More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1577 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2318  arginyl-tRNA synthetase  58.68 
 
 		 593 aa  692    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.291854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0039  arginyl-tRNA synthetase  56.53 
 
 		 599 aa  692    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285018  normal  0.0776701 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1577  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 621 aa  1279    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.879493  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0251  arginyl-tRNA synthetase  55.24 
 
 		 592 aa  644    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2678  arginyl-tRNA synthetase  60.37 
 
 		 592 aa  731    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05910  arginyl-tRNA synthetase  58.36 
 
 		 592 aa  683    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0599  arginyl-tRNA synthetase  57.17 
 
 		 596 aa  719    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0186  arginyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 		 597 aa  675    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0267  arginyl-tRNA synthetase  53.47 
 
 		 597 aa  633  1e-180  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6433  arginyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 642 aa  620  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.490682  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 590 aa  464  1e-129  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0607  arginyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 585 aa  367  1e-100  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.872641  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0438  arginyl-tRNA synthetase  33.02 
 
 		 601 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  30.5 
 
 		 562 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  28.5 
 
 		 574 aa  258  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  30.5 
 
 		 562 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  30.17 
 
 		 562 aa  257  5e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  30.17 
 
 		 562 aa  257  5e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  30.45 
 
 		 562 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  30.12 
 
 		 562 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  29.03 
 
 		 640 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1535  arginyl-tRNA synthetase  29.84 
 
 		 624 aa  254  4.0000000000000004e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  29.5 
 
 		 562 aa  252  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  29.22 
 
 		 562 aa  251  3e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  31.42 
 
 		 564 aa  251  3e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  29.5 
 
 		 562 aa  249  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1620  arginyl-tRNA synthetase  29.26 
 
 		 562 aa  246  8e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010963  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1309  arginyl-tRNA synthetase  30.12 
 
 		 613 aa  244  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.925397  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0899  arginyl-tRNA synthetase  30.05 
 
 		 566 aa  242  1e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0249713  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  29.38 
 
 		 565 aa  240  5e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0466  arginyl-tRNA synthetase  30.38 
 
 		 564 aa  240  6.999999999999999e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.795792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  29.07 
 
 		 563 aa  236  7e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0564  arginyl-tRNA synthetase  28.88 
 
 		 635 aa  236  7e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  28.31 
 
 		 565 aa  236  8e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  28.97 
 
 		 563 aa  234  3e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  28.31 
 
 		 565 aa  234  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  28.03 
 
 		 566 aa  234  5e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1215  arginyl-tRNA synthetase  29.29 
 
 		 563 aa  233  7.000000000000001e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  27.45 
 
 		 566 aa  231  3e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0562  arginyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 		 550 aa  224  4e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  28.33 
 
 		 565 aa  224  4.9999999999999996e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2236  arginyl-tRNA synthetase  31 
 
 		 433 aa  221  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000339277  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1270  arginyl-tRNA synthetase  29.38 
 
 		 562 aa  220  5e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000463651  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4135  arginyl-tRNA synthetase  28.26 
 
 		 591 aa  220  6e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0329  arginyl-tRNA synthetase  29.16 
 
 		 613 aa  212  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2213  arginyl-tRNA synthetase  27.78 
 
 		 555 aa  212  2e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  27.78 
 
 		 571 aa  206  7e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1633  arginyl-tRNA synthetase  28.16 
 
 		 566 aa  206  1e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3171  arginyl-tRNA synthetase  27.07 
 
 		 595 aa  205  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2705  arginyl-tRNA synthetase  28.34 
 
 		 598 aa  204  4e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0169  arginyl-tRNA synthetase  28.24 
 
 		 602 aa  203  6e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0568  arginyl-tRNA synthetase  28.33 
 
 		 566 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.078202  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1291  arginyl-tRNA synthetase  28.79 
 
 		 591 aa  201  3e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.456077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1739  arginyl-tRNA synthetase  30.72 
 
 		 567 aa  201  5e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0268  arginyl-tRNA synthetase  28.38 
 
 		 566 aa  200  7e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.107833  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1420  arginyl-tRNA synthetase  28.43 
 
