synthetase  27.54 
 
 
625 aa  206  1e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0285  arginyl-tRNA synthetase  28.01 
 
 
564 aa  206  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0318968  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0329  arginyl-tRNA synthetase  29.26 
 
 
613 aa  205  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  29.86 
 
 
561 aa  205  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2456  arginyl-tRNA synthetase  30.94 
 
 
598 aa  204  3e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0188  arginyl-tRNA synthetase  30.13 
 
 
594 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.826253  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  29.84 
 
 
551 aa  204  4e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  30.56 
 
 
640 aa  204  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02786  arginyl-tRNA synthetase  28.67 
 
 
576 aa  203  6e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  28.69 
 
 
551 aa  203  7e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0050  arginyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 
564 aa  203  8e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2484  arginyl-tRNA synthetase  27.95 
 
 
551 aa  203  8e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00470527  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1654  arginyl-tRNA synthetase  27.84 
 
 
549 aa  203  9e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0671403  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05910  arginyl-tRNA synthetase  27.51 
 
 
592 aa  202  9.999999999999999e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  30.89 
 
 
551 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1309  arginyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 
613 aa  202  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.925397  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  30.69 
 
 
562 aa  201  3.9999999999999996e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1270  arginyl-tRNA synthetase  28.55 
 
 
562 aa  200  6e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000463651  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0198  arginyl-tRNA synthetase  29.15 
 
 
592 aa  199  7.999999999999999e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2410  arginyl-tRNA synthetase  31.42 
 
 
560 aa  199  7.999999999999999e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000917803  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  28.2 
 
 
556 aa  199  9e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0612  arginyl-tRNA synthetase  29.97 
 
 
562 aa  199  9e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.954769  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0145  arginyl-tRNA synthetase  30.9 
 
 
596 aa  199  9e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>