More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1338 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1338  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 660 aa  1367    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3985  arginyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 		 585 aa  387  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8944  Arginine--tRNA ligase  35.53 
 
 		 584 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66750  arginyl-tRNA synthetase  35.63 
 
 		 587 aa  350  5e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36013  predicted protein  36.31 
 
 		 573 aa  349  1e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5788  arginyl-tRNA synthetase  35.78 
 
 		 587 aa  347  5e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  33.86 
 
 		 571 aa  330  7e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45360  arginyl-tRNA synthetase  35.15 
 
 		 579 aa  326  9e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621239  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 		 640 aa  325  2e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2613  arginyl-tRNA synthetase  33.73 
 
 		 577 aa  317  3e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253751 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01847  arginyl-tRNA synthetase  33.73 
 
 		 577 aa  316  9e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1764  arginyl-tRNA synthetase  33.73 
 
 		 577 aa  316  9e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01836  hypothetical protein  33.73 
 
 		 577 aa  316  9e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1310  arginyl-tRNA synthetase  33.73 
 
 		 577 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363287 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1971  arginyl-tRNA synthetase  33.43 
 
 		 577 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1756  arginyl-tRNA synthetase  33.58 
 
 		 577 aa  314  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3671  arginyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 585 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2043  arginyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 576 aa  314  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2169  arginyl-tRNA synthetase  33.43 
 
 		 577 aa  313  5.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2155  arginyl-tRNA synthetase  33.19 
 
 		 576 aa  313  9e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0808745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2434  arginyl-tRNA synthetase  33.19 
 
 		 576 aa  312  1e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.035286 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1577  arginyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 		 590 aa  311  2e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3319  arginyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 575 aa  306  7e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1309  arginyl-tRNA synthetase  33.49 
 
 		 613 aa  304  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.925397  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2169  arginyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 		 585 aa  302  1e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3238  arginyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 585 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0269  arginyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 576 aa  301  3e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0189  arginyl-tRNA synthetase  32.58 
 
 		 604 aa  300  7e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.177771  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3561  arginyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 588 aa  298  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515123 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2060  arginyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 585 aa  296  8e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.571937  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0525  arginyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 585 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0542  arginyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 585 aa  288  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.475442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0535  arginyl-tRNA synthetase  32.67 
 
 		 579 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.607806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5574  arginyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 		 619 aa  285  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.469409  normal  0.593378 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0630  arginyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 593 aa  285  2.0000000000000002e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3357  arginyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 		 581 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0006  arginyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 582 aa  284  4.0000000000000003e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0397  arginyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 579 aa  280  5e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4389  arginyl-tRNA synthetase  31.68 
 
 		 613 aa  280  5e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0276  arginyl-tRNA synthetase  29.39 
 
 		 578 aa  280  6e-74  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5138  arginyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 578 aa  280  8e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.447973  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1213  arginyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 577 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2124  arginyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 577 aa  278  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  hitchhiker  0.0000003636 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2064  arginyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 577 aa  277  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.10003 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2069  arginyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 577 aa  277  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205082 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0443  arginyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 581 aa  276  8e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1359  arginyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 578 aa  276  9e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1337  arginyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 577 aa  276  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014051 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1661  arginyl-tRNA synthetase  37.44 
 
 		 599 aa  276  9e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4156  arginyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 581 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.204707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0550  arginyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 581 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259334  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4134  arginyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 		 577 aa  274  4.0000000000000004e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440291  hitchhiker  0.000000042149 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0955  arginyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 		 577 aa  274  4.0000000000000004e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0399  arginyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 578 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2442  arginyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 577 aa  273  5.000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2705  arginyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 598 aa  273  7e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01368  arginyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 		 577 aa  273  7e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004100  arginyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 		 577 aa  273  9e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000862961  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5089  arginyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 578 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0474  arginyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 581 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3845  arginyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 581 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0495  arginyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 581 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0498  arginyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 581 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2108  arginyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 577 aa  272  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4962  arginyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 		 578 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3151  arginyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 585 aa  269  8.999999999999999e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5139  arginyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 578 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2084  arginyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 		 576 aa  269  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1807  arginyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 576 aa  269  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.426497  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2791  arginyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 576 aa  268  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.263184 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02051  arginyl-tRNA synthetase  39.74 
 
 		 603 aa  267  5e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0376  arginyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 578 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3673  arginyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 581 aa  266  8e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0456  arginyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 581 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2379  arginyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 		 579 aa  266  1e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222047  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3496  arginyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 581 aa  266  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2270  arginyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 		 576 aa  265  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2566  arginyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 		 590 aa  265  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02786  arginyl-tRNA synthetase  40.26 
 
 		 576 aa  264  4e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2173  arginyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 576 aa  264  4e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0333  arginyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 		 572 aa  264  4e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3277  arginyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 570 aa  264  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.431918  normal  0.529534 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4123  arginyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 581 aa  263  6e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3956  arginyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 574 aa  261  3e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 574 aa  261  3e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3762  arginyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 581 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0761225  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4427  arginyl-tRNA synthetase  39.25 
 
 		 581 aa  259  8e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2134  arginyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 		 590 aa  259  1e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06550  arginyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 588 aa  259  1e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.386576  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2110  arginyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 		 577 aa  258  3e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.102153  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0378  arginyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 581 aa  256  6e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0739  arginyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 		 563 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1110  arginyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 		 582 aa  253  8.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0533  arginyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 581 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.142076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3779  arginyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 		 581 aa  253  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.580214  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27471  arginyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 603 aa  251  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.471612 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1554  arginyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 		 607 aa  251  4e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02621  arginyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 607 aa  250  5e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0249545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2451  arginyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 590 aa  246  9.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0146  arginyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 572 aa  241  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>