 		 600 aa  197  4.0000000000000005e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.435817  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2012  arginyl-tRNA synthetase  28.49 
 
 		 583 aa  195  2e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.750372  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0333  arginyl-tRNA synthetase  28.45 
 
 		 572 aa  194  5e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2451  arginyl-tRNA synthetase  27.06 
 
 		 612 aa  192  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1008  arginyl-tRNA synthetase  28.6 
 
 		 569 aa  189  9e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2837  arginyl-tRNA synthetase  26.5 
 
 		 555 aa  189  9e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0222286 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1508  arginyl-tRNA synthetase  27.51 
 
 		 558 aa  188  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.818041  normal  0.873479 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38727  arginyl-tRNA synthetase  26.19 
 
 		 603 aa  188  3e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.908762 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1102  arginyl-tRNA synthetase  27 
 
 		 574 aa  187  6e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0350  arginyl-tRNA synthetase  26.93 
 
 		 569 aa  187  7e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0288  arginyl-tRNA synthetase  27.86 
 
 		 559 aa  183  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.124809 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4133  arginyl-tRNA synthetase  25.72 
 
 		 576 aa  182  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0271  arginyl-tRNA synthetase  26.35 
 
 		 558 aa  182  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1017  arginyl-tRNA synthetase  27.67 
 
 		 630 aa  181  2.9999999999999997e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.341311 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0216  arginyl-tRNA synthetase  25.42 
 
 		 558 aa  179  9e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2169  arginyl-tRNA synthetase  24.64 
 
 		 585 aa  179  1e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3319  arginyl-tRNA synthetase  25.04 
 
 		 575 aa  179  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1338  arginyl-tRNA synthetase  27.32 
 
 		 660 aa  179  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3151  arginyl-tRNA synthetase  27.1 
 
 		 585 aa  178  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3474  arginyl-tRNA synthetase  25.3 
 
 		 580 aa  176  9e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387689  normal  0.108328 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0441  arginyl-tRNA synthetase  27.72 
 
 		 629 aa  176  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0269  arginyl-tRNA synthetase  26.38 
 
 		 576 aa  174  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0189  arginyl-tRNA synthetase  27.96 
 
 		 604 aa  174  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.177771  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2791  arginyl-tRNA synthetase  24.63 
 
 		 576 aa  174  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.263184 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0686  arginyl-tRNA synthetase  25.43 
 
 		 628 aa  171  3e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0542  arginyl-tRNA synthetase  28.27 
 
 		 585 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.475442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2108  arginyl-tRNA synthetase  25.28 
 
 		 577 aa  171  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0525  arginyl-tRNA synthetase  28.08 
 
 		 585 aa  171  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2155  arginyl-tRNA synthetase  24.96 
 
 		 576 aa  169  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0808745  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2043  arginyl-tRNA synthetase  24.96 
 
 		 576 aa  169  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1577  arginyl-tRNA synthetase  27.39 
 
 		 590 aa  169  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02051  arginyl-tRNA synthetase  27.64 
 
 		 604 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01310  arginine-tRNA ligase, putative  26.68 
 
 		 622 aa  168  2e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0173932  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2434  arginyl-tRNA synthetase  24.8 
 
 		 576 aa  169  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.035286 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02161  arginyl-tRNA synthetase  27.43 
 
 		 602 aa  169  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1036  arginyl-tRNA synthetase  25.69 
 
 		 628 aa  169  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475054 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1337  arginyl-tRNA synthetase  25.16 
 
 		 577 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014051 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2169  arginyl-tRNA synthetase  25.28 
 
 		 577 aa  169  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2379  arginyl-tRNA synthetase  26.48 
 
 		 579 aa  168  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222047  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1756  arginyl-tRNA synthetase  25.28 
 
 		 577 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2069  arginyl-tRNA synthetase  25.16 
 
 		 577 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205082 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3238  arginyl-tRNA synthetase  27.35 
 
 		 585 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2270  arginyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 576 aa  167  4e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1764  arginyl-tRNA synthetase  25.16 
 
 		 577 aa  167  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2442  arginyl-tRNA synthetase  24.47 
 
 		 577 aa  167  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>